NKX6-1_PAX1

CAP-SELEX sample PAX1_NKX6-1 · 1 runs in PRJEB66722

Organism
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Sequences indexed
10,000

Top enriched sequences

More via API →
Sequence Length log2 FC P(active) Class Monotonicity
CCATTCCCTTAATTGCTTTTTAATGATATGGCATCGCGTA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:30099ad44655
40
GCCTGCACTCCACATTTGCTAATTGCTTTTTAATTAGGTC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:15c700c763b7
40
CTAATGGATTTTTAATTACCCGTTGCACGTCATTAATCGA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:c4b828578ec4
40
TCCACTCACGCGCCCGTCACGCCCCATTAACTTTCACGAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:32402453c1fb
40
CCCGCTGAGTCCTCATTAAAAAGCAATTAAGGGAGGAACA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:bb8ed824b86b
40
GATCATCGTCTCCCCTAATTGGTTTTTAATGACATTAACA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:b841e00d898d
40
CGCCCGCCACGCATGACTGCACAGCAAAACCATTATCCCT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:08bec53ab26c
40
ACTAATGGCTTTTTAATTACTCGTAACCTGCACCTCTCCT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:a1a3cac8ab81
40
TTACCTGCTCATTGGTCACGGGTAATTAACTACGAAACAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:431a6d56ee12
40
GATAATTGCTTTTTAATGACTCCCCATAATATGCTGTGCG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:1a5efaf3aad7
40
AGCGGGCTATCCTAATCCGTCACGCCTCATTACCTCCGAG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:9098db7bd225
40
ACTTGCTAATTGCAAAATAATTACCCCTTGCAACGCTCGC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:da542f1ae12f
40
CCAATTAACGTAATGAGCTTTTAATGACCTGTCTGTGCGC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:1cb7784086de
40
GCTCTCTGCCGACCCTGCGTCCGTCACGGCTCATTACCTA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:270e9fe493ee
40
CCGGCATCTACATTCGTCACGCCTCATTAACTGCCTCTTC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:35dcd7f66d4e
40
AATAACAATTGCATGCCACATCCGTTACGCCTCATTACCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:6165394729be
40
CCCTTAGGTCATTAATTTGTCATTAAGTGCCTCACCAACT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:3c4bb33ee80f
40
CCGACGCCACTTCACAAAGACCGTCACGCCTCATTAAGCG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:7eda4fb161fa
40
GATCACGACGTTGTAGATGTTAATGACAAATTAATGACCC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:9b475c796310
40
CATGCTAATTGCTTTTTAATTGTTCTTGAACAGGCCCCTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:63a8eebacb43
40
TGCACTAATTGCAGATTAATAGCCCAAGCAGCGCACAGAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:79266ee55d10
40
ACTAATTACACCTATCCTTACTCATGCGGAACGGTGGCCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:933f0109f04c
40
GATGGCCCTGACTTATGAGACGCGTCACGCCTCATTGACT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:042a5d921cbd
40
GTAGCGATCATAACCAATTAAAAAGCCATTATCGCTCCGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:6544545115dc
40
TGATTGAAGTCGCTAATTAAATACTCATTAACTCCATGCC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:38807a224a14
40
CTCTTCATCGTCACGCTCCACTGAATATACCGCTAATTGC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:7e067d5eb5a7
40
CTTCCGTTAATGGTTTTTTAATTGCGATGCATGTTACGTC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:ba8ef1d481a8
40
GGTCTGGACGTAATTAAAAACGCATTAACTATACGTCGCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:0393d2e2610e
40
TTTAGATATGTTAATGACAATTTAATTGCCTTATGTCGCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:0c584edfd47c
40
GCATACCCGCTAATGACTTTTTAATTGACCTGATGCGGTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:d901d45ef38f
40
GATAATTGCAATTTAATGAGGTTAAGGTCAACGACAGCTC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:18f908002cb0
40
CTTACCCCTAATCGATTTTTAATTGCGTGATTACGTAAGC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:5359135b24fa
40
ACCGAGCGTCACGCCTCATTAACAGCAAGTGCATCATTCC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:14e6fa01a24d
40
CTGGACTAAGCTTAGCAATTAAAAACGCATTAGTGGCGCT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:201f26d97036
40
GTACGCCTTATTACACTCATTAAAAAGCAATTAATCCTTA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:7ebd15d24363
40
ACCGAGACGCATTCAAGCGTGACCAATCATGCGTTAATCG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:059e7795ea43
40
AGAAATATGGGCCCCTCACCCCGTCACGCATCATTAACTC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:ebceeb016ea1
40
CCATCCTTACTAGTATTGTTTGTCACGCCTCATTAACTTC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:7cd2d3b86ed1
40
GTAGTTCTTAGCGTAATGGCTTTTTAATGACCCCCTCTCT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:cefd60aba36c
40
GACAAACCTCGCATCGTCACGCCCAATTAATTATCGCGAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:2c4f855a8112
40
CTCTGATGTCATTAAAAACTCATTAGTAACTTGACGCTGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:402b24e8454d
40
TCATCCATGCCAGTTCCGTCACGCGTAATTAAACACCGCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:10b2d6b04521
40
CGAAGTCATTAAATCGTAATTAACGCACGTAAATACCTCC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:7ef0216a26cb
40
GCGATATATCTTACGTCGTCCTTAATGAGGCGTGACGGAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:a2c7aac91dda
40
CATGCTGCAATGCAGTCAAGCGTGACGCACTCTCCCCACG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:0e16e5a83e99
40
CACTACCAGTCGTCACGCCTAATTACCTCCATTGTGACCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:50b2577169b9
40
TCCCCCCGATTACTGAGTGACGTTTAATGATGCGTGACCG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:dd92b0987a0d
40
CTTGGCCCTCGTCACGGTCCATTAACTACCCCTTTCTTAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:a7c4a7eea2ae
40
ACCGCCTTAATGAGAAACAAAGTCACTCATCCATGACCCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:25947f36a01a
40
CAATAATCACGCTTCGTCACGCCTCATTTACAAGTGCAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PAX1:PRJEB66722:R3:6071e32d77e0
40

SELEX rounds

R3 ·final