OTX1_TBX20
CAP-SELEX sample OTX1_TBX20 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ATCCTGTTGATTCGTGCTAATTCAAACTTGGATTAGCACG
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:1941f9a1f0df
|
40 | — | — | — |
|
TTAAATCCGTTAACGTGGCGGATTAACAGCATTACACTCA
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:41feaf97ece2
|
40 | — | — | — |
|
GCCACCTCGCGCTGGAGTAACACTTGCGTTAATCCGTTAA
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:6a90b1cde619
|
40 | — | — | — |
|
AACACGATGACGCTACGCCACGCGTACCCGATACTATCGC
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:76d24ef10115
|
40 | — | — | — |
|
CCTCGTTAAGCTGATAATATCACGGATTATCAGTCTTCCA
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:0496c5ffa1fe
|
40 | — | — | — |
|
TATTTTAAGCCGTCCTTCCACCGACGAACTGACTCCCCTG
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:96198dc9d3cf
|
40 | — | — | — |
|
GCAAACGCGATACTGCGTCATAATCCCTTACCTAATCCGC
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:f2c381d80db4
|
40 | — | — | — |
|
GCGTTAACGGATTAGCACTTAATCACCACGTCTTTGTCGC
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:156ab2be6bcd
|
40 | — | — | — |
|
ACAGCTTGAAGGTATTATCGTGACATAATCCGTCCTCCAT
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:8ab778b77f6c
|
40 | — | — | — |
|
TTTCGCACCGCACATCAGTGCGATAATCGCGGATTATAAC
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:42c503d136ec
|
40 | — | — | — |
|
ACGGATTAACACGATTGCTATTAATCCTTCCGTATTTCAC
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:010a34a459e1
|
40 | — | — | — |
|
TCACGGATTAACACCTTAATCTGGCAAGGCGTTATAGCGC
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:287b67ff415b
|
40 | — | — | — |
|
CCGGATTAAGTGTGATCCTGTGGCGGCAACGTGCAAATCT
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:0f79559519a9
|
40 | — | — | — |
|
AACACTTAATCGGCTTAACACTCCCAATAACGTTAAGTTA
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:1e35f1eea906
|
40 | — | — | — |
|
TAAGCAGTGTCAACGTGACGTAATCCCTCAACTGATTAAC
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:ed4885405677
|
40 | — | — | — |
|
TATACTGCACCCCTGCACGCCCGTAGTAGCTATAGCTATC
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:d85d845c8718
|
40 | — | — | — |
|
GCCGATCCTTAACTGGCGATAATCCGTTAATGCCACTTTA
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:0c7257bb5a4c
|
40 | — | — | — |
|
AATCATGCTAACTCGACGGATTAACGCTTATCACCTTTCT
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:43d142a05c14
|
40 | — | — | — |
|
GTCACACCTTGCCGCATTAGCGCCATAATCCTTTCAATGC
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:fc909b953848
|
40 | — | — | — |
|
GACGGATTATCAGCTAATCACCCAGGAAAACGGCTGATAC
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:a60a9074549e
|
40 | — | — | — |
|
TCGCAACTCCTCACTGCAACACGTTCTCTATCGGATTAAA
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:d5a197cf3d41
|
40 | — | — | — |
|
CAGGATTAGTCACCTTAATCCCCATCGTACGTGTTACGAC
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:ad49be71ed86
|
40 | — | — | — |
|
GTTTGCACCTTATCACTTAATCCTCAGTTAAGCCGCACGT
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:a3e8e3e68327
|
40 | — | — | — |
|
AAGTAGGTGTTAATCCGACATACGTTGCACCTGATGGAAC
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:c1aa6435ba35
|
40 | — | — | — |
|
CCTTAAGGATTAACGTGTAATTACGAATTCACGCATTTAC
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:165b2f418dcf
|
40 | — | — | — |
|
GCGAGCCACATCCCTGATAACTGCTAATCCGTTAATCACG
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:a15201142c38
|
40 | — | — | — |
|
GAGAACATTCACTGCCCATGACCCACGACACAGGTGTCAA
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:8140d3be7824
|
40 | — | — | — |
|
GACACCCACGCGCGTTAATCCGGGACTTCGATGGTGATAA
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:25bf9e37f691
|
40 | — | — | — |
|
CGAGTGTCAACTGTAGCTTACAACGGATTAACACGGATTA
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:59a1416bc869
|
40 | — | — | — |
|
TGCAATAAGTAACAGATTAACGTGTTTTACTCGTTAATTC
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:fb183cc5899f
|
40 | — | — | — |
|
GGTGATAATCCGCTACAGTAAGATTACACTATCTTACCTA
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:2215c28b3434
|
40 | — | — | — |
|
GGCAGGGGAAGGTTAATCCGTTAATCTCACAGGTTCATGC
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:9633a3e9dd7e
|
40 | — | — | — |
|
CGCACTACATAATCCGATTAACACGCACTAAGCATACCTC
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:1fd59e314f7d
|
40 | — | — | — |
|
TTTCACAGGTACACTGACTGTTAAGCTGTTATTTTGGCAC
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:107c737dee81
|
40 | — | — | — |
|
GGTCTACTGTTGGATTAACGGATCATATGTGTTAATCTCA
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:2c2b72fd116a
|
40 | — | — | — |
|
CGCGGATCAACACTTCCAAGTGTAAGGATTAACTCTTCTT
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:5a645a9f19d1
|
40 | — | — | — |
|
CACACCTCGACACGTAATGGTCGCCCCATATTACTAGCTT
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:dea5d5be1774
|
40 | — | — | — |
|
GACGATAATCCGCTTATCCGACGCCTCGTGGTGACGCGTT
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:0db4d9ccbc98
|
40 | — | — | — |
|
AGCGACTTGCCATCGACACGCGCTAAGCTGTTAATCCTTG
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:500ed910616a
|
40 | — | — | — |
|
ATGCTTAATCCGCTCCACGCGGATTAAGGCGTAGTAGCCT
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:69c6ebab8b63
|
40 | — | — | — |
|
TACGCTATACGTGGGATAATAGCTGTTAATCCGCGAACTA
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:5c83c4439b22
|
40 | — | — | — |
|
CAACACGATGGCACATCACACCCTAACATAATCCCCCTAA
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:1bc3a731b58d
|
40 | — | — | — |
|
TTGAGAATTAGCGCGAAAGCGATTCCGCTAATCCTCGTCT
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:3ef727b8f89e
|
40 | — | — | — |
|
TGATAGGATTACCGGCTTAACGAGATTACACTCTGCAGAT
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:f291755b0e6b
|
40 | — | — | — |
|
AATCGTGATGGTGATAATCCGATTACAGTAGAGTGTGTTA
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:1c6a1ffd37b8
|
40 | — | — | — |
|
GGTGTAAATTCGCGGATTAACACGAGTTGTTGTCGCATAA
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:782785ef5ef7
|
40 | — | — | — |
|
TGCCACATTCCCACTCACACTAATCCTGTACGGATTACCT
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:8c769de55512
|
40 | — | — | — |
|
AGTGCTTCAGTGTGAAGGGATTATTTGTGAACTTGGCTAA
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:79d45fa7e44b
|
40 | — | — | — |
|
GATAATCCTCTCAACTAGTTATCGAATTATCTAAGCACAT
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:2a0f610f13d7
|
40 | — | — | — |
|
TGGCCACCCTGGTGCTACTGCACTAATCGGATTATCGCTT
PANAPTA:P32242:OTX1_TBX20:PRJEB66722:R3:a396fadd1f7e
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final