NEUROG1_NKX6-1
CAP-SELEX sample NEUROG1_NKX6-1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TGCTCCTTGCAATCATTAATTATCGATTAACAGTCACGGT
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:ce4128142a8a
|
40 | — | — | — |
|
CACGTTAGATAATTGCTTTTTAATTGCGAGCATGGCACTA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:9b6dc949431f
|
40 | — | — | — |
|
CACGCCATATGCTAATGTAATGAGTCAGAAGTAGCATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:26ee584a825e
|
40 | — | — | — |
|
ACTCGTTGATCGAGATTTAATGGGCCACTAATTGCTTGCA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:7f6246f59f21
|
40 | — | — | — |
|
TTGTCACATATGTTCTCCGCGAGCAACGAAAAAACATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:1f9917cd085c
|
40 | — | — | — |
|
ACATGACCATATGTTAGCGGATCACATATGGTCCCACAGG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:e24e28e9b84c
|
40 | — | — | — |
|
GCGGCCACACCGTAATCAAATCGTAATTACTATCTATTCA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:9fbe1f4db8f6
|
40 | — | — | — |
|
TCATAGTTAATGCGAAATTAATAGAATGCTAATTTCTCTC
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:998146ad76d0
|
40 | — | — | — |
|
TCCCTTGCATTAATTGATATTTAATTGTTCTAATTTTCTC
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:6e36c27f32b8
|
40 | — | — | — |
|
ACAATTGATACGTAACATATGCCATTATTGTTCCGTTCGA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:b4f65afc5363
|
40 | — | — | — |
|
AATGAGCAATTAATGATGACATATGGCAGCCCACGCGTCG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:ffc80c7eb684
|
40 | — | — | — |
|
TGGTTAATATTAATGACTAATAAATGAGCTCATTGATCCT
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:35655c8cb1d4
|
40 | — | — | — |
|
ATCGTTATTAATTCCACATTAAGGCAACCTGACATTGATC
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:21b95f94cbdf
|
40 | — | — | — |
|
GCTTAGTCGATGTGCGCATATGTTTAAACATTAACATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:34a2e6e24209
|
40 | — | — | — |
|
AAATGACATATGTCACGCAATTAGCGTGGTTGACGGTGTG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:477d1a307055
|
40 | — | — | — |
|
ACACGGCATATGGCCAACAATTGACTTGTTAGCCGATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:145bb2798ee0
|
40 | — | — | — |
|
TTGATTGGTTATGAACAACACATATGGCTGAAAACATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:8a6f82561be8
|
40 | — | — | — |
|
ATGATTGCGAATGCATATGCCCAATAGGATGTGGCATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:bf4afa9fb35f
|
40 | — | — | — |
|
CACCATATGTCTGTTGCCAAGGATCTAATTAGACCATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:37ffb089a775
|
40 | — | — | — |
|
TGAATGAATGTGTGCATATGTTGCTTCTCTGTGACATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:5c435540c7e3
|
40 | — | — | — |
|
ATGTCAGAGCATATGTTTATCAGTGGCGTGTAGACATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:7eedf1107ed8
|
40 | — | — | — |
|
AGAGCACATTACAAGTGGCATGACATATGTTAACTCATTA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:b691056ef3dd
|
40 | — | — | — |
|
GCCAAAGGCGAAACAACATATGGCGTGATGACGTGTAGGC
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:ffb827520e79
|
40 | — | — | — |
|
GCCATGCTATAATATGCATCATCGTCATAATGACCATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:9cec5d0f537e
|
40 | — | — | — |
|
AGCATATGTCGTTTTAATGACATTATTGCCCTCCTAATTG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:840e2ada2772
|
40 | — | — | — |
|
GAATTGATCTAAGTGATTATTAATTGCCTAGGCTATGACA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:ab1e8ff31cd3
|
40 | — | — | — |
|
GCACCAAATCGTAATATGAACGATATTACGCAACATATGT
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:021b872e1d84
|
40 | — | — | — |
|
CATAACATATGCTCTACAGTAATTAAGGACAATTACTGTG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:046c76d02b8e
|
40 | — | — | — |
|
GCTTTAATGACATATGTCACGGTACATGCAACCGCATGCA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:e47b0f1cc2f0
|
40 | — | — | — |
|
CAACGTTAACATATGCCTAATTAATTGCGTGGCAGTGAGG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:179b1e907562
|
40 | — | — | — |
|
TACGTGGAATCGATGTCATATGTCGACATGCCGTCATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:6bfc23010465
|
40 | — | — | — |
|
TAATAATGACCATATGGCGTGTTAATCACAAGGTACGCTC
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:3f680310ced0
|
40 | — | — | — |
|
GCGTTACGGGATTGTAGCAGCAATCATAAAACAATTATCT
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:7dcd8af38682
|
40 | — | — | — |
|
CGTGGCCACTAGACCACGCGTATCATTAAGATGCCATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:c1ade4f6aac3
|
40 | — | — | — |
|
CATGACATATGTCAGCTCGTGTGATGCTAATTACTCTGAC
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:5d899716fd32
|
40 | — | — | — |
|
TGGCGCCAGTCATTATCACGCGTGATTACTGTGACATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:17d1d7865595
|
40 | — | — | — |
|
GTACGCCCCTTTGACGCGACATATGTCATTATTCCTGCTC
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:03808a9aac8b
|
40 | — | — | — |
|
GATAAATTAATGATGTAACATATGTCATTTATCACTCTGA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:4295ead5c278
|
40 | — | — | — |
|
CTGCTTAGTCGATCATCCCGGATCGATAAGACAACATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:aa97ad059c3c
|
40 | — | — | — |
|
TAGGTGGCATATGTCGACTCATTGAGGGACGAGGGAGCTA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:48c9beaae14d
|
40 | — | — | — |
|
TCTGGTAATGACGCGAACTCATTAACACAACATATGTCGA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:4220db5477ee
|
40 | — | — | — |
|
ACAATAGACATATGTCACGATAATCATGATTCCCGTGTTA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:1742286308cc
|
40 | — | — | — |
|
GCCATTAAGTGATCATTAGTTATGGCGTAACATATGTCCA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:52a76ab0fc9a
|
40 | — | — | — |
|
CGAATGAGGGACTGAAGCATACGGCTACTGTGCCATATGT
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:a6cd63e07533
|
40 | — | — | — |
|
GGGTGATCAATCACTGCCCCATTTATTGACGTAACATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:fc55bf735f7d
|
40 | — | — | — |
|
TGACGTTAATATGCTTAACATATGTTCAGGTATTAATGCC
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:900a9e86b966
|
40 | — | — | — |
|
CCACTAATTACATTCGTACAACATATGTCACATATTGTGA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:d072a8fbfcb7
|
40 | — | — | — |
|
AACGATGCAATTATTTCCTCATTACGTCATATGTGACGCA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:96ed6f6340b1
|
40 | — | — | — |
|
GAACGCAGCCCGCCATTAACTAGTAATTAATGGGTGCGCG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:8d082638fa47
|
40 | — | — | — |
|
CTTGGTTATGTAGCATATGTCAATGATTAACCTACCATTA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_NKX6-1:PRJEB66722:R3:720a9eaca3ae
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final