NKX6-1_TBX20
CAP-SELEX sample TBX20_NKX6-1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TTAGACACTAATTGGTTTTTAATTAGCTTTACGCCACGTA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:5cd1173c05eb
|
40 | — | — | — |
|
TACCCCCTGCTAATTGCTTTTTAATGACGTATATAAGCCT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:69c014cc679a
|
40 | — | — | — |
|
TAACGGCCTATGCGCATGTGTGAACAATTAACACCTAACT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:0a5024076ef9
|
40 | — | — | — |
|
GCGCGCAGAACGAAGGTGATAATTATTGACACCTCACCGG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:b5619e710cb0
|
40 | — | — | — |
|
TAAGCCACTAATTGCATTTTAATGAGTGTTAACTAACCAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:a29d0c38fdc4
|
40 | — | — | — |
|
CTATCAATTGTCTTCGCGTACCGCTTAATGACATTTTAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:908b6ffc8a2a
|
40 | — | — | — |
|
TTAATTGCTTTTTAATTATCCGTTGCACCCTACCACTTTT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:ffce3fc77be2
|
40 | — | — | — |
|
TTTAAATGAGGGTCATTAAAAACGAATTAGCGTCAAACTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:31b7affa7f9a
|
40 | — | — | — |
|
TGTCCGGTATTAGTGGCAATCCCACTAATTACCTTTTAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:90a08a919955
|
40 | — | — | — |
|
ATTCAACTCACCCGCTGATTCGCTTAATTGCTTTTTAATT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:56b14065c130
|
40 | — | — | — |
|
TAGATCATTAATTGCTTTTTAATTAGTGAGACCGCCCTAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:ae834e731a59
|
40 | — | — | — |
|
CCTCATAGCACATTCCCTACCTTGTTAATGCGAATTTAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:5ef4cb8d48b7
|
40 | — | — | — |
|
TCGGCGACCATGCTAATTGCATTTTAATTACTACAGTCAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:26f92b25e777
|
40 | — | — | — |
|
TACTAGGTGATAATTGCTCACACCCCACGGTTAGAGCAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:496b4507ed9c
|
40 | — | — | — |
|
CTCTCGGCTTCCCGCTAATGACATTTTAATTACCCTTCCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:213e6f6a3a7c
|
40 | — | — | — |
|
GCCACGTTTTATGAGGTACATTACCTAATTACTTTTTAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:99c173e93987
|
40 | — | — | — |
|
ACGTGCATAGCAATTAAATTCCCATTAGCTCAGCCAGTTT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:d54e251b14f8
|
40 | — | — | — |
|
CTTCACTTAATTGCCTTTTAATGACCCATGTGCGCAGATG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:634637cf4454
|
40 | — | — | — |
|
CTGGCTGGAGGCTAGTTAATCGCTTTTTAATTAGCCTACC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:0422eb83c67c
|
40 | — | — | — |
|
GGCATAGTAATTAAAAACCCATTAAGTAGCCTCCGACCGC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:56a1b911c52e
|
40 | — | — | — |
|
CCATCACGGCGCCAATTAAAAAGCAATTAATGGCTCTCAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:fd9a185367d7
|
40 | — | — | — |
|
TTTACACTTAATCGCTTTTTAATTACTCCACGAGTGCGTA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:69e135ec167f
|
40 | — | — | — |
|
TGCCACTTGGTATAGCTTTTATCACTAATTGCAATTTAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:1b90818ae873
|
40 | — | — | — |
|
TGGTATCGCGATCTCTATCGGACATTAATCGATTTTTAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:8ca0277f991a
|
40 | — | — | — |
|
ATACGTGCTAATTGCTAATTAATTACACCGGTACCCCGTA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:12b3a17475f3
|
40 | — | — | — |
|
CGCCCTCTCTAATTACTTTTTAATGACCTCTGTCACATGA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:c9d721507c13
|
40 | — | — | — |
|
TACACGTGTGACTAATTAACACTTTTGGTCTCTTTCGTAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:f98c4b8c76f0
|
40 | — | — | — |
|
TTGATGTAAGTTCGTTGCGATGAGTTAATGGTTATTTAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:d0bf36b8d404
|
40 | — | — | — |
|
CTGTTTAGTCAGTCGTGTCGTTCGTTAATTGGTATTTAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:389f0d7dcc65
|
40 | — | — | — |
|
TAACGCATCGTCATTAAAAACCAATTAGCGAATATGAGCC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:bc0af0c0030b
|
40 | — | — | — |
|
CTCTAACGACTTAATGCGTTTTTAATTGCCCACCAAAATC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:0d0ac384afe0
|
40 | — | — | — |
|
TCCCAGCCTGCCCTGGGGTAGTCATTAATAACCCATTAAG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:9c0a9c9a20d0
|
40 | — | — | — |
|
CAATCCAGCTTCTCGTTGGCCTTGCTAATGTGTTTTTAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:cc4f0a2b214a
|
40 | — | — | — |
|
CAAGGGCGTACACTAATGAGTAATTAATGACCTAAGCCTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:b4868512c108
|
40 | — | — | — |
|
ACGTACAACGCACCACTAATGACAAATTAATCACCTGTAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:d1186751e80c
|
40 | — | — | — |
|
TGCAGTATGAACCCTAATTAAAAACTCATTAGCCTTTCCT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:428157ff99c2
|
40 | — | — | — |
|
GCCTAGACTCATTAGATATCTTACTTAATGGCTTTTTAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:fbe9564b840a
|
40 | — | — | — |
|
TTCCAATTATGGTAATCAAATCGCAATTAACTCAACATCT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:742a49ab9c1d
|
40 | — | — | — |
|
TTTGTTGTTGTGTTGGCACGTGTTAATTACTAACACCTAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:7c9e4b2a0d7e
|
40 | — | — | — |
|
AAGCGATAATTAGTTTTTAATGACCCTCTCCTGCCGTGTG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:9d4f7ce9c784
|
40 | — | — | — |
|
CTAATTGCATTTTAATGGGCCTATAGCTTGACGCTAGCTC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:774618b5d542
|
40 | — | — | — |
|
CCTTTCTACCCCTTATAGCTATCCTAATTGCTTTTTAATT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:f5c8c5d75f75
|
40 | — | — | — |
|
CGTTAACTAGTAATTAAAAAGTAATTAGGCATAGTTGCCG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:8f5c072f42da
|
40 | — | — | — |
|
CTATTGGACTAATTGCGATTTAATGAGCCGATCATCCCAG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:f59f3f32b243
|
40 | — | — | — |
|
CCCATTCCCGCTAATGGGTAATTAATTACTCTCGCTCTGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:00e2d86d8418
|
40 | — | — | — |
|
CCAAACTTTGTTTAGGTGCCTTTGCTAATTGCTTTTTGAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:74d37c878310
|
40 | — | — | — |
|
TGTGGCCTTTCAGGTAATTAAAAACGCATTAGCTCCGTCC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:f171bb4b86ae
|
40 | — | — | — |
|
GCCAATTTGACACGATAATGAGTAATTAATTACTCCTTGT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:7922d62fed9f
|
40 | — | — | — |
|
CATTGGCCACACTGAAACTGCGACTTAATCTGTTTTTAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:f3743c580d72
|
40 | — | — | — |
|
TTCCGTAAACGGGTCTATGTGATATTAATTGCATTTTAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_TBX20:PRJEB66722:R3:afd97b678fe5
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final