MEIS3_MSX1
CAP-SELEX sample MSX1_MEIS3 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GAGAGACAAATGAAGACAAACGGTTCCATGATGCGTTTAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:513227148f5c
|
40 | — | — | — |
|
GAACACGGTAGGGCGTAATCGTGGGTCCCTGTCTTGACGG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:5a8d2cda5aff
|
40 | — | — | — |
|
TCAATCAATGATATGTCAAAACCATGTCTGTAGCCGTGAT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:961f57b73f66
|
40 | — | — | — |
|
CGTGACAGCACTGTCGTCATGTGCCACGTTTTTGGCACGT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:35d4868bd0b2
|
40 | — | — | — |
|
GTGATAGTGTGCTAGCTAATTTGTCAACGGTAAGACAAAT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:832b53a297fd
|
40 | — | — | — |
|
GCATGTCTGTCATGGATCGTGACATGTAAGTGTCAAACTT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:cb1b6a625c5a
|
40 | — | — | — |
|
GAAAAATGTGACGTTTTCACTCATGATGTCACATCAGTAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:29d469051d9f
|
40 | — | — | — |
|
GTATGACAGATAAGCTATCAGCTACATCTCTCTTGTAGAG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:b4047c8cd362
|
40 | — | — | — |
|
GAGGCGAGATCAAGAAACTGTGTTCAAGAATGACAACCGT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:e7619010a79d
|
40 | — | — | — |
|
GTACCTTCATGTACCTGTCATTTCGCCCGAAATGACAGGT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:0a669f707b40
|
40 | — | — | — |
|
CACTCTGACTTATGACATCGAGTGTCAATGCTGTGCTGCT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:3133971aa924
|
40 | — | — | — |
|
TGCTGACAGTTGCCTGTCATCGATACTAAGTGTCAGGACG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:8bde789d72fd
|
40 | — | — | — |
|
AGTAAGTGAGCCATGCAATCGCACACTTTCATCATGACTT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:f6f580fa0ca1
|
40 | — | — | — |
|
TATGGTGACACAGTGCGACGTAGGGCCGAGCCTGTCACGC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:06195eead772
|
40 | — | — | — |
|
TAGGGCCGATGAACGCCCGTAATTTGACAAATGTCAGGAA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:852b505bfb59
|
40 | — | — | — |
|
CACGAACATTGACAAATAGCAAACGTGCTCAACGTAGGCT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:1878b2c01a20
|
40 | — | — | — |
|
TTAGGTGTTGGCTCCGCAATGATACGTCATGAAACTTGTC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:bb56c030b9dc
|
40 | — | — | — |
|
TGTCATTGATAATGGCGTTTTTGCTTGACATTGTAAAACG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:0644f16556d0
|
40 | — | — | — |
|
GTGTGTCAAATATGTTATCAGCTAAGTGACAGTTTGGAAA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:53d8ea77b6bc
|
40 | — | — | — |
|
GTAAATGAGGCAAATTGGGCCTGATCCCAATGTGTCACCG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:0c8e62e9dca4
|
40 | — | — | — |
|
TGACAACACCGTCGAGGCTTATGGCGGAATCGTGTTGTCG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:f37dfcf2f160
|
40 | — | — | — |
|
GATAATTGATTTGGCTCACGCAACTGTTGAGAACTAGTGA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:c96856d00567
|
40 | — | — | — |
|
TTTTCCCCTGATTACACGCCTTAGCTAATCACGACATCCC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:db9a689a160a
|
40 | — | — | — |
|
TCGCATCTGAGTGACCGTGCGTATTATCGGCTGTCACGCT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:f7406a4db22f
|
40 | — | — | — |
|
CAGTGGGCCCACTGACAAATTGATGCCAATTTGTCTCATC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:2700f4e89a97
|
40 | — | — | — |
|
GACTTTGTCGTGTCAGTCGTTTGACAATCTAGTGCTAACT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:2fdca27c9e81
|
40 | — | — | — |
|
TCATCACAGGCTGACTCTGACAGCTCTCGTGATTGACGAT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:0662e20b5923
|
40 | — | — | — |
|
GTGGGTGTCATGATAACGAGTCACGAATGACAGGGCAGTA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:d878d3db9559
|
40 | — | — | — |
|
GTTGACGTGTGTCAGTCGCGAGAAACTACTCCTACATCCC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:9c40cf06e366
|
40 | — | — | — |
|
CACCTTCCCCCTACGCACTCCTACCCGCACATCATTCCCC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:1f069f582e01
|
40 | — | — | — |
|
GTTTGTCATATACGGTTGTAACGTGACAGGCTGTCGCAAT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:9a07022268b3
|
40 | — | — | — |
|
CCTGTCGTCGAGACTGACGACCGATGACAGAAACGTGTGA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:4aef4e6ebdd3
|
40 | — | — | — |
|
TTGGGTAGACAAACCTTCTCATTGCCGCGCTGTCACGGGA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:46487a03ef97
|
40 | — | — | — |
|
GTATGACACTGTTCAACTATGATCTTACAGGTAGGAAAGC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:e513ce392ed4
|
40 | — | — | — |
|
GAAAATGCATACTTCTTAGCAAACACATGTCGATGTATTG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:5b3e6f705281
|
40 | — | — | — |
|
TTGACTTACTGTATTAGAGTTAATGTCAATTCACGACAAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:a4628662a368
|
40 | — | — | — |
|
TACTTATGATGAGAGATGTAGACAGACAGTGGCCAGGTTG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:08571ef96fd8
|
40 | — | — | — |
|
GTGACAACTCTCGCGCCCCCTGTCTCGTGCTGACACCTTC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:fc4dce5386ef
|
40 | — | — | — |
|
GTCAAGGCTGCCTCGACATGAACAAGTTGGCCTGTCACGA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:5f6576cd0fe6
|
40 | — | — | — |
|
AGCTGACATGCGGTCATGTCCTGTCATAAACAGTGCTGAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:ba2ea558975a
|
40 | — | — | — |
|
GTGCGTGACAGCAAAATGACGTTTGGATGTCAACGTTGGC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:8a54df4934ca
|
40 | — | — | — |
|
GCATCACGTATTGCGACCGTACCTCTCTTCTTCCTCCATA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:3fcc3a286862
|
40 | — | — | — |
|
TGCACAGATCGGTACACGTCCAGGTAAAGTACAACCAGCC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:aca861da5040
|
40 | — | — | — |
|
CACTGATTTTAGCCTGTGCTGACACATCGTCTTTTCCTCA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:66585d8223a0
|
40 | — | — | — |
|
TTCGAAATGACGAATCTACACGTTTTGACCGCATACTAAT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:56ec90f9d2ce
|
40 | — | — | — |
|
GTGTGACAGCGTAGTGCCTGTGCTACCGAACCTGTCATAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:0c32a79f120d
|
40 | — | — | — |
|
GTGATCAAACTGTCACTTTGCAAAGACGGCATTGGGAAGG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:06c30aaf10c9
|
40 | — | — | — |
|
CGGATGGTGACTATTCAGTTTTGACTATCTGCTGACAAAT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:a1ba33686940
|
40 | — | — | — |
|
GGCCTTGCCAATCAATTACAAGCTTATATTTGACAAACCA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:5a671e051a91
|
40 | — | — | — |
|
GCTAGACGTCCACGCGACCCACACCGAAGAATAGGCATAA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_MSX1:PRJEB66722:R3:284138739a51
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final