MSX2_PITX3
CAP-SELEX sample PITX3_MSX2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AAAGGACGAAGTAAACTGATTATATCCCTACGCAACTATG
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:c7596ab6616b
|
40 | — | — | — |
|
GGCCCCGATTATCACTGGCCCTGTACCCCACGCCTCTCCT
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:f09ad03f4ad9
|
40 | — | — | — |
|
CCGTTAATTGCGGATTATGCGCGATAATTCGCGAGTACAT
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:ff4d29bd121d
|
40 | — | — | — |
|
TCCCTTTCTGTGCCTATGCATAACCCCTCCTTTCCATGCG
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:78b11707ca8d
|
40 | — | — | — |
|
GGTCGCCGCAGCGCGTGAATTAACCTCGTTAATGCCACGC
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:3ffa61b5f88f
|
40 | — | — | — |
|
CCTAATCCGTTGTACCAACGAATTAGGTATTACCCGCGCC
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:aa3de46d9581
|
40 | — | — | — |
|
AATCCAAGTGTCTTCTAATTCGTCTTTACGGATTAGGGCA
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:f20e7a1a2d83
|
40 | — | — | — |
|
TACAACTCGCCTCTTTCCACCTCTCCCCTATCTACCGCCC
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:58390c5981e7
|
40 | — | — | — |
|
TGATGATCGAATTACGCTTAAGGCTTCCGTAATCCGATAG
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:b167bc49045c
|
40 | — | — | — |
|
TAATCCGTTACTACAAGGATTAATACCGATTCCAGGTCAA
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:80a8d2189d25
|
40 | — | — | — |
|
CCGTACCGCTTAATCCTTTTCATGAATTAAGCGTCACTAT
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:b8692027f276
|
40 | — | — | — |
|
GAATTACGTCTTATAGTGTTAAGCCGCGTAATCCACAGCT
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:cd2b1f2df0fa
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCTAATTCGTTAGGCCAACAACGGATTAGCCGGCTCC
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:8d5b9753264b
|
40 | — | — | — |
|
GGCTGGATGATAATAGGATTAGTCCGACGCTAATCCTCAA
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:0a3ce3378a65
|
40 | — | — | — |
|
CTGTGCGTTAATCCCGCTTGCACAATGTTAATCACACTGC
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:f62bd62c6994
|
40 | — | — | — |
|
ACCTGCACTAAGCGGATGGGACATGAATTACTTGTAATCC
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:2b0220e15203
|
40 | — | — | — |
|
CTAATCCACACGATTAACTCCTGCATAATGCGTGTTAATT
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:a1c23a191c4b
|
40 | — | — | — |
|
AATCGGGTGTGCCAATTAAACGTTAATCGTACTTTAGATC
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:6b9eb6645baa
|
40 | — | — | — |
|
TCTTCTCCCAACACGCTGCACCACCCCTATCACGCCACCT
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:dee1a40480fa
|
40 | — | — | — |
|
GATTGTTACAGGATTAGTTGCACTAATACCCCCTCATATC
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:8b8e8ad44d31
|
40 | — | — | — |
|
CGGAATTAGCAGCGGCTAATCCAACGCTATCCCCCACACG
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:0cafc7d970f3
|
40 | — | — | — |
|
GGAAAAGGCGTAGATTAGCGTAGACTAATCTGATTAGCAG
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:2ef5d21d5748
|
40 | — | — | — |
|
CAAAATGTTAATCCATAACATTTACCATGGGATTAACTCT
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:2c6bdf975d4e
|
40 | — | — | — |
|
TAATCTCACACCGCGAGATTAATGACGATGCATTATCGTT
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:cf01cf2e2ed3
|
40 | — | — | — |
|
AGTCTTACGAATTACACACACATGTTTAATCCTAGCCGTC
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:f2220bcb24f5
|
40 | — | — | — |
|
TAATCCACAGTTGCGAATTAAAGGAGGAGATATAACGATG
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:c5fbc5c23557
|
40 | — | — | — |
|
AAGGATACACTTAACGGAATTATGACACTGATAATCCCTC
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:e7e7ac6fe226
|
40 | — | — | — |
|
TAATCTACGGATTAGAGATGAGGTACGTAATCATCAGGTA
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:4d8773b946bc
|
40 | — | — | — |
|
GACCGCGGATTAACGTAGCCCTTAATCCCCACGTGATCAT
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:6dad38d0d915
|
40 | — | — | — |
|
GGTCCACGTGGGATTAACCTGTATAGCGATGTTAATCCCC
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:c19f6581e2ae
|
40 | — | — | — |
|
GGGCATGTAATCCGTGAAATGCGAATTACTTGACCTTAAG
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:9460d9b968ae
|
40 | — | — | — |
|
TGGTTGTTTCCCCAACCGGACACCGCCGCAAACACGGCTT
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:7bb0e509db75
|
40 | — | — | — |
|
CAACTAATCCGGCCTTAACGTGAACGTTAAGCCAGCCAAT
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:dbcffb99c983
|
40 | — | — | — |
|
GATACGGCTTAGTGTGCGGACCAAATTCAACGTGGATTTG
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:82da2de237a4
|
40 | — | — | — |
|
ACATACGACCATCAATAGGTAATTCGTCTGGATTACTCGA
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:0588f4f6e464
|
40 | — | — | — |
|
AAAGCTGCCAGGGGTTGGGATTAAGCAGATTAATTCCCCG
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:84267f8fae85
|
40 | — | — | — |
|
GATGAATTAGGTGCACCCTAATCCAGCTGCATGCAACGTT
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:67178fcd3fcc
|
40 | — | — | — |
|
CGGATTAAGAAAGGCTTAATTCGTCATGTGCGTCAAATCC
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:6e1e68d98e71
|
40 | — | — | — |
|
TAACCTTAATCCGCATGGAATTTAGACCGAATTAACGCGA
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:94711ea1ff3e
|
40 | — | — | — |
|
CGCAGTTGACGCGAATTAGCATGCAGTAATCCGCGTGATA
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:72d536c52363
|
40 | — | — | — |
|
AGCCAACACCCCTATGGAATTAACGCGCTTAATCCCATTC
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:abd67da71eac
|
40 | — | — | — |
|
CATAGCGATACTTCACGCGAATTAAATGAGGTTAATCCGA
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:907b0acb9b52
|
40 | — | — | — |
|
GCCAAAGTTAATCTTCACATCGAAATTAACGCTGAATCAA
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:bb62f6a74019
|
40 | — | — | — |
|
AATCCACGGCTTACCCTCGATGTAAGCCCACCGAATCACC
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:f66de5f97b39
|
40 | — | — | — |
|
GCAGCACAGGATTATGGGCCAGAGCATAATCTCTGCTGGT
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:336f2e9c9a16
|
40 | — | — | — |
|
TTAGCCCGGAGCGCAAAAGCCTAATCCCGTCCTGGGATTA
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:072d9dbadecd
|
40 | — | — | — |
|
CCCTTCGTCTAATCCCTTGATGGATTAGCGAAAGCAATAT
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:cf1be18a6329
|
40 | — | — | — |
|
CGGATTAAGCGGACAACGTTAATCCGCTCGGACGATACAC
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:e8a46364a6c3
|
40 | — | — | — |
|
AATTTACATAATCGCAACAAACTGATTATGAGATCAGGTT
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:14c438eaba57
|
40 | — | — | — |
|
GCTGCTAGGGAATTATTGCCATAATCCAAGATAAAAGTTA
PANAPTA:P35548:MSX2_PITX3:PRJEB66722:R3:8f1a2fe31508
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final