OTX2_TCF4
CAP-SELEX sample OTX2_TCF4 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GGTTGACCCAGTGCCCCGGCGAGCCCACGCTGTAGGGCAT
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:923586b66806
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCCAGCCTTCACATTTTTCATCCCACATCCACTCCTC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:c11b4fcfb52c
|
40 | — | — | — |
|
CCCAAGAATGCTTGGCATTCACGTGGCCCCGCCTCCCCCG
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:227bda88d91d
|
40 | — | — | — |
|
CCAATAGTATGCTGATCCCAACACGCAGACACCAAGCGAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:dd353d2c9b85
|
40 | — | — | — |
|
CCTAACACCAAACAGGTGCATGAACGCTACCTGTTCGTGT
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:25dce36ffb0d
|
40 | — | — | — |
|
CTGACAACTGGCAGTGAGTCACCGTCTTTCTTATGTAGGA
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:78cc96b7c027
|
40 | — | — | — |
|
TGACACCACACAGAACTGCCCCTCATCTCCAGAAACCAGA
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:5e65c312d97d
|
40 | — | — | — |
|
CCCTGACTTATCGCTCCCTGCCTACACCCTATCACGTAAG
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:eb52069fa7c8
|
40 | — | — | — |
|
CATCGCACCTGCCCTGTTAGCCTACCATTAGAGACACCTA
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:fd6c344b91f3
|
40 | — | — | — |
|
GCGTTACAACTGCACCTGTGACACCAGGTGCATGCAAGTG
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:b94a12e97f47
|
40 | — | — | — |
|
CCGCAGTTACACCTGTCCCGTCGACAGGTGCAAGTAGCGC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:e8cb619c3966
|
40 | — | — | — |
|
GGCCCAACACAATTGACTAACCTGAACCACCTGGCCCCTT
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:34c8a7f95294
|
40 | — | — | — |
|
CCCAAGCGTATGCAGGTGCTTCCCGAGACGCATCTGCACG
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:b897f6753894
|
40 | — | — | — |
|
GGACGTAACACAAGGAACACCTGTGCTTAATTAAGATGAA
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:ca0df9283895
|
40 | — | — | — |
|
GTACAATCCCCAAATTCCTAAGTAGGTTACACCCAGGATT
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:0bf58a65aa5e
|
40 | — | — | — |
|
TCGCAGCACAGGTGTCGACACAGACCGCACCTGCGCCCGC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:626046600a98
|
40 | — | — | — |
|
GGCACTAACTATGCTGCGCTCACTGCCGACGCACCTGCAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:f47b80efa5a7
|
40 | — | — | — |
|
CCCCACAAGCACACCTGCCCCATGCAGGTGCACCGTCCGT
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:4e3f0199bc4f
|
40 | — | — | — |
|
CCAACCCAGGTGCGCACGATCGCCCACCTGCGTTGTTGCC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:d66bdd7d5463
|
40 | — | — | — |
|
TCATGCAAAGCACTATCGCACCCTAAGTAGGCACCTGCCC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:7691f5832400
|
40 | — | — | — |
|
GCGACTCACATTTAGCGTTCAAGATCAAGTGGCCTTCCCC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:384662434a15
|
40 | — | — | — |
|
CCGATCCAATATGATCACCTGCAGTTGCAGGTGCTTGCGT
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:a64b0fa779b1
|
40 | — | — | — |
|
CTGGCACACCTGTACCCTGAGTGCAGGTGGTCTCAACGCA
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:73d49d8eab1a
|
40 | — | — | — |
|
AAAGATTGTTCAAGATGGCACGCGGCGACTTCGTGGGTAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:ec4a37283e4b
|
40 | — | — | — |
|
TTCCCCCGCAGTGCAGGTAGTCACACACCTGCGCTACGCC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:e1d9a9a9a10b
|
40 | — | — | — |
|
GCACCTGCGAAAAGCGTCGCTAATCGTAGACGTGATTACT
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:59ed383a7fc1
|
40 | — | — | — |
|
CCGTCCCCACAGCAGGTGTGAACCCGTCAGCACCTGCTCA
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:b5547710ea6f
|
40 | — | — | — |
|
TCGCGAACACAGGTGCACCTCCCGCACCTGTCGCGACGAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:8c09a69f49e2
|
40 | — | — | — |
|
CCTCTCGCAGGTGCCGACTTGACCGTCACCTGCCAGACGT
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:9c7e3592fb51
|
40 | — | — | — |
|
CCCACACCCCCATAGTCCGTAATTCTAAATTCCTGAGATG
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:40bd7286190b
|
40 | — | — | — |
|
ACTCATGACAACTAAGCCTTACAAATTCTTAACATTCTCG
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:8cd93872e452
|
40 | — | — | — |
|
AGCATATTGCCGGATAAACTACAAGGTTAATTTCCTAGCT
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:cb0f5c1da6f7
|
40 | — | — | — |
|
CAATGCCCCTGCCCTTTTGCGCCTTAACAAGCTTACCTCA
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:7409576bcb68
|
40 | — | — | — |
|
TTGTCAGCGCACCTGCTCCGTACGCAGGTGTACCACATGG
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:3c4ac63ad39f
|
40 | — | — | — |
|
ACACTCTTTGGAGCCAGCCACGCACCCGCGAGAATTTAAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:6505771e73a9
|
40 | — | — | — |
|
GCCTCGATTATAGCACGTAATGCTGATAGAACACATCTGG
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:1c6470cacc9e
|
40 | — | — | — |
|
GCCAAATACCGCGGCATCGTCCTATAACAACTTACTTCCC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:4ac7ac894c6d
|
40 | — | — | — |
|
AACACCTGTAGGCATCTTCAATTATCGAACATCACCTGCG
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:efb6187d39d3
|
40 | — | — | — |
|
GGGCAGCTGTACGCCTAACGACCATACTGCTCTGCAGTAA
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:0e725fc628b5
|
40 | — | — | — |
|
ACAAGCTTTGCATTATCCGATAACACCGTTTGCTCAATCC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:99547be49201
|
40 | — | — | — |
|
ACGACAGCAGGTGCCGCTCCGCACCTGCGATATGGTGTGG
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:c558005fe063
|
40 | — | — | — |
|
CCGATCGATTAACACGCAGGTGCACTGTCACACCTGCAAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:798b8367a1bb
|
40 | — | — | — |
|
CTCCACGGTCCAGGTGTGCCGTAAACACCTGCACCTGTCC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:b29bbbd4982c
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCTTTACTCACCTGGCATCGAACAGGTGCGTGTGCGC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:23b3447809ae
|
40 | — | — | — |
|
TGCTTCCGACAACTCGGCTCGCGACCCTGCCGACGCCTCG
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:00d4178e25c1
|
40 | — | — | — |
|
ACTCCCTATTGCACACCTGTACGCCCAACAGGTGCGCCAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:cde62ba261d2
|
40 | — | — | — |
|
ACCCACACGTGCCTGAATTGCAATTTGTAAGACGGCGTAG
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:0ee121ef7136
|
40 | — | — | — |
|
CCCATCCAGGTGTGCTCCCACGGCCTAACACCTGCGTTAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:8d786bddbc4d
|
40 | — | — | — |
|
CCAATGCACCTGCTCCTCACAGGTGCACCAATTCCCGGGA
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:4c9b1c3b6d63
|
40 | — | — | — |
|
GCCTACACCTGCATCGTGCGCCCCCGACATGCAGGTGTAC
PANAPTA:P32243:OTX2_TCF4:PRJEB66722:R3:720755ca0eb4
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final