NKX6-1_PBX1

CAP-SELEX sample PBX1_NKX6-1 · 1 runs in PRJEB66722

Organism
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Sequences indexed
10,000

Top enriched sequences

More via API →
Sequence Length log2 FC P(active) Class Monotonicity
CCATATTGCCGTTGTATAATGATTAATGACTTTTTAATTA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:1b7c89ad6e3e
40
CGACACTGATTAATTAGTCATTAATCATCCGTCAATTGGA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:02de40865ae4
40
CTAGCATAACATAATGATTAATTGCTTTTTAATTATGGTC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:b7d81757c3f5
40
TGGTACCAATGCAATTAATTATCGTTCAATCAATGTTAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:456bb30c9d35
40
GACACCTCGAATGCGATGATTGATTGTGTTTTAATTGCGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:d45fafb3925b
40
CAGAAGCGAAATAAGTCCATTAAATTCGCATCAATCAAAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:876e881be02f
40
GCTTACGACATGAACATCATGTTAATGGGAAAATAATGAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:b5fd552c36d7
40
ATTAGATCAATCATATGGTTGATTGATTACTGTTTGTGCT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:1a980c44988b
40
ACTGGCCTGTTTGATTGATCGATTATTAATTGCTGATTTT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:9de7e6c4b11c
40
GCACGCGCCAGAAATGATTGATCGATAATTGATGATATCT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:7baf6eb7fa11
40
ACTGAATTGAAATGACAAATGAGCATTTAATTACCCCAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:e3691ffb7389
40
CGATAATGTGATTAAATCGTCATCAATCATCTTCGTCCTA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:08b99b99db5d
40
TAGCAATTAAAAATCAATTTGTCACTGTTCAAGCGTAACA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:d026b0174ca6
40
AATGCGCTGTTGATTAATGAGTGTTTAATGAGCTCAATTC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:89ae305542e1
40
CTGTCATTACATGTTTGATTGATTATCTTTCTTGCTAATT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:afd1b936ade7
40
AAAGAGTGATTGATGTGTTTTTAATTGACGATTTTATGAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:4ac1520bb98c
40
GTGCGTGTGATTGATGGGTTTTTGATGACTTCTTATGAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:5bef2239871c
40
CACATGATTAATTACATTTTAATAATGGTGATTAGCGATA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:136f83cf2ed0
40
TATTGATGAGTAATGATTGATCGCGTGTGTCGTAATCACA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:0fcee7a986a0
40
AGGTTGATTGATTGATTGCATATTAATCATGCGACAGCGA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:a2f9cd92b60f
40
ATTTTGATGGATGATCCTTAATTGCGTTTTGATGTGTTAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:8fe3fc495e8b
40
AAGTGCGATCCATCAATATTTGTGATTGATGACTTTTTGA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:a0d896489a50
40
CGTTGATTAATGACGTTTTAATATGTTTACATCCTCACAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:0aea0e26f987
40
CGATAAGGACCATTAACTCGTTGATTGATTGGTTTTTGAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:48fa6f83c73d
40
CGACGCAACACTCATCATACTGATTGATTAATGATGCTAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:59f47899e4b6
40
TGGTTCACTGTCGTGCGTGTCTCATTAATTTGATTGATTA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:07418263b741
40
GATCATCATTTGCGTTGATTGATGACTTGAAAGGTTGATT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:f7ba50853094
40
AAGATACATTGTTGATTAATTGTGTTTTAATTGCGATGAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:c123b940c4aa
40
ACGCGTCCCTGTGCAATTTATCATCATTGTTGATTGATTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:3f64920a36e4
40
TGCTGGTGTGACATGCACGTTACAAATGATGATTTAATGA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:f779c6d134d6
40
GTGCCAGGTTACAATGATGGCTGGATGATTAATTGCTGTT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:d76fd6c75459
40
AACTACGTCTACACACCCATTAATCATCATTAATCAAAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:2332216b544b
40
TTGATTGATATTTAATTAACCATTGATTGATCGTCTGTCG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:1ef0d6e63853
40
GATGATTAATGGTTTCTTAATGACCTTTTTCCCAGTTACC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:9ec78f98e634
40
TGTTACCATGATAAATTGCAATTTAATTGCCTCCTGACGC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:4947a7c7f782
40
TAGTGGCTATTTATGATGATTTGATGCGCGTTGATTGATT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:07b41fcb1b4f
40
CTGAAGCGTTATTAAGTAAATTGCGGATTAATGAGTTTGC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:33ee3b933c3b
40
ATTCGTCAATACCGATGATTAATTGCTTTTCTTTTGCCGC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:085e39818dcc
40
CGTAATCATTAACCCATCAATCAAGAACATTCCAAGCCAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:3410ba21efd6
40
CCTATCATTTACCCATTAATCAACTGACGTAATAACCCCG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:374e1bbfce55
40
AAGTGAGGTTACCACATCAATCAATCATAACCATCACAAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:31bc1e1c556a
40
CCTGACTTGCTATCAATCAATCAGTCATCACTCATCTGCT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:37165fe11f25
40
TGAGCCGTAATTATATTCGCATCAATCATTTCGTCTGCTT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:64cdf999fcfa
40
TGAGTGTGCGTGATTCGTCATTGTTAATGGGAAATTGATT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:5953461fba47
40
TAGGCCAATTAATGTGTCATGATTGATTGATGGGCTAACC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:feb2315dc1f2
40
TCATCGAGAACATACACATCATTAATCACTCATTGTGACG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:38ef6569f514
40
CTTAAGTTGATTAATGTCTTTATAATGAGGGTGGCTAGAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:c2bddf9838bd
40
ACTTCAGAGTGACATTGCTGATTAATGTCTTTTTGATTAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:28793eb2b0e7
40
GTGATTGATTAGCTTTTAATTAGCTGTGGAGCTTCAACGC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:6811cf3a7585
40
TGCAATTAAAAGAACATTAGTCAAGTGGATCATTTTGTAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PBX1:PRJEB66722:R3:21b958075190
40

SELEX rounds

R3 ·final