OTX2_TBX21
CAP-SELEX sample OTX2_TBX21 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AGTGTACAAGTGTTAAATCAAAGGTGGGAAATCTCGTTGT
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:f8da5e308c68
|
40 | — | — | — |
|
TAGGTGTTATTGTCACGCAAAACTGTTTGGGACACGTTCT
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:4b158560f42e
|
40 | — | — | — |
|
AAAACATCGTCAAAACTGTACGTAACATGTTAAGTCACAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:32671be56299
|
40 | — | — | — |
|
CGTCACGAGGTGTGACTTATCTTACACACCTTGTTGATTG
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:e83da039f1fc
|
40 | — | — | — |
|
GCGCTAATAAGTGACAAAACTAGCTGCAATGTCCCAACAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:3ace4c9f934d
|
40 | — | — | — |
|
CTTATCTCACATTAACACCTCCACCATTGAATTGCAGTTA
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:7e219c0c1072
|
40 | — | — | — |
|
TTCTAACACGGTTGGCCCCGTGCGATTTCCGACACCTACT
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:1428b715d348
|
40 | — | — | — |
|
CCACGGTATGCGTTAAGGTGTGAAGTTTAGATGACACCAG
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:f176d2681f14
|
40 | — | — | — |
|
TTACCAATGACCTATCCACACTAACACGATACTCCCACAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:58a5f329c26d
|
40 | — | — | — |
|
GGCCCTGATGTGTGAAACACAAGGTGCCACAACACTGGAG
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:ad66e59aee6d
|
40 | — | — | — |
|
TGAGTGACAACTAAACATGTCCGCATTAACACTAACACAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:ce0e440fe4ce
|
40 | — | — | — |
|
CATAACACCTTTGCAAATAGCTCAACCACTGACCTAGACT
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:222745b7733d
|
40 | — | — | — |
|
CACATCTAGCCTAGCACCTGACGCTCAGAACACACCTATT
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:9da61931b064
|
40 | — | — | — |
|
TGTGAGGTGTTGGACCTAGGTAACACCTGGTGACCCCATT
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:8e40299e7532
|
40 | — | — | — |
|
TAATGGGATCATGACACCTACCGTCTGCACCTCCCAAGGC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:bd6098515e7a
|
40 | — | — | — |
|
GAGGTGTTACTATAGGCATTTAGGTGGGAAATCGTTCCAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:feceef5c0254
|
40 | — | — | — |
|
CCCAAGTTGACACATAGGAAGACTCGCTCCCCTCGCACTA
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:1028773a1f68
|
40 | — | — | — |
|
TTAAACGATAATTAGGAAACAATGCATGTCAAATACGCGC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:b8e0753979dd
|
40 | — | — | — |
|
TCACTGACTGCCTCTCCGTGATGCATGACAGTGCCATAAG
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:0e1e686e2445
|
40 | — | — | — |
|
ACAAAACCCATCTAGGGTGTCACAACGATGCAACAACACC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:5e37b2b0596b
|
40 | — | — | — |
|
GGTTATTGACACCTCCTGCTAAGCCGCGACACCTCCGTGC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:751cf51d5b95
|
40 | — | — | — |
|
TCTTAGTGTGAACGGTTATTCACACGTTGAGTAACGCAAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:9aa93028d98c
|
40 | — | — | — |
|
TCCTCCCCGCTTCACACGTTCCCTCAGCGCTTTCACACCC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:56842e93aed2
|
40 | — | — | — |
|
TCGCCTGCCGTTGTTGTCACCTCGTCCCGAGATTTCGCAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:3c70f7febbc9
|
40 | — | — | — |
|
ACGTGCCAAATAACGCGACCTAAGGTGTGAAACTCAGCCA
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:cfd7ef93691c
|
40 | — | — | — |
|
TCCGTCACACCTCGGACGACATAGCGACACCTTCGTAACA
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:a68e0e092a0f
|
40 | — | — | — |
|
CATGGGACAAGTAAAAGGCACATCTCACACCTAACGGACT
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:a576ab5b9337
|
40 | — | — | — |
|
TCCTATCCGCCCAACACCTTTGAACCACTATTCGCACCTA
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:3088e175f62f
|
40 | — | — | — |
|
CACCCAGTTACCCATGAGTTGACACCTCCGATAATCCCAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:daa16abd5508
|
40 | — | — | — |
|
TCCACATCGCAATAACACCTATCAGCCAAATCCAACACCT
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:892106379481
|
40 | — | — | — |
|
TAGCGCTTAGAGGTGTGATCTTGCGGTGACACAATCTGCA
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:cdcf09a3dc4b
|
40 | — | — | — |
|
TTAGCACCTGTTTGCAGGTGAAGTAAAACATTAACACCTT
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:8da528747f99
|
40 | — | — | — |
|
TCCTAACACGTCGAAAATCGCCGTTTCACACCCTCACATC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:38575ca8bfd7
|
40 | — | — | — |
|
TCGCCACTAAGGGGAAGGACACCAAAATGCTTAACGGCAA
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:1b77d1038b76
|
40 | — | — | — |
|
CATGACCGGCCGGACACAGTATTTCATACTATTGCGGACC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:00cab422f367
|
40 | — | — | — |
|
TTAGCGCTAATCCTGTTGATATGCCGAGGATTAGACTATC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:1b90e3e9af26
|
40 | — | — | — |
|
ACGGAATTAGTAACAATTTCTAATCCCAATACAGTACGAA
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:12e4026f9065
|
40 | — | — | — |
|
TCCCAGGCAGACGTCGCACCTTTAAGACGAGAGTTCACAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:5c90232fa23c
|
40 | — | — | — |
|
AGTAGCGGTCCAGGTGTAAAAACACATGTGCCAGGTGTTA
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:474600c3a2cf
|
40 | — | — | — |
|
TTGGTGACAGAGGTGTGAAAGCAAGATAGCACACCTACTT
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:fe4745b88896
|
40 | — | — | — |
|
ATCGCAGATGAGATTAACACTTACGGTGCATTTGTCACAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:4c155c5de74c
|
40 | — | — | — |
|
TGGCGTTATTTGCATTAGAAGGTGCCACATGACTTCACAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:41c6283e2e62
|
40 | — | — | — |
|
TCTCCTGCACCTCCCGAGGCGTGAACCGACGGTAATCTCG
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:f38bab9f9a36
|
40 | — | — | — |
|
CACCTCCGAGCGATTATAACACCTTCGCCCAACTCGAATG
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:2a926b7f0e3f
|
40 | — | — | — |
|
TCGTAATGAGAACACTGCATTTCATGACAATCGGTGTGAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:bbe5fb9a449e
|
40 | — | — | — |
|
TCTTCACACCTCGCCCTGCTCACACATAACACCCACGCAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:25bf2fc4675c
|
40 | — | — | — |
|
TCACCTTTCACACATAGTACGCCGGTGTAACACCTTCAGC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:52ebce791799
|
40 | — | — | — |
|
CCTGAAGTGGTGCAAATGTGCAGCTATTACTACCGCTCTT
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:4a9e1814fd16
|
40 | — | — | — |
|
GACGCGCACGAAGGTGTGGAGATCAAAGAAACGTGTGACA
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:82b73d1d366e
|
40 | — | — | — |
|
TAGCCGTGTGCTGTGTGAGGTGTTGAAGTTAGTTCACACC
PANAPTA:P32243:OTX2_TBX21:PRJEB66722:R3:83d520339b69
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final