MEIS3_SOX9
CAP-SELEX sample SOX9_MEIS3 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CCTACACCATGACACGAGTGCTGACAATTGCAGTGTCTGA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:f1f7d5516926
|
40 | — | — | — |
|
TAAGTGACCGCACATCACCCTGACAATTACATTGTCACGC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:b7854c5d7091
|
40 | — | — | — |
|
ACAAGTAAAACAATTTCAGTGTCACGATCCGCGTCGAAAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:d042d0ff4054
|
40 | — | — | — |
|
CCATTACGTGACACTACAATTGTCACCGTCCGTCTTCAGG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:4b4f602e299a
|
40 | — | — | — |
|
TGATGACAATGCTAGTGTCAATCAAGCAACGCATTCGCAG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:dc1e2b68a950
|
40 | — | — | — |
|
CCATAGGGCTCGCCTTAGCGTGACAATGTCATTGTCAACA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:34718ad6f327
|
40 | — | — | — |
|
TCTCCTTATTACACAACGACAATGGTAGTGTCATTTGAGG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:a2147521d7f2
|
40 | — | — | — |
|
AGCTGTGCCGCGTTACGAGACAACCGGCAGTGTCACATAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:53e4dc56364b
|
40 | — | — | — |
|
TCGGAACATATGCGAGTTGCGACAATGGCAGTGTCACTTG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:527b69f012cc
|
40 | — | — | — |
|
TCACTTTTGCTCACAAACGGATCAATGAAATTGTCGGTAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:20ca62467553
|
40 | — | — | — |
|
GGACAATTGCAGTGGGTCCGACCTTCAATGCAGCAACTGT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:18647fbc1951
|
40 | — | — | — |
|
GGCGCCGGACTGCTTCGTGCTGACAATTGCGTTGTCCTTT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:b9e0ec7cba2e
|
40 | — | — | — |
|
ACATTGACACTGTTATTGTCACTCACACCCGTCGACCACC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:284c17a1fd66
|
40 | — | — | — |
|
TCTGTGCGCAATGTCCATTGGGGCATTAACTGGCACCTTA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:322405b9afd9
|
40 | — | — | — |
|
AGTCCTGACAATGGTAGTGTCACTGACCGCTCAAGTCCTG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:91d4aade9c7d
|
40 | — | — | — |
|
CTTGCCCGTAGTGCATTCTGACAATTGCAGTGTCCAAGTG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:32b3c682c5a2
|
40 | — | — | — |
|
ACGCAACATGCGTCAGGTGTCAATTGCAGTGACAATCAAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:811b7ecbdc16
|
40 | — | — | — |
|
CGCTTTCGACAATGTTAGTGTCGTTGCCTACCCATTCCCG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:1e40b4629164
|
40 | — | — | — |
|
GTGCGACCGCGAGGTACATTGACAATTTCAGTGTCTCGAA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:6da530916ee9
|
40 | — | — | — |
|
CTCACACATGACGTGCAGTCATCGTGCCAAACTGCCAGCC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:8c20085c6961
|
40 | — | — | — |
|
GTGACTTATCCTGATTAGCAGGACAATGTTATTGTCAAGT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:ec1616307312
|
40 | — | — | — |
|
GCTCAACAATTCCAGTGTCACGCCGGAGCAACACACCATT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:a08e80ce8ddf
|
40 | — | — | — |
|
TCTCACCGGCCTCGACTACTGGGGCTGTAGTCGTACAGAT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:80034233b48f
|
40 | — | — | — |
|
TACGCAGTCGCAACCAGTGCTGACAATTACAGTGTCCATG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:d78c2d5628b2
|
40 | — | — | — |
|
TGTGGCGAAATTCCTGACAAATCGGTGCCATGTCACACGA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:78f24fa795b2
|
40 | — | — | — |
|
CCTATACGCCACCCTCCCCCGACAATTGCAGTGTCTTTCA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:91d45ed74ee8
|
40 | — | — | — |
|
TTGACAATTGCAGTGTCAGTTGCTTTAACTGCCTAATTGG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:71a4a7a565df
|
40 | — | — | — |
|
ATCGGTCGGCAACAATGGTAGTGTCTTCACTGAATGGGCG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:1ff49765be15
|
40 | — | — | — |
|
CGAAATACGGAGCAATTCCAGTGTCCGACGTAATCGCCAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:7f1510d150e6
|
40 | — | — | — |
|
TGCAGACAATTTCAGTGTCACACCCCCTACAAGACATGAA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:c9a8482cc7c5
|
40 | — | — | — |
|
CCACAGCTCCCGACAATTGCAGTGTCAAGCACCTTCAATC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:ecf0f04f5bd2
|
40 | — | — | — |
|
ATACGAAATGCATCCTCGACGACAATGATATTGTCACAGC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:f4571cb36399
|
40 | — | — | — |
|
TAGTGACAATTGCAGTGTCACCAAAGCAACACTAGCTAAA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:767a1850f46d
|
40 | — | — | — |
|
TATTGTTGCTCACGGTTCGACAATTACAGTGTCAATGCGC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:b43375c79af6
|
40 | — | — | — |
|
TCCACCTCATGTCGATTGTTTGACCGCTTGTCGTTCAGGA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:4bf83011f2a5
|
40 | — | — | — |
|
ATAAGCACACAGACAATTGCAGTGTCACTGACTAGCCCTC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:a1883e5e1b42
|
40 | — | — | — |
|
TCCATCTTTAGACACTGCAATTGTCATTTAAACTCGCGGA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:ce591f7121a2
|
40 | — | — | — |
|
GTCTGACAATGCTATTGTCATACTCCGATCGCTACTTCGT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:c922e7da163a
|
40 | — | — | — |
|
TCGTGACACTTATGCAGCAAATGACAATGGTAGTGTCAAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:a73a1f820755
|
40 | — | — | — |
|
AGTGGGGTATGTTCAAATGGGACCCATGTCCATACCAGAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:4d34c59d37fe
|
40 | — | — | — |
|
ACCGACAAGTGGGCCCTATGTCCGTTTGAATGGCGGCAGT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:a87540395c83
|
40 | — | — | — |
|
AAAGGCCAGGGTAGCGACGGACAACTGGGTCCATTGTCCA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:6d25ba0d18bb
|
40 | — | — | — |
|
CTAGCCTTCCGCCCCGACAATTGCAGTGTCACGCTAGTGC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:06377df4c75f
|
40 | — | — | — |
|
CCCTTGTGGGCACCCGATTGACAATGTCAGTGTCACTGCA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:906ce747db7b
|
40 | — | — | — |
|
ATATCACCCATGCGACACGAAACAATGCTATTGTCTATGC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:d4a549ea601b
|
40 | — | — | — |
|
TCCCGGTGTGCGCGAAGACTATTGGGCCCGAAGTCCTCGT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:44a3cf170517
|
40 | — | — | — |
|
ATGGACAATTGCAGTGTCTAGAGTCATATGCCGTTGTTGA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:76657dba45f6
|
40 | — | — | — |
|
CCCACTGTCGACAGCTCAGTCATGTATCAACGCTGACACC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:a51483bc693e
|
40 | — | — | — |
|
GGATGGCATGCATGACAATGACATTGTCAACACGATTTCC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:1dcbff31861b
|
40 | — | — | — |
|
GCCAAGACTCAATTGGTAAGGACAACGCTGGTGTCCGAGG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_SOX9:PRJEB66722:R3:5171297dfd0a
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final