JRK

Pre-clinical SELEX library

Organism
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R1,R4
Sequences indexed
10,000

Top enriched sequences

More via API →
Sequence Length log2 FC P(active) Class Monotonicity
TCCGGATGCCCGAGGCAGAAGGATGTTTGACCTCCGGATAAGCGAGGC
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:6e3cfc552d32
48 15.01 0.60 strong_positive 1.00
GGCGTCGATCCGGATGCCCGAGGCAGAAGGATGTTTGACCTCCGGATAAGCGAGGCGCTG
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:54a67de2ac67
60 14.87 0.59 strong_positive 1.00
AGCGCCTCGCTTATCCGGAGGTCAAACATCCTTCTGCCTCGGGCATCCGGATCGACAGAT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:79822c6e426f
60 14.72 0.58 strong_positive 1.00
CCGGATGCCCGAGGCAGAAGGATGTTTGACCTCCGGATAAGCGAGGCGC
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:6aed8a55012b
49 14.64 0.60 strong_positive 1.00
AGCGCCTCGCTTATCCGGAGGTCAAACATCCTTCTGCCTCGGGCATCCGG
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:34102a944dc6
50 14.37 0.58 strong_positive 1.00
CCATTATCCGGAAGTGAGATCTGACATCCCCCATTATCCGGAAG
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:0ac1c2fd0f79
44 14.30 0.59 strong_positive 1.00
TCCGGATGCCCGAGGCAGAAGGATGTTTGACCTCCGGATAAGCGAGGCG
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:bd83888dbedb
49 14.28 0.60 strong_positive 1.00
TCCGGATGCCCGAGGCAGAAGGATGTTTGACCTCCGGATAAGCGAGGCGCT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:7235dd318120
51 14.25 0.60 strong_positive 1.00
GCCTCGCTTATCCGGAGGTCAAACATCCTTCTGCCTCGGGCATCCGGATCGACGCCGGAC
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:09b396f749fe
60 14.11 0.58 strong_positive 1.00
ATGCACAGCAGCGCCTCGCTTATCCGGA
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:2965bfacbaea
28 14.03 0.59 strong_positive 1.00
ACTGGAGAGGGAGGGAGGGAGGTGAAGCATTTGCTTCAATTATCCGGA
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:850d63cb70f9
48 13.98 0.57 strong_positive 1.00
CTAAACATTCTGGTTAATTGAGGTTTCAGTGTAGTGTGCTTCAGT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:d9cc72f93bbc
45 13.71 0.41 strong_positive 1.00
GTTGACACCTCACCTATCTGGAATTCAGCTATCCAGCGCCCTCATCTATCCGGAACAGAT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:12b1159ce704
60 13.68 0.60 strong_positive 1.00
GTCGCAATCCTCAGACCCTCCCGCGCTCCAGTTCCGGATAAGCGAGTATAAGCCGCTGAA
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:245b67008d2b
60 13.64 0.60 strong_positive 1.00
ACCGATGCAGCCCGGAATGAATGCACAGCAGCGCCTCGCTTATCCGGAGGTCAAACATC
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:c6fdd19cfff3
59 13.63 0.57 strong_positive 1.00
ACCTCACCTATCTGGAATTCAGCTATCCAGCGCCCTCATCTATCCGGAACAC
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:0c565a228e42
52 13.62 0.61 strong_positive 1.00
CCCTCGCGTAACCGGCTGCTCTCCACGCCCTACCCTCGCGTAACCGGC
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:1a549380ed12
48 13.58 0.58 strong_positive 1.00
GTTATTGTCAAACCTCATTTAACCGGAATGCTTTGGACA
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:29c0b0cfc7ee
39 13.58 0.42 strong_positive 1.00
GATAAGCTTCAGTTATCCGGAAAGCTCATTGCATT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:9c8355e1c58c
35 13.53 0.58 strong_positive 1.00
ATTCCGGTTAATTCCATTCCATTCCATTCGATTAACCGGAAT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:2064f4b38f12
42 13.51 0.43 strong_positive 1.00
GTTATTGTCAAACCTCATTTAACCGGAATGCTTTGGACAAC
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:f2f4e9859ddb
41 13.49 0.41 strong_positive 1.00
ATTATCCGGAAGTGAGATCTGACATCCCCCATTATCCGGAAG
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:4d5b94e64b94
42 13.47 0.60 strong_positive 1.00
ATTCCAGATAGCCGAGGGCCCACGCAGTGTTCTGGATAAGCGGGGG
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:656bcbfd81a4
46 13.47 0.60 strong_positive 1.00
ACTTCCGGATAATGGGGGATGTCAGATCTCACTTCCGGATAATGGGGGGA
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:b1594c3f423b
50 13.42 0.60 strong_positive 1.00
GTCGATCCGGATGCCCGAGGCAGAAGGATGTTTGACCTCCGGATAAGCGAGGCGCTAGAT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:841a72dd1ee7
60 13.41 0.60 strong_positive 1.00
TCCGGATGCCCGAGGCAGAAGGATGTTTGACCTCCGGATAAGCGAGGCGCTGCTGTAGAT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:5542d4758db4
60 13.40 0.60 strong_positive 1.00
ATTCCAGATAGCCGAGGGCCCACGCAGTGTTCTGGATAAGCGGGG
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:fb6d702a5cb2
45 13.36 0.60 strong_positive 1.00
GTTCCGGATAGATGAGGGCGCTGGATAGCTGAATTCCAGATAGGTGAGGTGTCAACAGAT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:004e5fcf34b6
60 13.32 0.60 strong_positive 1.00
CCGGATGCCCGAGGCAGAAGGATGTTTGACCTCCGGATAAGCGAGGCGCTGC
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:fe461179e1fd
52 13.29 0.59 strong_positive 1.00
TCCTCAGTTATCCGGAAACTTCAGCCACC
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:3c5356e006dc
29 13.25 0.59 strong_positive 1.00
ACTTCCGGATAATGGGGGATGTCAGATCTCACTTCCGGATAATGG
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:1d5f86f490c7
45 13.24 0.60 strong_positive 1.00
TGTTATTGTCAAACCTCATTTAACCGGAATGCTTT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:fa863ce99710
35 13.23 0.41 strong_positive 1.00
CTTCACTTATCCAGAAAAGTCCCTCTTGTTCCAGATAAGTGAGGTGTT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:7802a7d837ab
48 13.23 0.59 strong_positive 1.00
GTCAAACCTCATTTAACCGGAATGCTTTGG
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:43abffb8d4c1
30 13.20 0.44 strong_positive 1.00
CCTCAGTTATCCGGAAACTTCAGCCACC
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:6f62185226da
28 13.20 0.58 strong_positive 1.00
TCCGGATGCCCGAGGCAGAAGGATGTTTGACCTCCGGATAAGCGAG
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:587657822d0b
46 13.18 0.59 strong_positive 1.00
AACACCTCACTTATCTGGAACAAGAGGGACTTTTCTGGATAAGTGAAG
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:dfe92cc40fa9
48 13.15 0.59 strong_positive 1.00
TTGTGTTATTGTCAAACCTCATTTAACCGGAATGCTT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:b040ddc7671d
37 13.09 0.40 strong_positive 1.00
GTGTTCCGGATAGATGAGGGCGCTGGATAGCTGAATTCCAGATAGGTGAGGTGTCAACT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:cb6d576473c7
59 13.08 0.60 strong_positive 1.00
TCCGGATAATTGAAGCAAATGCTTCACCTCCCTCCCTCCCTCTCCAGT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:7940e234fffe
48 13.05 0.55 strong_positive 1.00
TTCACTTCACTTATCCAGAAAAGTCCCTCTTGTTCCAGATAAGTGAGGT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:9206ac859d37
49 13.05 0.59 strong_positive 1.00
GATAAGCTTCAGTTATCCGGAAAGCTCATTGCATTCAG
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:9d6665acf9c3
38 13.05 0.57 strong_positive 1.00
ACCTCACTTATCTGGAACAAGAGGGACTTTTCTGGATAAGTGAAGTGA
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:52d0d824445f
48 13.05 0.60 strong_positive 1.00
TCCGGATAAGCGAGGCGCTGCTGTGCAT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:93912e3c0e49
28 12.99 0.59 strong_positive 1.00
GTCAAACCTCATTTAACCGGAATGCTTTGGACAAC
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:b2cb23e28b2f
35 12.97 0.44 strong_positive 1.00
GCCTCGCTTATCCGGAGGTCAAACATCCTTCTGCCTCGGGCATCCGGA
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:9bc0436b6437
48 12.96 0.58 strong_positive 1.00
GATAAGCTTCAGTTATCCGGAAAGCTCATT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:7bd342133b69
30 12.96 0.59 strong_positive 1.00
GTTATTGTCAAACCTCATTTAACCGGAATGCTTT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:56d110943339
34 12.96 0.41 strong_positive 1.00
GATAAGCTTCAGTTATCCGGAAAGCTCATTGC
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:c86934e28cdc
32 12.94 0.58 strong_positive 1.00
CCCCGCTTATCCAGAACACTGCGTGGGCCCTCGGCTATCTGGAAT
PANAPTA:O75564:JRK:PRJEB76622:R4:3149f055d5b7
45 12.93 0.60 strong_positive 1.00

SELEX rounds

R1 R4 ·final

Structural & language-model features

JSON ↗

Pre-computed feature catalog (paths only — files served separately).

Residues
556
FASTA
ESM-2 mean
ESM-2 per-residue