NFKB1

Pre-clinical SELEX library

Organism
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R1,R2,R4
Sequences indexed
10,000

Top enriched sequences

More via API →
Sequence Length log2 FC P(active) Class Monotonicity
TCTGTGTTGGGGGATTCCCCTTATTCACCAGGATACGT
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:afa682989c8c
38 12.11 0.48 strong_positive 1.00
TCCCTTGGCTGGGGGGAGGGGATTCCCCTTCCCTGTGTGGCTCTCAGG
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:f6ff5a8e6f5d
48 12.11 0.55 strong_positive 1.00
GAACAGCATCACGGTTTAGGGGAATCCCCTCGCT
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:1a733b351565
34 11.97 0.51 strong_positive 0.50
CCAACTCAGGGGATTCCCCTTCTTGACAGTGGCC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:30091ddc3679
34 11.94 0.55 strong_positive 1.00
TGGTAAGGGGAATCCCCTGATGTTGAGCCCAC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:cd51304467ff
32 11.91 0.56 strong_positive 1.00
ATGCTCTAGAAAAGGGGAATCCCCTGAACATCCAC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:493641263769
35 11.77 0.55 strong_positive 1.00
ATGAGAGCGAAGTGAAAGGGGATTCCCCT
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:99fa389dd04b
29 11.76 0.56 strong_positive 1.00
GAACGCTGATTTGCTGGCTGTGGCAATTAGGGGAATCCCCACGAAG
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:c131857170bc
46 11.75 0.46 strong_positive 1.00
ATCACGGTTTAGGGGAATCCCCTCGCTGTCCCCATAA
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:55b522274926
37 11.72 0.54 strong_positive 1.00
ACGTGTATCTGTGTTGGGGGATTCCCCTTATTCACCAGGAT
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:0c79b5c8f6d7
41 11.69 0.44 strong_positive 1.00
ATGATCAGGGGATTCCCCCACGCCCCGTGG
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:3287fc71d821
30 11.69 0.57 strong_positive 1.00
CAGTCAGCAAGGGGATTCCCCCAATGGCTGCATGCA
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:3fa9388927da
36 11.67 0.56 strong_positive 1.00
ATGTGTTATGGGGACAGCGAGGGGATTCCCCTAA
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:52329bf5f964
34 11.66 0.54 strong_positive 1.00
CACCTCCCCAGCCAGCAAGGGGATTCCCCCAAT
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:06204ff2e222
33 11.66 0.57 strong_positive 1.00
AACAACGGGGAATCCCCTTCGGTTTGCCCCCGTCCCTGATC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:c89c57fc2a66
41 11.63 0.51 strong_positive 1.00
TATGTGTTCAGGGGAATCCCCTTTCTTACCAAC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:166a29410301
33 11.63 0.53 strong_positive 1.00
GTGGGCTTAACATCAGGGGATTCCCCTTACCAAG
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:bc672f1926fd
34 11.60 0.55 strong_positive 1.00
GTTATGGGGACAGCGAGGGGATTCCCCTAAACCGTGAT
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:f25db2293982
38 11.60 0.55 strong_positive 0.50
ACGTGCTGTAGCTCTGTCTTGGTAGGGGATTCCCCTCTGC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:a3d71148cbfd
40 11.59 0.50 strong_positive 1.00
CCTTGGTGAAAGGGGAATCCCCAAATGACAGTC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:b01d7e46ecf3
33 11.58 0.51 strong_positive 1.00
TATTGGGGGATTCCCCCGATAGCCCAGGC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:c4c3ea5a921f
29 11.57 0.57 strong_positive 1.00
GCATCAACAAGGACAGGGGAATCCCCAACT
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:e0912ff02629
30 11.57 0.54 strong_positive 1.00
TTGGGGGAATCCCCTTGCTGGCTGGGGAGGTGAG
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:e9e8cf3adf65
34 11.55 0.56 strong_positive 1.00
AGCGAGGGGATTCCCCTAAACCGTGATGC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:99c88e4a32d4
29 11.54 0.56 strong_positive 0.50
GTGCAAGGGGTCGGGGGATTCCCCTTTCCTAGCCAAAGGAAGGGTGACAGAC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:9569b4b97f24
52 11.54 0.51 strong_positive 1.00
GTCAAGAAGGGGAATCCCCTGAGTTGGGCGAGCTAT
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:40a4e032523e
36 11.53 0.56 strong_positive 1.00
ATAAGGGGATTCCCCTTTTGCTTGGGTCTCATGCTTTC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:e89cf57344f0
38 11.49 0.49 strong_positive 1.00
GACAAGGACACCCATGATCAGGGGATTCCCCCACGCCCCGTGG
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:d5973ea11a18
43 11.47 0.52 strong_positive 1.00
AGGGGATTTCCCTTTCCTAGCCAAGGGAAGCCGTGAC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:6d2f8703b293
37 11.46 0.54 strong_positive 1.00
GTGTGCTGGTGACTGGTGGGGGAATCCCCTTTCAG
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:c492ec6fb118
35 11.45 0.55 strong_positive 1.00
CTTTCCCTTGGGGGATTCCCCTGTTCTCCTTGGT
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:56c86c636742
34 11.44 0.56 strong_positive 1.00
ATGTGTTATGGGGACAGCGAGGGGATTCCCCTAAACCGTGATGCTGTTC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:0bcf2b76fea7
49 11.43 0.43 strong_positive 1.00
CCGGCGCCCACCCCCGCGGGGAATCCCC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:def7fe4ff7d7
28 11.39 0.57 strong_positive 1.00
TGGCTTTCTTTGGCTAAGAAAGGGGAATCCCCGAAC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:0653b429deb5
36 11.37 0.53 strong_positive 1.00
GTGTGTGGGCTTAACATCAGGGGATTCCCCTTACCAAG
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:69feef0ee7b5
38 11.36 0.50 strong_positive 1.00
TCTGTCTTGGTAGGGGATTCCCCTCTGCTGAGC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:fe063fe66435
33 11.36 0.56 strong_positive 1.00
GCTCCCTGACTGTCATTTGGGGATTCCCCTTTCACCAAGG
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:e2fde7a2a930
40 11.33 0.49 strong_positive 1.00
GTGGGGGAATCCCCTGCCTTGGCCTTGCC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:3b084231624d
29 11.32 0.57 strong_positive 1.00
ACGTGCTGTAGCTCTGTCTTGGTAGGGGATTCCCCTC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:bf602b769731
37 11.31 0.51 strong_positive 1.00
ACGTGGCAGGAAGGGGAGGCAAGGCCAAGGCAGGGGATTCCCCCACC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:12b41c26d46c
47 11.30 0.55 strong_positive 1.00
GCACAAGGGGTCAGGGGATTTCCCTTTCC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:bacd6d3cd017
29 11.30 0.57 strong_positive 1.00
AAACCGAAGGGGATTCCCCGTTGTTGGCACGGTTACCT
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:f661098d4e73
38 11.29 0.47 strong_positive 1.00
GGTTGAACTGTAGGGGATTCCCCTAATAGTGAA
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:2cb74053d52d
33 11.29 0.55 strong_positive 1.00
TGTTCAGGGGAATCCCCTTTCTTACCAACTATAC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:315050bc26e2
34 11.28 0.52 strong_positive 1.00
CCTCAAAAAGGGGATTCCCCTCCCTGCCGTGAAT
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:8958e35a3e2a
34 11.28 0.55 strong_positive 0.50
GCTCAGCCACCTTGGTGAAAGGGGAATCCCCAAATGACA
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:0a005213ea77
39 11.28 0.50 strong_positive 1.00
GTTATGGGGACAGCGAGGGGATTCCCCTAAACCGTGATGCTGTTC
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:93de4af84d2c
45 11.28 0.47 strong_positive 1.00
AACAGGGGAATCCCCTAAAGAGAAGGTGCTCAACAATCAGGTAG
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:4bfd6e802955
44 11.28 0.45 strong_positive 1.00
ATGCTGTGCTTGGGGGAATCCCCCTTGTCCAGGCTGCCCTGACTCTTCAGAG
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:d7476ea93849
52 11.28 0.52 strong_positive 1.00
GGTGTCAGGCAAGAGAGCTTGTGTGAGGGGATTCCCCTT
PANAPTA:P19838:NFKB1:PRJEB76622:R4:b9cc3fa0723f
39 11.27 0.49 strong_positive 1.00

SELEX rounds

R1 R2 R4 ·final

Structural & language-model features

JSON ↗

Pre-computed feature catalog (paths only — files served separately).

Residues
968
FASTA
ESM-2 mean
ESM-2 per-residue