NFE2_PITX3
CAP-SELEX sample PITX3_NFE2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AAATTCACGCGTCACGCTGACTCACCGTGACTCATGCGCC
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:70cbb4826193
|
40 | — | — | — |
|
GGCCTGGCACAGGGTTGGATGAGTCATCATGCGTCATACC
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:b6e480fe60dd
|
40 | — | — | — |
|
AGATTACATCTCACACCACGTAGTCACGATGACTCATGCT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:314d53e7a267
|
40 | — | — | — |
|
ATGACTCATGATGACTCATTGTATGAACTAAAGATGTACC
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:57b4f4b7f1a5
|
40 | — | — | — |
|
GTTTTATTTGTTAGTGAAATGAGTCACGATGACTCACGAG
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:8f7346829dd1
|
40 | — | — | — |
|
ACGCCAACAAGTGCCATGACTCATGATGAATCATGTTGTT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:b97aff568e00
|
40 | — | — | — |
|
CAAAACCTTAACTCAAGCATGATTCATGCTGAGTCATGCT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:b1032019bfb3
|
40 | — | — | — |
|
GTGACTCACGATGACGTCATCACCCATGGCCATGACCGTT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:e7f5ec10b6c4
|
40 | — | — | — |
|
GATGTGTCATTCAATTACTCACCATGACTCATCTACTGTA
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:72f0ae9b3d99
|
40 | — | — | — |
|
CGCGACGTGATGAGTCACGATGACACATCCAATCACAGAA
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:14e10951b9cb
|
40 | — | — | — |
|
AGTGCATGAGTCACGGTGACTCATTCCTGATTTGGATTTA
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:08fde03fe84b
|
40 | — | — | — |
|
CTCCCGCCGAAGATGACACACCGTGACTCACCATGACTCC
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:f46f741f7ef1
|
40 | — | — | — |
|
TTGACTGTCAAGTTGAGATGAGTCATCATGACTCATAAAA
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:ccb5409e54b8
|
40 | — | — | — |
|
TCTATTCACGCAATGAATCACCATGACTCATTGGTGCCTC
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:f0b9b3f8b48a
|
40 | — | — | — |
|
AACAATGACTCACGCTGAGTCACAGTCATGCACCGTCACC
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:0396f1a42254
|
40 | — | — | — |
|
TTCTTGGGTGTACGCGAATGCATCATCATGAGTCATCGTG
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:ca2a5dd01282
|
40 | — | — | — |
|
ACGTTTAACGATGACTCACGATGACTAATTAATCCAGTGT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:414a1c57b517
|
40 | — | — | — |
|
GATGGTTGGGTATGCGTCACCATGACTCATTCCACTTCTC
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:2c94a8f17b98
|
40 | — | — | — |
|
TATGAGTCATGCTGACTCATGCTCAACGACCGAATACACA
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:ba9193ce0697
|
40 | — | — | — |
|
GAAGGTATGATTCATGATGACTCATGATCCTAGATATCGT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:a315a3a20556
|
40 | — | — | — |
|
ATAACGTCCTTTTGAATGACTCATCATGAGTCATAGACCC
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:93e11d5d6ad3
|
40 | — | — | — |
|
AGATGACTCATCATGACGCACGTAACATTGAAAAGCACTC
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:739c82216898
|
40 | — | — | — |
|
TCGCCATGACTCACTTATAGTCATGGATGAGTCATCGCTC
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:dfcfae5dcd64
|
40 | — | — | — |
|
GCCAGAGGCACGATGACTCATGATGACAACTCGTCTACAC
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:fef250e5381a
|
40 | — | — | — |
|
TCATGTGACTCAAATGCACATTAGTCACGATGAGTCATTG
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:95811df74226
|
40 | — | — | — |
|
GAGTCTGGCATGACTCATGCTATAATGACTCACCTCTTCT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:125e80b6b7b9
|
40 | — | — | — |
|
ATAATGACTAACGATGACTCATCGAGAAGCTTGACACCTT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:5f3900e0522b
|
40 | — | — | — |
|
CTCAAACACAGCATCTGATGAATCACAATGAGTCATACCT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:6a0c515a499c
|
40 | — | — | — |
|
AAGTACGATGAGTCATCGTGACATTTACCACACCCTTGCT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:7d557c3fd2a0
|
40 | — | — | — |
|
GTAGTATGTGTCATCATGAATCATTGCTCTCACTCCCTAT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:d28cdc133805
|
40 | — | — | — |
|
AATCTTCGTCATACCAGTTGTCCAAGAATGACTCATGCGT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:d82032657b9e
|
40 | — | — | — |
|
GCAACCGACTTGATACGTTACTCTAGCATGACTCATGCAC
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:971c0025d41a
|
40 | — | — | — |
|
TACCCTTTGGACGTTAACAATGCAGGCATGACTCATGCTT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:5677d0fb05a7
|
40 | — | — | — |
|
ACACACCACACTCATCGCATGATAATGATGACTCATGCTA
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:0de99335fdcb
|
40 | — | — | — |
|
AACTGCTATTTAACCCTCGTGATTCACGATGACTCATAGC
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:c539496c8cf2
|
40 | — | — | — |
|
CAACGATGACTCATCCTGAGTCACCGGAAAAAGCTGGTTG
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:ab5b5168e64b
|
40 | — | — | — |
|
GTGAAAGGCACGTGTATGATGAGTCATTGTGTGTCACGCA
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:792a4b126711
|
40 | — | — | — |
|
CGCATGACACCCGGCATATCGTAATCGTGAGTCATGATGA
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:2f501fb527bf
|
40 | — | — | — |
|
CGATGACTCATGGTGACTCAGTGTCTCTATGGCGCGAGCT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:e2de16492e54
|
40 | — | — | — |
|
GAAAATTGATTGTAGGTATGACTCATACATGAATCATCCT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:f10a08987a9b
|
40 | — | — | — |
|
TCATGACTCATCGCATGACTCATCACCGAAGGCTCGAATA
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:9c9478c226e0
|
40 | — | — | — |
|
GTAGCATGACTCATGCTATGTCATCATGGTCCTTTCACTT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:c7f96e45814e
|
40 | — | — | — |
|
GAGAGGACGATGAGTCATCATGACAACGTGGCTATCACCT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:13eda89dcc84
|
40 | — | — | — |
|
ATGCGACCGAGCATGACATGACGTATCGTGACTCACTCTT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:44d75a2858c3
|
40 | — | — | — |
|
GTATAGTGGATGACGGGCATGACTCATGCTGAACCGCTTT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:751b12f58bf4
|
40 | — | — | — |
|
GCTCGTGACGTCACCATGACTCACTACAACCTAACCACGA
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:9abc0d71c132
|
40 | — | — | — |
|
AAAGGAAGCCTGAGAATGACTAAGCATGACTCATAAGCAT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:1ac45ac3e331
|
40 | — | — | — |
|
CGCAATGAACTAGCGCTAATCCTTAAGCATGACTCATACT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:1613693f5172
|
40 | — | — | — |
|
GTGGTTTTGGCCACTAGATGACCAGCATGACTCATGCTTA
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:8b2595243620
|
40 | — | — | — |
|
AATTGAAGTACCCTGACCCACGTATGCATGACTCATGCCT
PANAPTA:Q16621:NFE2_PITX3:PRJEB66722:R3:cf6de6065f24
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final