MEF2D_SHOX
CAP-SELEX sample SHOX_MEF2D · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GCGTACCATATTAGGTAACCATCCGATAGGTGACACGACT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:e6f42e708944
|
40 | — | — | — |
|
GCTACCTAATTAGGTAAGTGATCCATAATTAGAACGCATT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:08a5d8e9bff4
|
40 | — | — | — |
|
CGCGCCTATAATAGTGGGATGCGTGATCCTAATAAGGAAA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:520943a26403
|
40 | — | — | — |
|
CTAAATTGAGCACATAATCACCTAATCGGGATACTAATTA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:47057a836d12
|
40 | — | — | — |
|
ACCTAGATCGATTCCTGATTAGGTAATTGATTAGCCTAAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:3bdde8384263
|
40 | — | — | — |
|
TTCCGAAAAAGGAAATAAACCGCAAAACGTGTTTCCATAA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:a1ad8fdd4e41
|
40 | — | — | — |
|
CAAATACTACACTTTCCATAATTAGATTAAAGTGCCAAAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:2e408ce99783
|
40 | — | — | — |
|
CATTGATCCTATTTAGTCCTCTACCCAAAACGGTAACGCG
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:d5f55a4cc7f7
|
40 | — | — | — |
|
CAATGAGTCCTAATTGGGCAAATAAACCATTATGCCTAAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:6adbd9304e7a
|
40 | — | — | — |
|
CATGCCTATTACGTAATTAGTTGCATTAAAGGAACCATAA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:d6c0ad4b31d4
|
40 | — | — | — |
|
ATTCCCTAAATAGATCCTTGATTCGATAATGTAGCCATAA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:c733cb77a79e
|
40 | — | — | — |
|
ATGATTAAAGCCAAATTAGGATTATTACTAAATGCCAAAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:83b384e554af
|
40 | — | — | — |
|
GCGAATTCCAAATAAGATTTGTGGACCATATGTTACATTA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:63deaf3be95f
|
40 | — | — | — |
|
CCCAACTGTGACAGATTCGGCCCGGAAACATATGGTGAAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:d7d7fced84d2
|
40 | — | — | — |
|
CAAGTGCTAAAAACGGAACAGCTGTTTTACACTCGCGCAC
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:17fca4c2fe34
|
40 | — | — | — |
|
TTACCATAATCAGATTATTGCATGGGTAAGTGACCCAAAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:82f612bfbf19
|
40 | — | — | — |
|
AGGTAATGTAATTAACAGAGCCTAATATATGTTACCATAA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:dfe1719feb87
|
40 | — | — | — |
|
ATTAGGTGCCGAATTAGGCCGTACAAAATTGGTCATTAAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:07af6bee0fb5
|
40 | — | — | — |
|
GTGCCTAATATGGTTTTTGTATATTCTGACCATATGGATA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:0503ca76e007
|
40 | — | — | — |
|
TACAGATTAGGAACTTGTTAGGCTAATTATGGCCCTATAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:48eaa6688381
|
40 | — | — | — |
|
TTTCCTAAATAGGCTCGTAATCAACTTACCATATTAGTAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:09cedf59f26b
|
40 | — | — | — |
|
CTAATAAATTGATCTCGATTAGGGTTAATCATGTACCTAA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:f95e8fbb076e
|
40 | — | — | — |
|
GAGCCAAATTGGGAAGCACAATTTACCAATTAAGCAATGG
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:c1f829ac25c8
|
40 | — | — | — |
|
TTTACGAACTGCCTAATTAGGACCTGCGTAATTACTATAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:ca04e535aeef
|
40 | — | — | — |
|
CGTCGAATAAAGCCAATTAAGTTATAACAGATTTCCTAAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:17391d5ae386
|
40 | — | — | — |
|
CGGTCTAAATTTGGAATGTACTTAACCCTAATTTGGCAAC
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:445e0b826d8a
|
40 | — | — | — |
|
GCGACTAATTGGTACCACAAATTACGATAATCAGCTAAAA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:e86bcf4007b5
|
40 | — | — | — |
|
AGCCAAATTGGTCTCATTAACTAATTATGCCCATTGTCCA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:3283e93834b7
|
40 | — | — | — |
|
TTGCTACAAGAGAGTCCTAATTAGGAAATTATGAGCCTAA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:ef39afdb6626
|
40 | — | — | — |
|
TTACCAAATTGGGATATTATGCACTAAATAGGTTGCATAG
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:cd595f4f4c23
|
40 | — | — | — |
|
CTGGATTAGGACCCTTAATGTTAATTGAATCATCCCTAAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:c2f51504d1ca
|
40 | — | — | — |
|
TTAACACCTTGGTCCGATTAAGGTAATTCCATTACCACAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:ddbabec9703b
|
40 | — | — | — |
|
AGCAACTCACACCCTTCCTCACCATATGGTACCCGTAATA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:532a5a0c4302
|
40 | — | — | — |
|
CAACGACTGCCTAATCCGTCTAAGACTCTAATTCAATTAA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:b07c66b7b9ad
|
40 | — | — | — |
|
TGCTTAATCAAGCTCTAATTGTTTCCAAAAACAGCACTAA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:1e56b7c84b43
|
40 | — | — | — |
|
CTTGCTTCCGAAGCCCGATATGGAAAGTGACGCGACGCAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:2cbb81b48a7c
|
40 | — | — | — |
|
TGTTCTTAAATTGGATTATCACCCAATAGCCTATTATGGG
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:cc44af2a6ccd
|
40 | — | — | — |
|
TGCTAACTGTACCCAATTATGGTAATAGGTATATCTCAAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:14231bda3b4d
|
40 | — | — | — |
|
AATTAAGACTTTGGCCAATTTAGGAAACCACTTTGCTTAA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:1546ee7a1c35
|
40 | — | — | — |
|
TGACGATCCGAATTAAGAAGATAATGAGACCGAATTAGGG
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:43035d7dc67a
|
40 | — | — | — |
|
GGCATAATTGCTCTATTAGGCAATTATGTTGCCAAATCCG
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:86e6c84dd45d
|
40 | — | — | — |
|
TTATACCAAATTAGGCTCCACCCAATTAGGAGATGTCTAA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:fcdbf66b6616
|
40 | — | — | — |
|
TTCGCTTAATGATCTAATTAAGGATGCTTGTTAGCCTAAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:0dab870476c3
|
40 | — | — | — |
|
GGACCAATTAAGAACAGCCTGTTTGCCATAATTGCATTAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:c9d6714e4336
|
40 | — | — | — |
|
CACTAGTCTGATGCCTAATTGGTCCCTATTATCCCAATTA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:7e7b995103e0
|
40 | — | — | — |
|
GTAATCAGTAAAGTTCCTAATTTAGTTGATTGTTCTATAA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:d937b6e79db5
|
40 | — | — | — |
|
TGACCCAATTAGGATCCATTGACTGTTTTGGTAATCTAAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:6faf129ed7d2
|
40 | — | — | — |
|
ATGCATAATGAGCACTAATGTAATTTACGATGTGCCAAAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:717b7fa4910c
|
40 | — | — | — |
|
CGACACATTAAGGTACCACTTATGGAATCATTAAATCAAT
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:35fcfc71fa64
|
40 | — | — | — |
|
AGATCAAATTGGGAATTAACGAGCCTAAATTGGAAATTGA
PANAPTA:Q14814:MEF2D_SHOX:PRJEB66722:R3:3f6ed5b4e9e9
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final