OTX2_SOX11
CAP-SELEX sample OTX2_SOX11 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CATTTCGATCCCATGTCCTAAACGCATTGTGCACGTGGCA
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:c9330fae76ae
|
40 | — | — | — |
|
ACGTGGATTAGAGACACTAATTCACCGCAGCGCGTCCGTC
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:3a3bb67e4ca0
|
40 | — | — | — |
|
GCTAATCACTACGAAGACACGATTATTGTGCCTACGAGTA
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:dd34a9813137
|
40 | — | — | — |
|
AATCCCTTTGTTTTCCACGCAACAATAGCATTGTTCGGCC
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:82b9c6041bb5
|
40 | — | — | — |
|
CCACCCAACCGGCGAACAATGCGTCATTGTTCGAGACCAT
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:f178ad566b2e
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCTCACAATTACATTGTGATAGTTTGGCATTGTCCCT
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:a39314e89197
|
40 | — | — | — |
|
AAGAGACTTATCAAACGCATTGTGTGCAGACACTATCGAT
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:575bf70cab88
|
40 | — | — | — |
|
TGACGATGGGGATTAGACAATCCCTTTGTCTAATTCAAGT
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:1a7be5c95807
|
40 | — | — | — |
|
GCCGCATAATCGCATTATGCATGTCATTGTGTCATGTGGC
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:08e9c462fa8f
|
40 | — | — | — |
|
CCGCGGTGACGACAATGTTATTGTCCATGATCCGATGTGT
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:97bb8a86098f
|
40 | — | — | — |
|
TGCGATAATGCACTCAGTTTTACGGATTATCGCACCCAAT
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:db85b0c615d4
|
40 | — | — | — |
|
GCCGAATTATGAACTCATAATGCCGTAATAGCCGTAGTGG
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:ab84692e9b72
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCGTAACAATTACGCATTGTTATTGCATTATTAACTC
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:62b372fd4f02
|
40 | — | — | — |
|
TCGGCTTTAGATTAACGCGACCCCGCTTAATTTAGGTCAT
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:86dedf38080d
|
40 | — | — | — |
|
GAGCACGTAATCCGCTTATTGTTCCCCGAACAATCGGAAT
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:f7c3aa0e1166
|
40 | — | — | — |
|
GGCCATTTCCACCTCACGCTAATTCTCGTGGATTAGCACA
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:2d95ad5a9b21
|
40 | — | — | — |
|
TCGACTAGGTGTAACGCGAACAATAAGCATTGTTCTGGTA
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:ad0bc491e284
|
40 | — | — | — |
|
CCACGGAGAATAGCATTCTCCCGCACACTACGTCCACCCA
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:2f1626d9aabf
|
40 | — | — | — |
|
CCCCATAATACCCCAACACAATATGCCATTGTGTGTTCCC
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:b5df1fb5dd4e
|
40 | — | — | — |
|
GTCACCCTTACGTGACCGTCGGACAAAGCCCCTTTGTCCA
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:f4c71b8231a6
|
40 | — | — | — |
|
CCGCACAAGGCCGTACCACAATGTCATTGTGCGCCATGTG
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:e20d684f47c5
|
40 | — | — | — |
|
GACAATGCATCGCGTAATCCCTATTGTCTTTAACGCATCG
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:26ec4cebbaa5
|
40 | — | — | — |
|
GGATAATCCGCCAACACCAAGGATTATCCGGTGTACGCAT
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:a92cbf24720a
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCATCGACAATTGCATTGTCGCCTAGGCCACCTATCC
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:621e7f527ab1
|
40 | — | — | — |
|
CCCTTAATACGCATCGTGAATTGCATTCAGATACGGCTTA
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:ae44172883c4
|
40 | — | — | — |
|
CAACACAATTCACAATGGATTAACGATACCATTAATCCGC
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:5df187717908
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCTTTGTTGCTCATGACAATGGTAGTGTGTTCGCGAT
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:b5dbeddc241d
|
40 | — | — | — |
|
CCTCTGAAACAATGAACATTGTTGTTCACTTTATGCACGC
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:380dc5c78ef5
|
40 | — | — | — |
|
CCAGAGCGTGGGATTACAATGACGGCAATGTATTCCCCGA
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:6daad656fb2d
|
40 | — | — | — |
|
ACACAGTCGTTAATCCCCATTGTTTGCGTACAATAGGCCA
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:ee6d1b48647b
|
40 | — | — | — |
|
CCCCGTAACAAACAAAGGCGCTTTGTTTCAAGTCGCATTG
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:6579f29053c9
|
40 | — | — | — |
|
AATCCCCGAACAATGTCATTGTTCGTTTTCACTAGCCCTG
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:5c2b307ba06f
|
40 | — | — | — |
|
CATAGTTGTGAAACGCGAAACAATGACATTGTTGAGTGCC
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:eace0f01d494
|
40 | — | — | — |
|
AATCCACCACGACTGGATTATCAGCTAACACCCACACAAA
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:1ec93f1a17f4
|
40 | — | — | — |
|
CAGGAAATTATGTCTCTACATAATCCATTATGTTGCCCGA
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:9541326f10b6
|
40 | — | — | — |
|
CCGTCAAGATAATGTACATAATCCACCATTGTTGAGACGC
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:9617fa757ec0
|
40 | — | — | — |
|
CCTGCGGACACAATGCAGTATTGTGTAGCAATGTCCCAGA
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:b11a853d14b1
|
40 | — | — | — |
|
CCACCAGCTCAAACAATAGCATTGTTCACTGAACTGCAGG
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:b7efecc37320
|
40 | — | — | — |
|
AATGCGATTAGTCATGTCCTTTGTCACACTCCTCACTGTG
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:879c36bd8864
|
40 | — | — | — |
|
TGCCCGTGTTAATTGCTATCACAATGCGGATTAACACACC
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:5a6f8a57a814
|
40 | — | — | — |
|
CCAGACAATACCATTGTCGGTTCTGCGCGAGAACACGTAC
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:1e030b01eedd
|
40 | — | — | — |
|
AATACGGATTAGCATGAACAAAGGACGCAACATCGAGCGG
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:a3ac9291f035
|
40 | — | — | — |
|
CCTGGGATGTACAATGATATTGTATCACCGCTTAGCCGTA
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:65a9fa6e0e03
|
40 | — | — | — |
|
CTCGGACAATGTGGTAATTGTCCTTGTGGATATAGAGCGC
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:47a167085ace
|
40 | — | — | — |
|
CACAATGCCTGCTAATCATTGTGTTAATCCGCCGACCGAC
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:403f154a802f
|
40 | — | — | — |
|
GGTAACTCATGCTAATCCCACAATGGGGGATTAGGCATAC
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:323a8492ff87
|
40 | — | — | — |
|
CCATTGTTTACGTATGACAATGACATTGTTAACCGGTTCG
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:a62d3f60df2e
|
40 | — | — | — |
|
CCTACCCAGACTATCTTGATCCGTCGGACTGCCAGCTTTC
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:308cc9f3494b
|
40 | — | — | — |
|
CTCGCGCGCACAATGGCATTGTCCGCCTGAAATCTAGCAC
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:d88c0e7833d3
|
40 | — | — | — |
|
CACCCGTGTCGAACAATGACCGGTATTGTTCGTTTGTCCT
PANAPTA:P32243:OTX2_SOX11:PRJEB66722:R3:c097ff59ca88
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final