NKX6-1_OLIG2
CAP-SELEX sample OLIG2_NKX6-1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TGTTTATGGCGACTTTAATTGGAAAAACATATGCTTCCGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:f1dec819b520
|
40 | — | — | — |
|
AACCTACATGTGCGATAATTGCCTTAACATATGTTCTTTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:853e7210c2be
|
40 | — | — | — |
|
ATACCCCCACTTAATTACGTAAACATATGGTTGCATTCTA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:e4fe5f839478
|
40 | — | — | — |
|
AATTGGATATTAATCACCAAAACATATGGCCAATTTGTCC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:b9ff2b4ff287
|
40 | — | — | — |
|
TTGGCAATGGCGAGAAAAACATATGGTTAGGTAATTAAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:62602f586e0e
|
40 | — | — | — |
|
GCTCAATTACCGTTACAAATTGCTAATTGCAGTTTAATTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:7e938ae286b4
|
40 | — | — | — |
|
CTGATAGACGCGCGCTAATGACTTAATTGGTTTTTAATTA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:e809168dc7ba
|
40 | — | — | — |
|
AACATATGTTTGAGCAATTAACGCTCGACCATTCAACATG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:63fc938d100a
|
40 | — | — | — |
|
TTGTTAATTACCAAAACATATGTCCAGATCGTAGGTTAGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:cc19cdea62aa
|
40 | — | — | — |
|
TAGCATATGTTTTGCGTCTGTTTAGGTAATTATTACGCCC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:a31c83e624fb
|
40 | — | — | — |
|
GGGTGGTTGTCCATTTTGGTCGCTAATTACTTTTTAATTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:8de8b1352610
|
40 | — | — | — |
|
TACCACGGTAGGAGACACTCCTAATTGCGATACCATATGG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:a5faa78ac20b
|
40 | — | — | — |
|
CGAGCAAGGTTAGAGCGGCTAATAATTGCGAAACCATATG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:4b8384710392
|
40 | — | — | — |
|
TGCCTATCACCATATGTTTAATCAATTAGCGTGGGTGCAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:4fe1f593ac81
|
40 | — | — | — |
|
TAGTTAATCGATATTTAATAGCTTAATCGTATTTGCGTGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:bdb68f2696ab
|
40 | — | — | — |
|
CGAAACATATGGTTCTCGCATTAACGGCCAAGGTTCCGGG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:f0823f8df606
|
40 | — | — | — |
|
TTGGATAATTGCGATAACATATGGTAGATTGCTCTCTCCC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:a915afec4290
|
40 | — | — | — |
|
TTGCCTCGGCGGCGATAATTCGTTAATTGCAAAATGATTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:7f0a84c07aa4
|
40 | — | — | — |
|
TACAACTACCTTCCGTTAATTACATAACCATATGTTTTAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:6e27aaf052c2
|
40 | — | — | — |
|
AGGGAACAATATGTTCCAACTATTAATAATGCATTATGCT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:03a29639eb63
|
40 | — | — | — |
|
TGGTTAATGAGTGTAAACATATGGTTACAATGTGCGTGTA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:ef2946610ef8
|
40 | — | — | — |
|
TTGTACAATTGCTGTAAGGTCGTTAATTGCCTTTTGATTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:fdf61f89769d
|
40 | — | — | — |
|
ATAACAATATGCCACATTTTTGTTAATTGCTTTTTGATTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:93e225b55300
|
40 | — | — | — |
|
AACGAGAGCTACTAATGTGTAAACCATATGTTAATCTGAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:94f5efbaecf3
|
40 | — | — | — |
|
CACCAATAACATATGTTTTTGCAATCAACTATCGATTATC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:04db7f35b264
|
40 | — | — | — |
|
CGTTGATGAGGGAAACATATGGTAACGGGGCAGGTAATTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:a382dbd98919
|
40 | — | — | — |
|
TATGCTTTGCATATGTTTTGGCAATTATTTATGTCGCTTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:53d79997c780
|
40 | — | — | — |
|
TTGCTGCCTTACGAGTAGCATATGGTTTGGCTATTATGCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:1332e81c34c3
|
40 | — | — | — |
|
GCGCCGTTACGCGGACTTGACCATATGTTTTCGCTATTAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:e2041c7e80aa
|
40 | — | — | — |
|
ACGGGCGTATCGTCATGCGTAATTGGTAAAACATATGGTA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:641619734528
|
40 | — | — | — |
|
TTGATATGCCCGTAATTGTACAAACATATGTTTTTGCGCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:5ac55efe6b43
|
40 | — | — | — |
|
GAGCCATCACTAATTGCGAGAACATATGGCGATAACTCAG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:f3219eae39cd
|
40 | — | — | — |
|
TGAGAGTAATACGAAAAACATATGTTAGCTAATCGATTAG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:b86574fa3b9d
|
40 | — | — | — |
|
CTAGTGGTACCATATGTTTCGTCAACTAAAAACGCATTGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:b75c75815c15
|
40 | — | — | — |
|
GTCGCTGGCCCCACCATATGTTTTCTCCATTAAAGTCGAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:5a504f5b6e2e
|
40 | — | — | — |
|
AACCTTAATTGGCTAAACATATTGTAAGAATGCGTTGGTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:804645ae9f06
|
40 | — | — | — |
|
ACACCAAATAATTGATGAAACATATGGTTTTCGCCAAATG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:fc61f0dce80a
|
40 | — | — | — |
|
AGGCAAAGTGACTTTTAATTGTCGTTCCGTATGTTCCCTC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:c2238156ca2f
|
40 | — | — | — |
|
TACGATACTCATTAATGGAAATTTCCATATGGTTTCGTCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:b30ec19bf2fd
|
40 | — | — | — |
|
TCAATACCACAACCATATGTGTTAGACGTAATTATCGCGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:fd402792befc
|
40 | — | — | — |
|
CTTGTGTAATAATGGGGATTTGATTGCTGTAGCATATGTT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:8be598ee99da
|
40 | — | — | — |
|
AGGTGACATATGTTTAAGCTATTTAATCGGTAATTAGGCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:17c11c695804
|
40 | — | — | — |
|
ATTCACATGCCCGTGCCATCCACTGATTGCTTTTTAATCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:6d4d0427fadd
|
40 | — | — | — |
|
TTAATGTGATAAACATATGGATGTACACTGTATGCATAGC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:43fbdecbfc3d
|
40 | — | — | — |
|
AGAGGCCCTTAGACCCTGCGTGTTAACGAGGAATTAATTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:32cc8ebff06c
|
40 | — | — | — |
|
TGGGGCAATTAATGACGAAAACATATGTGTTTCAGGCCCT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:385c4623ea5c
|
40 | — | — | — |
|
GCGAGATAAGGTCGTATGGCATGTAATGGCTATTTAATTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:51ec45d54115
|
40 | — | — | — |
|
TTTGCTTTAATTGCATTGTAATTATCAAACCATACGTTAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:60337ad7ae7f
|
40 | — | — | — |
|
ATGGTGACCATATGGTTTTTACAAGTATTAATGAGTTGCG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:a92a7e568138
|
40 | — | — | — |
|
TACTAATGATGACAACATATGTTCTCGTCGTTAAATTTAG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_OLIG2:PRJEB66722:R3:222fbbb19148
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final