NOVA1

NOVA1_GT40NACGATC_AAU_C_Cycle1; NOVA1_GT40NACGATC_AAU_C_Cycle2 · 4 runs in PRJEB47428

Organism
Nucleic acid
RNA
Rounds available
R1,R2,R3,R4
Sequences indexed
10,000

Top enriched sequences

More via API →
Sequence Length log2 FC P(active) Class Monotonicity
AAGATGGCCAATTGGCAGATATGATGAGGTGGGAGGCGTT
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:0e37a6701319
40 14.69 0.48 strong_positive 0.67
TGTGGCCAAGGTGGCGGTAAAAATGATGCTGGTAGGTGGG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:26b048d8503a
40 14.64 0.49 strong_positive 1.00
TAATGGGTTTGATGGGGTGATGAGTTGATGGAGATGGTGT
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:42130dbe395b
40 14.49 0.83 strong_positive 0.33
AGATGGTGGTGGGGATGGAAGGCCTGTTAACAGCATGAAA
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:c81121f4c85d
40 14.49 0.75 strong_positive 0.67
CTGATGAATGTTAATGAGTATAATGCCTATAGGTTGATGG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:a1e810b3a1f1
40 14.41 0.78 strong_positive 0.67
TTTAATGGCCTTAGAGGCGGAAGTAATGGTTGAGGTTAAG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:1294e7e66e71
40 14.38 0.49 strong_positive 0.67
TATGATGATGATTGGGAGGGACTAGGGTGATGATGGTGAA
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:ebad45ebf27d
40 14.35 0.83 strong_positive 0.67
TTGATGTAATTGTTTTATGAATAATGGCTGCGCAGTGGTG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:26536caca471
40 14.32 0.73 positive 0.00
TAAGAGATGGCCAATTGGCGATATGATGGATGGGATAGTA
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:aa3c5d54cf94
40 14.28 0.68 strong_positive 0.67
AATGGCCTATAAGGCGGTGGTAATGGGGGGGACTGCGGTG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:ab9867b8db91
40 14.19 0.32 strong_positive 0.67
AATGATGAATGAAAATGAAAAATGCGCATGGGAGGTGATT
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:4350361d78aa
40 14.08 0.79 strong_positive 0.67
GATGAGGTTGGGTTAATGAGAGCCGCGGATGACGGCGCGG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:287722b4742e
40 13.97 0.65 strong_positive 0.33
AATGGTTAGGATGGTTGTTGTGGCTGCAGCTGCGATGATG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:239f9796370e
40 13.89 0.68 strong_positive 0.33
TCAGTGGCCAGTAACCGGCAGAAGTAATGAAATGGAGGGG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:0855a5d7b5b4
40 13.89 0.56 positive 0.00
GAGGTGGCCTAATGTAGGCGGACAAATGAGGTTGGTGGGT
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:91d6e4aa2c33
40 13.89 0.28 positive 0.00
TCGGTAATGGACTTGTGTAGATATGGCCTTGGTTAAGGCG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:ee9944196baa
40 13.89 0.11 strong_positive 0.33
TTAATGGACTTGCAAGAGGAAATGGGTGGTACCCGATGAA
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:7e7631af31f0
40 13.89 0.26 positive 0.00
GAGAGTGATGGTAATGATGGGAATGACGATGATGTGATGA
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:53dee6ee3c2a
40 13.85 0.76 strong_positive 0.33
TAATGATAATGTGGGTGGGCGTGAAGCTGCTTCGTGATGA
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:0c0911f94a96
40 13.81 0.78 positive 0.00
TGATGAGTAATTATGATGATGGGGGCAGCTGCTTTTATGG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:022603993957
40 13.81 0.78 strong_positive 0.33
TTAATGAAACGGGGGGGGATGATGGATGCCGGCGATAGGC
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:001d4308777e
40 13.67 0.72 positive 0.00
GTGTGAAGTGGCCCAGAGGGCAAGTTGATGGTTGTGGGAT
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:20939c3e3efb
40 13.62 0.31 strong_positive 0.67
TATGAATAGTTGACTGTAATGGTTCATGCATGAAGATGGT
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:c313c1e89ea6
40 13.62 0.76 strong_positive 0.67
TAATGAGGTTTATTGGGGACGGTTAGCATAACCAGTGATG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:1db11008a019
40 13.57 0.75 positive 0.00
TTGATGGTGATGAAAGGGTGATGATGTGGCGAGTGATGGT
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:7c450c9c0ed7
40 13.57 0.79 positive 0.00
AGTGGCAGTGAACTGCGGTGGTAATGGTTTTGTGTAGATA
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:42e313f37ad9
40 13.52 0.27 positive 0.00
TAATGAGTGGGATTGTACGTGCAGTACGTAAAAAGATGAA
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:dcd5d6a12162
40 13.46 0.84 positive 0.00
TGATGATGGGTGAAAAATGATGAGTCGATGAGAAATGAGT
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:a84a6cf15ecc
40 13.46 0.85 strong_positive 0.67
AGTGGCCCAAGGAAGACCAGGGCAGATTAGTATGGTGGTA
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:5aa3b4f3d3a0
40 13.41 0.18 positive 0.00
TGATGGCGCATTGAAGTTGGCGGAAAGAAGGATGATTAAG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:09fe69116b5a
40 13.35 0.77 positive 0.00
TGATGGATGGCACTTTGGATGCCAGATGTGGGCGATGAAA
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:f286c15bac53
40 13.29 0.73 strong_positive 0.33
ATGATGATGTAGATAAATGATGGACTTCGAAGTTAGGGGA
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:c553300d7830
40 13.29 0.79 positive 0.00
GATGATGATGTTGGAGGGAAGGTAATGGTGATGTGTGGTG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:94f97dcda9e1
40 13.29 0.82 strong_positive 0.33
TAATGAGGTGATGTAATGTAGGTTAGTGATGCGATGATTG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:d481fa146afa
40 13.29 0.84 positive 0.00
AGATGGCGGTATAATTGTGATGAGTGGGCTGGGTGCTCCC
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:c9bbcd6eb6c8
40 13.29 0.71 positive 0.00
CTAAAAAAATGAAAATGTGAAGTTGCAACTAAGGTGATGG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:87ec98393393
40 13.22 0.70 positive 0.00
TAATGAAATTGGGTAGTGGTGGCCAACATGGTTGACGATG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:c1f8ebee7aec
40 13.15 0.77 positive 0.00
CGGTGATGAGCGTGCTGGTGGCACATGAAAAGATGGAGAA
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:08656290c67a
40 13.08 0.64 strong_positive 0.67
AATGAAAGCTTCCTTTGTTGAAGCCGGTGGTAATGGTAAA
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:a72342b17070
40 13.08 0.72 strong_positive 0.67
GAATATGAAGATGGTTTTTGGTTAACTTGCAAGCTAGATG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:de199daf60fe
40 13.01 0.66 strong_positive 0.67
GGATGGAATGGGGTGGGTAAGTGAATGGATGCCGTTAGGC
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:93a3f5e40cce
40 13.01 0.71 strong_positive 0.67
TAGGCGGCCTGACGGCAGAATGATGGTTGGGGTGTGTGGC
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:373482303b07
40 13.01 0.35 positive 0.00
AGATGGTTGATAGCGTTGTATGGATGTACCGACGAGGCAC
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:88c384cca997
40 12.93 0.53 positive 0.00
TGATGAGATGATGTTGGTAGGTAATGAGGGGTTGGTGGTG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:a54cced488ee
40 12.93 0.82 positive 0.00
TTGATGTTGATGAAGATGGAGTTAATGGAGGCGAGGAATG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:9e5ca6c23a5f
40 12.93 0.78 positive 0.00
GCGATGGCCGTTTGGCGGTGAGAAATGTAAATGTAGTGGG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:6f0a4f13838e
40 12.85 0.54 positive 0.00
TTAATGAATGGGAGCTAAGCACGCGTAATGGTCTTTGACG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:efda9f35e01f
40 12.85 0.54 strong_positive 0.33
GATGAATGTGAATTTTCCGGGTGAGTGATGAATGATGATG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:6edb1e087c2b
40 12.85 0.80 positive 0.00
GATGAGGTGAAGGTCCGCGCAGACGATGGGTTTGATGATG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:1c469dd28c20
40 12.85 0.74 positive -0.33
ATATGATGAATGTTATGGTAATTGGCATGCATGACGATGG
PANAPTA:P51513:NOVA1:PRJEB47428:R4:03a970c0ce94
40 12.85 0.76 positive 0.00

SELEX rounds

R1 R2 R3 R4 ·final

Structural & language-model features

JSON ↗

Pre-computed feature catalog (paths only — files served separately).

Residues
507
FASTA
ESM-2 mean
ESM-2 per-residue