NEUROG1_USF1
CAP-SELEX sample NEUROG1_USF1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GCACCATATGTCCCTGTTTAGACTCAGATCGGTCCATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:8fc68bb77d1a
|
40 | — | — | — |
|
ACTGACATATGCTACGTCATGTGATGCCACACATGTGACG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:e0de84afd9dc
|
40 | — | — | — |
|
GTGCCTAACATATGCTATGAATGATGTCAAACATATGTTA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:460a721308f6
|
40 | — | — | — |
|
CCAGATCACGTGGTGGGTCCAAGCCTGCGCAGCCACGTGA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:a63cbba766be
|
40 | — | — | — |
|
CTTTGAACGCACGTGACGTACTGCTAAACGTACACGTGGT
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:642d42d4bd35
|
40 | — | — | — |
|
CACGTGCTTGCATCCACTGGCGACATATGTCACGTTACCG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:7abf3ac4abf8
|
40 | — | — | — |
|
CCGCTCCATCATCCGCACCCTAACGCCATATGTCACGTGA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:d599af49977b
|
40 | — | — | — |
|
GCTGAGGCTGCCTACATGCGCTAGATGGAACCAGCACATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:4e9cf9aa1549
|
40 | — | — | — |
|
AGGCAACATATGCTAGGACCACGTGTTCTTGGCCACGTGA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:e41cd99186d8
|
40 | — | — | — |
|
GTGCACATATGTTAACCATCGCGTCTGGTCACGTGGTACG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:134c2b1ffa69
|
40 | — | — | — |
|
GCCGCAGATCACGTGAATGCAACATATGTCACGACCCACT
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:2eef80fc060a
|
40 | — | — | — |
|
ACGGTGACATATGTTATCAACAATAACGGTCACGTGCATA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:24fc93060f04
|
40 | — | — | — |
|
CAAACACGTGACCAACCGTGCTCACCAACGTCACGTGCCA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:eb63595947dc
|
40 | — | — | — |
|
GGCACGTGACAAGCTGCCATATGTCACGAAACCCGGCGTG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:f265ae6633fc
|
40 | — | — | — |
|
CGTACTTATGCGACATATGCTATCTTTAGACCACGTGATC
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:d983a5e1394d
|
40 | — | — | — |
|
GCGACATATGTAACGACATATGTCACGTGTGTCAAATGCT
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:b517ef10bb3f
|
40 | — | — | — |
|
CCCTGTTCACCATCGTATGCCATATGTCATCAGTCACGTG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:84ee4c0efdab
|
40 | — | — | — |
|
TAACAGTCCTAACCCATCACGTGGTCCCAATGAACATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:69c1ab5f0813
|
40 | — | — | — |
|
CATTCCCATATGCTCCGCAGCGCGGTGACATATGGCCTTA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:e3ae84f51ed0
|
40 | — | — | — |
|
TTCCACACCATATGTCGCTACACGTGATCAACGAATGGGA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:b4a3190dadc6
|
40 | — | — | — |
|
ACGAACCACGTGACTTTGAGTTGAGACGACAGTCACGTGG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:ce42d5b3aaf8
|
40 | — | — | — |
|
GTTGATATCACGTGGACAACTGCGTTGCACACCCACGTGA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:0448389e4678
|
40 | — | — | — |
|
GACGGCATATGGCACCATAGCACGCCACGTGACGCGCGCG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:a2175a4b1310
|
40 | — | — | — |
|
AGACCATATGTGGTGGGCCCTCGCAACGGGACATATGTGT
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:3af46a616ce2
|
40 | — | — | — |
|
ATAGCTGGTATATCGGGGAACACGTGACATATGCCACTGT
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:1eab7af6e48e
|
40 | — | — | — |
|
CCACGTGATCACAGGCTTCGTTAGTGTTAACATATGCTAC
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:7665160dae28
|
40 | — | — | — |
|
TGTACCACGTGTCCGTGAAATGCCTCAACAGTAACATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:b026e46f7bca
|
40 | — | — | — |
|
CACGTGCTACGTCTATTCGACATATGTTACCGTGATGTGA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:e13b18a01aad
|
40 | — | — | — |
|
TGCCCATCACCACATATGCCTTACCATAACATATGTTCTA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:c437d240f334
|
40 | — | — | — |
|
AACGTAGCATATGGCACGTTTTTCGTAACGGCACGTGATC
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:f1527b91bd28
|
40 | — | — | — |
|
ACTGGGAAGTTTGCGACATATGCTATGTATTGTCACGTGT
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:8db166744e83
|
40 | — | — | — |
|
ATGCTTCCACGTGACATATGGTACGATTACACATCGTAAG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:b12032b0b290
|
40 | — | — | — |
|
GAACATATGTTGCAGCCTGATGGCTCACGTGACTTGCGTC
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:3e27290d0e24
|
40 | — | — | — |
|
TTGGCACGTGACAGTCCAGGTCACGTGGCTCCCCGACGTA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:5423e653a05b
|
40 | — | — | — |
|
TGCTCACCACGTGATGACGTGCGCAATCACGTGCTGTTGT
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:cb8afc54537c
|
40 | — | — | — |
|
TCCCACCTAATGCCTGCGATATGCATACATGTGACATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:4e0e65b90ac0
|
40 | — | — | — |
|
CGAAGACAGCATATGTCACGTGATGATGTTGTTACGCAAG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:d52d67c803c6
|
40 | — | — | — |
|
CATCACACACGTGACCGAGCACAACATATGTCAGTCTGCC
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:fa99ee9fd2ef
|
40 | — | — | — |
|
GTGTAATAACGCAACATATGTTATCGACGAGGCACGTGCT
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:613a6242e55b
|
40 | — | — | — |
|
GGAGCGAAACACGTGGTCCAGGGCGCGCTCCACGTGTTAC
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:4273849d997c
|
40 | — | — | — |
|
GCGCATATGTTTGATCGTTATTTGAAAGCATATGTGATGA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:d382d5759eb7
|
40 | — | — | — |
|
ACGTGCATGCGCGAATCACGTGATACCGCTCACGTGATTG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:6524390f8e7f
|
40 | — | — | — |
|
CCGCTCCACGTGACCATGAAGTGATAGCGCACGTGCGCGA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:b58cf05375ab
|
40 | — | — | — |
|
GGCCGCGATCACGTGGCGCCATAATTATGTACGCCATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:3811f3afb748
|
40 | — | — | — |
|
GGGTGTTATGCACGTGACATTGCGCAATGACACGTGGTTC
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:8094b328b493
|
40 | — | — | — |
|
GCACGCATGCCCCTTCGTCACGTGACCTGCTCTTGCCTAC
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:758b0b5d5ea5
|
40 | — | — | — |
|
CTCCCCCACGCGACCCACGTGACCACCAGCCGAACATATG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:af947b9b589f
|
40 | — | — | — |
|
TGCAGTGACATATGTCATGGTATCACATGCAGATATGCTG
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:a4a1721361c6
|
40 | — | — | — |
|
TGGCGATGCGCCATACTGGCATATGTCACATGACGCGTCA
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:413f3c7cef43
|
40 | — | — | — |
|
GAGTATGCCATAATTGTCGCCATATGTTCATCACGTGATC
PANAPTA:Q92886:NEUROG1_USF1:PRJEB66722:R3:95f082295c9c
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final