MEIS3_VSX1
CAP-SELEX sample VSX1_MEIS3 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GTGGACTTCATCTACGTCAACTCGTAATAAGATACAAGAT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:73d0458cfec9
|
40 | — | — | — |
|
TTACTGCCTGCAAGTCCCGACCCGCCTGGATAACAGATGA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:90c2bd1c0940
|
40 | — | — | — |
|
GAGGACCGTCCAGGATGTCTTTGAACAGCCGCGTTACTCT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:f3f71108039a
|
40 | — | — | — |
|
GGAAGACGTAGTTCCTAACTAGGAGTGTCGCGTCTTACGC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:cd791886072a
|
40 | — | — | — |
|
ACTTTCCAGTCGCATCCGTGATCCCTGTAAATGCGCGCCA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:fca767978c70
|
40 | — | — | — |
|
GGCAATTAGAGCCTAGCTGCATTACGTAATCCGTCAACAT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:543d3f6b270c
|
40 | — | — | — |
|
GCGCAGTGCTGCAAAGCTCGCTAGTACACATGGCAAATCA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:88ea144936c1
|
40 | — | — | — |
|
TGGCTCTAGAGCCGTCAGAATGAGCGCTGTGAGCTGCACT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:ac1ebfcfb680
|
40 | — | — | — |
|
ACGAAGCCCCCCGTTCCTACCTCATAATAGGGCTCATTAA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:888845d3ad92
|
40 | — | — | — |
|
GGGGCATATATCCCGAATCAGGTATCCCACCGCGTAACCT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:b39b1bf9379f
|
40 | — | — | — |
|
TGAAGATCATATGCAGATAGTAGCTGGGAAACAACACAAG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:372b3a63ecc7
|
40 | — | — | — |
|
GTCTCCGTGCCTTATGCATCTGGGATTTCAGGAACGCGAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:99bd57d14883
|
40 | — | — | — |
|
CTACCACGCACGCTAATTAGCGCCCTTAGCGTCAAACATG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:91c3941dd396
|
40 | — | — | — |
|
GGGACTTGGTCATCATTTAAGGATGTTAGCGTTGCACTTC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:73981f5c6290
|
40 | — | — | — |
|
AGGTTGCTAGCCACTATAATTGAAGCAGCATTCAATTATT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:899accd2d68c
|
40 | — | — | — |
|
TAATTGCGCACGCACATAACTTGGAATAATAACCATCAGT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:91f9f03f2118
|
40 | — | — | — |
|
ACGCTCGAATTAGACACGATAATTACATCGATGGGTTACT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:2be705154c1e
|
40 | — | — | — |
|
AGACAATGAAGACATACTCGATATCGCAACTTGACCCATA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:785345b66a15
|
40 | — | — | — |
|
GATTAATGGTATGGAGCATCGTAACGAACTATGAGATAGT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:68ec367a3dca
|
40 | — | — | — |
|
AGTTCACATTAACCAGTTGTCAGCACGACACCGTCCCCAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:f9027dca8634
|
40 | — | — | — |
|
CAATTTACTTGCTATTCAATAAATTCGGAAAGACAGACGA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:371c8162b615
|
40 | — | — | — |
|
GTGATAACTAACGTGAGACTAACTCATGCAATAGCAACCT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:581399e6eaac
|
40 | — | — | — |
|
GCGAGCCAATTAAGATGGTCAAATACGTGCTAACTAAGTG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:2d99e57efaf8
|
40 | — | — | — |
|
TGGGTAGTGACAAATTGTAATTCCATAAGCAACACCGGGC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:e6e5f626d4a5
|
40 | — | — | — |
|
AATACTCATTAATTAAACTCTTAATTAACGTAGCGTTGTT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:709f88c4d94f
|
40 | — | — | — |
|
TGGCCTGACAACGAGGCATGGGTTCGGTGTCGTATCATCT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:cdd043863be6
|
40 | — | — | — |
|
AACAGATGACAGGAGGCACAATTAATTAGACGATGTGGCA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:b7fe735b03d4
|
40 | — | — | — |
|
GCGCAGGCACTAATTAGGATGGGGCCTAATCTAGTGCATT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:fffd206fcb31
|
40 | — | — | — |
|
AAGACGTGAATTAAAGGCCGGCCTAGCTGTTTTTCGAGCA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:929dfec7a8f9
|
40 | — | — | — |
|
TATGTCAAGTTGAAAAGGCTCGGACGAGGGGCTCCATATA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:1011a1b291cd
|
40 | — | — | — |
|
CGACGCGACTCCTCAGCGCCTTAACTTGCTAATTACAAAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:982d4489d342
|
40 | — | — | — |
|
GTTAATCAACTGTCGATGTTTATGGTGCTGACGGCGCATT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:5cb15956eef6
|
40 | — | — | — |
|
GATTGGTCGTAAATCAGAGTTACACATGCGTGTCACAATT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:665bf1acfb71
|
40 | — | — | — |
|
AAGCCATTTAGTAGTGTTAATTATCTGCAAGGTAAATGAT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:6c656c242afb
|
40 | — | — | — |
|
AAATGAGGCCTGCCCGCACCAGCGAGTTAATTACGCAACT
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:070fe5d13722
|
40 | — | — | — |
|
CCTTATCGCATTGTGGGTGTCGCGGACAGTTAATAACAGA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:2bb9dc5352c1
|
40 | — | — | — |
|
TGCGGATTGTCATCACAACGGAATCCACCGTTGTGACTTG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:f1ec2aff600b
|
40 | — | — | — |
|
AAAAATTAGTGTGCGTTAATGATGCAAAGTGGCCATTAAA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:c75f6f8b3885
|
40 | — | — | — |
|
CATTTGTAAGTAATGATACTCCAATTAGCAATTGACACGG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:1c8066c85fd5
|
40 | — | — | — |
|
TTGAGGCGCTCAGAATGACGCACTAATTAGTGTCTAAAAA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:97cb81411731
|
40 | — | — | — |
|
GACAGCTCAGAGGTAGCCCTATTAACATACATGTAAGAAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:0e76238c0779
|
40 | — | — | — |
|
ATCTTCTTAACCAATTAGCGGTACCAGAGCTGCCTGACAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:7b96714a6164
|
40 | — | — | — |
|
TTTTCGCAGATGACTTCGAGTCGGCACGGGGCGCCAGCTG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:99d718e4a04d
|
40 | — | — | — |
|
GGTGCGCTCATTAGCTAATTGAAATGCATTCAATTAGGGG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:970c50036064
|
40 | — | — | — |
|
CACGCCCGTTCAACTAGACCATAGCCCAGTTCACGAAGTA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:e118a3ea2804
|
40 | — | — | — |
|
ACCCAGATTAATCAATGTTAAGGGGTTATTTAGATAACGA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:322afd6faae7
|
40 | — | — | — |
|
TACAAACTGATGGAAGCTGACTTAAACGCGCCAAACTTGG
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:f81735c45365
|
40 | — | — | — |
|
GTCATCCTCCACCGAGTCATTACCGAATACCTGCAACTTA
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:54d7432e8000
|
40 | — | — | — |
|
TGCGCGTTAATAAGCTCTAATTAGGACCCCATGGTGAAAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:9fa8f3aed5fd
|
40 | — | — | — |
|
GGATGCCATTACGATAATCAATGACGATAACGGAATGGAC
PANAPTA:Q99687:MEIS3_VSX1:PRJEB66722:R3:b1fc971062c1
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final