NKX6-1_PTF1A

CAP-SELEX sample PTF1A_NKX6-1 · 1 runs in PRJEB66722

Organism
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Sequences indexed
10,000

Top enriched sequences

More via API →
Sequence Length log2 FC P(active) Class Monotonicity
TATATAATGGGCATCACCCTAACAACCCGTAGCACACCTA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:9f329d2fd1f4
40
ATCGCGTTAATCACTTTTTAATTGCCTCTCTACATCTGTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:f7cae10a2c02
40
AACTTAGTGATTAAATACCCATTAACTCAATTACATATGG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:551da2104b7b
40
GCTGCTCTGTGAACAACGTCATTAATTTCGCATTATGAGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:d8580daf7067
40
CATATGATTCATCCAAAGGCAAAACTTAATTAACCTGAGG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:406f5e0d0a6f
40
TATTATCATCAATCAACGGTCATTAAAAGCTCATTTCAGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:c90e401fbcc3
40
GATATGGTGCGCACATAATCACTAATTGCTATTTAATTGC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:a6b0a52d3849
40
CCTTATGGAGCTGCATGACGTGACGTAATTACAAATTAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:64b62abf5835
40
GGCTGACCGTCCTAATTGCTATTTAATTACCCGTAGACGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:e2a6fb7cc785
40
ATTTCCTCGTCACACTAGGCTAATCGTTTTTTAATTAGGC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:820b141d0932
40
ATGAATTACACTCCTGATTGCATTTTAATTACCTACGCTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:606b37ac7fb2
40
GTAAGTGACATAATTGCTTTTTAATTACGTCACCCCGCCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:8dabfef7d549
40
TCTTAGCAGCTGAGTGCGTCATTAAATAACGATTAGCTAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:f82aa81dfa71
40
TCCTACTACAATTACCATTGTAGGATCAAGCGTAAGAACA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:d6050f206c90
40
GGCACGTGAGTACCATGAACGATAATGACACTCGGCCTCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:c09baf3922c6
40
CGTCAGCATCATTAATTACACATTAAAGCGCGCTAATGAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:2d8eeb739bef
40
GTACTTCAGGGGCCTTACACTAATTGCTTTTTAATTACGG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:ec34c5813f60
40
GAACCTCGTTATGCAATAGCTCAATCAAATAACGATTATG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:505985f07509
40
TTAATGACAATTTAATCACATGGCTACGACGATTAGCCGA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:2d33dccaf4a3
40
GAGGTGTGAGCGCACAATCACCTCATTATAAACCCATTAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:4d8d650fadc0
40
AACGCTGATCAATACGCAATTAAGGGTCATTACACAGTAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:265ea63dbae1
40
ATTCCAACGTATTGTGCTGAATCAATTAAAACGCAATTAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:87e60270ed0f
40
GATCCCAATCCAACGCCTCCAGTCGTAAACGCTCCGATTT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:9a3a19e0c1c3
40
CTTAATTGATTTTGGATTACCCCTAACGATGAATTAATTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:0336791aa572
40
ACAACGTACCGGAAGTAATTAAATGGTCGTTAATCCTCAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:fc7362fc67ac
40
GTGTCCTACCGCATTTAACAGCAATTAAAAGGTCATTAAG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:01f443ede579
40
CAATGTCATTAAATTCCCATTAATTGTGTCCTTAATGTCC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:3c8c75016943
40
GGTCTGTAATTAGTGCTAATGATCGAATAATTGCCTATAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:34c3b9d3e507
40
ATGCCCTATTAGATTACCAATTAATTTCCCATTAATGAAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:51d4d3c8accb
40
AATCATGTTAATGACATGATTAGTAATTACAAAACAATTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:9b03e25a6196
40
ACGCTATTAAATGTGATTATTAAGTCATTATCTCATCAAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:6aac782a8e4f
40
ACGTGACGATGTCTCACGTCTCATTAATTCCTCATTAACC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:286e25d6aa86
40
GATAGCGTCCTGCGTATTGCTAATCGTTATTTAATTGACA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:d09bd02674d5
40
ATACGCACGTGCTAATTGTAAAATAATGACCCACTCCAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:f63434a7b2bb
40
CTAATCGAGAAATGATCGACCATCTTAATGCACTTATGAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:be752790d8f5
40
GTCAGTGTGCTACCATTGTCATTAAACTCGCATTAATCAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:8d8f1f459209
40
GCCCTAGCAACGTGAAACTAATTAAATACCCATTAACACT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:c6ca4d1a23c3
40
GATACATAATTAATTGATCATTAACAGAACAATTAAGCAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:4599a5cf8a0c
40
CTAACCTTAATTGCTTCTAATTGGATTTTAATTGCAGTAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:3268ea7e69ea
40
AGTCCCATTGTCCGTAATTACTAATTAATTGCATCAGATG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:dbbf6bf70705
40
GATAACTAATCGCTATTTAATAGCACTTAGTTACGCGGAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:a9e3bcb57889
40
ATTACGATAATTGCGATTTAATTTGCATTAAATTGTTATA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:83e4991f019b
40
GTTAATGATATATTAATGGTTCTTAATGAGTCCGCTTGCT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:d782bf0cdf3b
40
GTGACTGCAGAGACGATTATGGTTAATGGCTTTTTAATCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:6b18a280aa2b
40
CTGATCTCTCAATCATATGTCATTAAAAACGCATTTTGGA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:784ad48a87a4
40
ACCTATTAAATCGTAATTAGCCCTACACCTCATTAGCCAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:a9ab1b3e2051
40
AATTAAAACGTAATTAACTTGGTATAATGCGTCCCAAACG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:8a7e998acb18
40
TTGTCGATTGTCCACTGATGGTTAATTAATGACCATTAGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:3296183dbf97
40
CGCTAATTACTAATTAATTACCCTTCAACAGTTACAACGG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:430bbf247f8e
40
ACGCGATTATGCCCCATGATTACGTTTTAATTGCACGTAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_PTF1A:PRJEB66722:R3:8e3fed496f26
40

SELEX rounds

R3 ·final