NKX6-1_XBP1

CAP-SELEX sample XBP1_NKX6-1 · 1 runs in PRJEB66722

Organism
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Sequences indexed
10,000

Top enriched sequences

More via API →
Sequence Length log2 FC P(active) Class Monotonicity
TCATTAAAAAACGATTAACGCGTACCTGCACAATGACATG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:ecd98d02cea8
40
CGCCACCACCTCACCTAATTGCTATTTAATGACCCCACGC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:5869d193dcc6
40
TCATTAACGCTAATTGTTTTTTAATAGCGTATACCGCAGA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:0107ead96e8b
40
TGCTCCATACGTGCTAATCGCTATTTAATTGCCTGCTCTC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:80f00743f868
40
GAATGGCACTTAATTGCATTTTAATTACATCAGCCATGAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:6352083f6eb4
40
CCAATTAAATGCTCATTAGTGGGAACGCGACCTGCCGAAG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:ac59e5f32803
40
ATGCTGAGACGATGAGCCAAAGCAGTAATTAAAAAGCAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:c4d42b1eb7f5
40
TAATTAAAAAGCAATTAACCATCCAACTCCATGCTCACTA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:1f3dadb0f8aa
40
GCATATTGCCTGTCTCATTAAATACCCATTAAGCCGAATC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:9e5002de3042
40
CACGTCCTAATTACAATTTAATTACCCAATGTGCGTAAGA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:e86fe2d5051b
40
TAAGACTGCAGGTCATTAAAAACCCATTATCGACCATATG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:832e27fc76fe
40
ATACCTAATCAAAAAGCAATTACGGTTGTACACGTCCGTT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:59943b4a401e
40
CATCACTGCTCAATTTTGCCAATGCTAATTAAAAAGCAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:9f857668d7d4
40
CGGAATGCAGAAACGTGAATTAAGCTAATTGCTTTTTAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:32d12f36c63f
40
ATTACCCTCATTAAAAATCAATTAACGGTACTTGACCTGG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:6daab4e35fdd
40
GTTAATCCCCAAACAATTAAAAAGCAATTAGTGGCCTATG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:a828d6418062
40
TCATTAATAAGCAATTAAGCTAATAGAGACGATGCAACGC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:bd3ab557843f
40
GCCGCCTGATAATGAGTCCTATCGTTAATTGCTAATTAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:2980e8026b3f
40
GAAACAATCAACAGCTAATGCGTAATTGATGACGATGTAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:a0665fa21f46
40
ATTCCCTTTAGCTCTCAGTATGACGTAATCAATAACACAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:8aa6e737a597
40
CCGACGCGTGCCTCATTAATTACCGATTAACTCCTTGAAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:91ccccb352f1
40
CAGGCAATTAAATATCGATTAACCGACTACCCCCACCGGC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:4c7c5dadc718
40
CATAATGTCATTAATAAGTCATTAATACCTACCTCGCCCC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:d0e83b752095
40
ACGGCGTAAACCCATCAAAAAGCAATTAGCGTGTCCCGGA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:1838f42525f3
40
GCGACAATCAAAACGGGGCAATTAATTTGCAATTAGGGAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:4fe7ca2f5e90
40
TATGACTTCAGATGAGGAGATAATTGCGATTTAATGGCCC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:9ef7a1e085a3
40
CTGACACGCACTTTCCGCGTATTAAAAAGCAATTAGCGAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:66560c7ea836
40
CGTGGGTCATTAAATATCAATTAGGGGAGACTCACTACTC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:6821702cc684
40
ACTTGATTACCTTATAGACTGTCGCTAATGGGTAAATAAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:aeb06d9b83ce
40
CCCAACGCAAACGCATGAACAGATCTCATTAAAAACCCAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:a3c525beb655
40
AGACAGCCTGCCCTTTACTAATGGCTAATTAATGACGTAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:ca8eb330ac22
40
AATGTCTTCCCCGACGTCGCTAATCGGTTTTTAATTGGTC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:d2f9756da71d
40
ACGTGCCTGAGCTGCGTCTCAGGCCTCATTAAAAACTCAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:da4e9581fcb2
40
AGTCAGGTAGCAATTAAATAGCAATTAGCAGGATATACCT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:feddc55df850
40
TAATCAAAAACCCATTAACGGTAAGCGATCAAAACTCAAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:cc8738098220
40
AAAGCCTACGCCATACACCTATTGGCAATTAAAAACCCAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:ecef4227dd1f
40
GTGACCCTACGACTGGTAATTAAATAGTCATTATGACGCA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:dd4867fc6f67
40
CCCTATGACCATTAACGCGCATATAATGACGTCATTAACT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:4d1f9bc6043e
40
CGAACACTAATGGCGTTTTAATGACCCTATAGCCCTCGCG
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:a8f49d10c243
40
TGACCGCCCGCTAATTGCAATTTAATAGCATCATAAACCT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:69ecd7706a08
40
GTACCATTGAACGTTAATGAACGCGTCATTAAAATGCGAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:29f33cc2eccf
40
TCTAATTAAATAGCAATTAAGGCGACACCCCTCGTGGCCC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:097f179d4226
40
ACCCACAAGCCTAATTAAAAACCAATTAAGCCGTAGCTAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:38b572aec245
40
GGACGTTGAACACTAATGAGATATTAATTAGGTCTCGTTC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:8855895d6f88
40
CACGCGCACTAATGACCTCCATTCAGTGATGACGTGCGCT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:97632da7bd63
40
TCGCCATTAATTGCTTTTTAATCGATTTCTGTACATGTAC
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:a78111693aab
40
ACACCCTAATCAAATCGTAATTAACGACACTGCAAAGCTA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:62c305ffa36d
40
TGAGACACGTAATTAATTAAATCGCAATTAGCACCTGTAA
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:71df2a1b8456
40
ACGATACGCCGCCAAGCCCTTATGGTAATTAAAAACCGAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:74105b5345da
40
CACAGGCGACACTGCCAACCGAGTGCCATTAAAAACCCAT
PANAPTA:P78426:NKX6-1_XBP1:PRJEB66722:R3:771037cacf8e
40

SELEX rounds

R3 ·final