NKX6-1_PTF1A
CAP-SELEX sample PTF1A_NKX6-1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TATATAATGGGCATCACCCTAACAACCCGTAGCACACCTA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:9f329d2fd1f4
|
40 | — | — | — |
|
ATCGCGTTAATCACTTTTTAATTGCCTCTCTACATCTGTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:f7cae10a2c02
|
40 | — | — | — |
|
AACTTAGTGATTAAATACCCATTAACTCAATTACATATGG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:551da2104b7b
|
40 | — | — | — |
|
GCTGCTCTGTGAACAACGTCATTAATTTCGCATTATGAGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:d8580daf7067
|
40 | — | — | — |
|
CATATGATTCATCCAAAGGCAAAACTTAATTAACCTGAGG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:406f5e0d0a6f
|
40 | — | — | — |
|
TATTATCATCAATCAACGGTCATTAAAAGCTCATTTCAGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:c90e401fbcc3
|
40 | — | — | — |
|
GATATGGTGCGCACATAATCACTAATTGCTATTTAATTGC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:a6b0a52d3849
|
40 | — | — | — |
|
CCTTATGGAGCTGCATGACGTGACGTAATTACAAATTAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:64b62abf5835
|
40 | — | — | — |
|
GGCTGACCGTCCTAATTGCTATTTAATTACCCGTAGACGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:e2a6fb7cc785
|
40 | — | — | — |
|
ATTTCCTCGTCACACTAGGCTAATCGTTTTTTAATTAGGC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:820b141d0932
|
40 | — | — | — |
|
ATGAATTACACTCCTGATTGCATTTTAATTACCTACGCTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:606b37ac7fb2
|
40 | — | — | — |
|
GTAAGTGACATAATTGCTTTTTAATTACGTCACCCCGCCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:8dabfef7d549
|
40 | — | — | — |
|
TCTTAGCAGCTGAGTGCGTCATTAAATAACGATTAGCTAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:f82aa81dfa71
|
40 | — | — | — |
|
TCCTACTACAATTACCATTGTAGGATCAAGCGTAAGAACA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:d6050f206c90
|
40 | — | — | — |
|
GGCACGTGAGTACCATGAACGATAATGACACTCGGCCTCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:c09baf3922c6
|
40 | — | — | — |
|
CGTCAGCATCATTAATTACACATTAAAGCGCGCTAATGAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:2d8eeb739bef
|
40 | — | — | — |
|
GTACTTCAGGGGCCTTACACTAATTGCTTTTTAATTACGG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:ec34c5813f60
|
40 | — | — | — |
|
GAACCTCGTTATGCAATAGCTCAATCAAATAACGATTATG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:505985f07509
|
40 | — | — | — |
|
TTAATGACAATTTAATCACATGGCTACGACGATTAGCCGA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:2d33dccaf4a3
|
40 | — | — | — |
|
GAGGTGTGAGCGCACAATCACCTCATTATAAACCCATTAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:4d8d650fadc0
|
40 | — | — | — |
|
AACGCTGATCAATACGCAATTAAGGGTCATTACACAGTAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:265ea63dbae1
|
40 | — | — | — |
|
ATTCCAACGTATTGTGCTGAATCAATTAAAACGCAATTAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:87e60270ed0f
|
40 | — | — | — |
|
GATCCCAATCCAACGCCTCCAGTCGTAAACGCTCCGATTT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:9a3a19e0c1c3
|
40 | — | — | — |
|
CTTAATTGATTTTGGATTACCCCTAACGATGAATTAATTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:0336791aa572
|
40 | — | — | — |
|
ACAACGTACCGGAAGTAATTAAATGGTCGTTAATCCTCAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:fc7362fc67ac
|
40 | — | — | — |
|
GTGTCCTACCGCATTTAACAGCAATTAAAAGGTCATTAAG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:01f443ede579
|
40 | — | — | — |
|
CAATGTCATTAAATTCCCATTAATTGTGTCCTTAATGTCC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:3c8c75016943
|
40 | — | — | — |
|
GGTCTGTAATTAGTGCTAATGATCGAATAATTGCCTATAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:34c3b9d3e507
|
40 | — | — | — |
|
ATGCCCTATTAGATTACCAATTAATTTCCCATTAATGAAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:51d4d3c8accb
|
40 | — | — | — |
|
AATCATGTTAATGACATGATTAGTAATTACAAAACAATTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:9b03e25a6196
|
40 | — | — | — |
|
ACGCTATTAAATGTGATTATTAAGTCATTATCTCATCAAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:6aac782a8e4f
|
40 | — | — | — |
|
ACGTGACGATGTCTCACGTCTCATTAATTCCTCATTAACC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:286e25d6aa86
|
40 | — | — | — |
|
GATAGCGTCCTGCGTATTGCTAATCGTTATTTAATTGACA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:d09bd02674d5
|
40 | — | — | — |
|
ATACGCACGTGCTAATTGTAAAATAATGACCCACTCCAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:f63434a7b2bb
|
40 | — | — | — |
|
CTAATCGAGAAATGATCGACCATCTTAATGCACTTATGAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:be752790d8f5
|
40 | — | — | — |
|
GTCAGTGTGCTACCATTGTCATTAAACTCGCATTAATCAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:8d8f1f459209
|
40 | — | — | — |
|
GCCCTAGCAACGTGAAACTAATTAAATACCCATTAACACT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:c6ca4d1a23c3
|
40 | — | — | — |
|
GATACATAATTAATTGATCATTAACAGAACAATTAAGCAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:4599a5cf8a0c
|
40 | — | — | — |
|
CTAACCTTAATTGCTTCTAATTGGATTTTAATTGCAGTAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:3268ea7e69ea
|
40 | — | — | — |
|
AGTCCCATTGTCCGTAATTACTAATTAATTGCATCAGATG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:dbbf6bf70705
|
40 | — | — | — |
|
GATAACTAATCGCTATTTAATAGCACTTAGTTACGCGGAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:a9e3bcb57889
|
40 | — | — | — |
|
ATTACGATAATTGCGATTTAATTTGCATTAAATTGTTATA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:83e4991f019b
|
40 | — | — | — |
|
GTTAATGATATATTAATGGTTCTTAATGAGTCCGCTTGCT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:d782bf0cdf3b
|
40 | — | — | — |
|
GTGACTGCAGAGACGATTATGGTTAATGGCTTTTTAATCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:6b18a280aa2b
|
40 | — | — | — |
|
CTGATCTCTCAATCATATGTCATTAAAAACGCATTTTGGA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:784ad48a87a4
|
40 | — | — | — |
|
ACCTATTAAATCGTAATTAGCCCTACACCTCATTAGCCAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:a9ab1b3e2051
|
40 | — | — | — |
|
AATTAAAACGTAATTAACTTGGTATAATGCGTCCCAAACG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:8a7e998acb18
|
40 | — | — | — |
|
TTGTCGATTGTCCACTGATGGTTAATTAATGACCATTAGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:3296183dbf97
|
40 | — | — | — |
|
CGCTAATTACTAATTAATTACCCTTCAACAGTTACAACGG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:430bbf247f8e
|
40 | — | — | — |
|
ACGCGATTATGCCCCATGATTACGTTTTAATTGCACGTAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:8e3fed496f26
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final