PAX2_PITX3
CAP-SELEX sample PITX3_PAX2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CGCGCGTGACGTGTTTGGACGTGAATCACTGAACCGTGAC
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:d9f4bf43f03f
|
40 | — | — | — |
|
TCAGCCACGTGTGCTCCTACATACCTCGTCACGCATGATT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:d4bd62a74363
|
40 | — | — | — |
|
TCCCACGCATCATCGCACTTCGTTACGCACGACTTAACAC
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:7be39e08f07c
|
40 | — | — | — |
|
GATCAGCCGAATGCAACGACCCATAACGCCACGCTTGATT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:c4c5cfca99d2
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCCTTTCCGTCACGCTTCACCGCACGCGAGCGCCCAC
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:fabc12b76c22
|
40 | — | — | — |
|
GCGTGCTGAGCCTAATCAGTGGAGCGTGACGATTACCCGT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:23b7e67c11b6
|
40 | — | — | — |
|
CTCGTCACACTCCAGTAAGCACGGTCATGCACGGATGCGT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:0c7e910789a6
|
40 | — | — | — |
|
CTGCGTTACGTTAGGCCCGCTGCCTTCGTTACGCATGATT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:c89858e23f89
|
40 | — | — | — |
|
TCTCACGCCGCCACGCATGACTGCACATAGTCATCGAAGC
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:c91206d5cf15
|
40 | — | — | — |
|
TCCACGTGCGACCATGCGTAACCGAGCGTGACTGCGGCTA
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:332dbed71e1f
|
40 | — | — | — |
|
ACCCGATCGAGCAAACGGAGCGTGACCGCTATGCATCACC
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:6c599e8e0a68
|
40 | — | — | — |
|
GCGCATTGGACACGCATCAGTGCACACGACACGCATTGAG
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:55b4af9594b2
|
40 | — | — | — |
|
CGTTCCACCCCAGTGCGCAGCCGTCACGCTTCATTCGGTT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:2155162d8cff
|
40 | — | — | — |
|
GACGCGCATCCAAGGGTAACGTAGTGCAACCATGCATGGC
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:5421af8c6ce1
|
40 | — | — | — |
|
ACGACGTTGCGTAACACGACACGCTCTACCACGCTCGAGT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:4fd618a689dc
|
40 | — | — | — |
|
TATTGAACGCAACGTTCCGCTTCGATGCACACCAGTGAGT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:f6cdf12b9e29
|
40 | — | — | — |
|
CATGATCATTCATGCGTGACGCCACGCCCACTGCCGTTCA
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:2596c651df72
|
40 | — | — | — |
|
GCCCAGTCATGCGTGACGACACGTAGCGTGCAACGGTCAA
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:ee870b9b3071
|
40 | — | — | — |
|
TACTGATGGAGAATGAACGCATTCATGCGTGACCGCGTCC
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:bffd288587a6
|
40 | — | — | — |
|
GGTATTAGTTACGCATGGTCAACCAGCCGTAACGGTAGTC
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:b3de4f5ec1b0
|
40 | — | — | — |
|
GCGCATTTGGCGTTACCCTTGGATGCGCTCCGATGCACAT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:a36558fb630a
|
40 | — | — | — |
|
TCGCACGTGAGCGATCACGCGTAACACGCGCCGCATCACT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:c1920f5e6652
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCCATGCCTCACGCGCCCGACACGCATGAATGACCAC
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:5948aaecd6fa
|
40 | — | — | — |
|
ATCAGTCGCACTGCTTGGGCGAGGCTCGTCACGCATGATC
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:88656d77ce7b
|
40 | — | — | — |
|
CGTATGAATCACCGATTAGTCCTGCCTACTCATGCGTGAC
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:c18b19c5b843
|
40 | — | — | — |
|
GATCAGTCAGTCGAAACCGTTCCGCACCAATGCCCACTGC
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:59e0661ab3cc
|
40 | — | — | — |
|
ACGTGATCAGCCAAGCGTGGCGACGCGTGTTTTCCATGAA
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:c12d96f84f11
|
40 | — | — | — |
|
TGCCCGTGCCTTGCCGCGTCTCCAATCGTCACGCTTGGCT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:9712180b9b20
|
40 | — | — | — |
|
GTGCATGACTCCCATCCCCTCGCTACGCTCCGTCGCACAC
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:7bf030c6e8fd
|
40 | — | — | — |
|
GGTACGTCACGCATGAATGCGTAAATACACTGCATGATTT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:e5c9064695eb
|
40 | — | — | — |
|
CCGTCGTTCAGCTTGACCGATCATGCGTAAACACCAGCCC
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:0916ead97d46
|
40 | — | — | — |
|
GACCGTAAGCCCTTCGGCGAAGCAGCGGTCACGCTCCATT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:feea811ecf6b
|
40 | — | — | — |
|
CCTAGGCAATGGGCACCCCTTCGTCACGCACCACTGACCT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:3382f1891419
|
40 | — | — | — |
|
GCACGAAACGCAACTACTCGTCACGCTTGGCTAGTCTCGA
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:fb8212365dcd
|
40 | — | — | — |
|
CTGCGTGCGATCCGCTTGAAAGCTCTGGTCATGCATGAAT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:d3de58569242
|
40 | — | — | — |
|
CCGTTCACGCATGATTGCCCAAGTTAAGCTTGATCGCATA
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:8993ef115689
|
40 | — | — | — |
|
CTACTGCCCTGAACAACCGTTCACGCATGGTCAACCATGC
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:d2ff62870814
|
40 | — | — | — |
|
TAACGCGTCCCGCTAATTATCGTCACGCTTGAGTGAGCAT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:83597a9ddc7e
|
40 | — | — | — |
|
ACCACCTGTGCCCTGTGAAGCGTGACGATCGTAACACGCA
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:16040bc886b5
|
40 | — | — | — |
|
TAATGCGCGGTCACGGTTCAGTGAACACACTGTTACGTTT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:56a83c01078b
|
40 | — | — | — |
|
CATGCGTGACGAGTGACCAGTCGAGCATGAATTAAACCTT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:a271591a6204
|
40 | — | — | — |
|
CTGGTCGCCCATGCGCGCTCGTCATGCATGGTCACCCTCA
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:e480edd65947
|
40 | — | — | — |
|
TGAAGCATTAGGCGTGACCGTCACGCTCGCGTGAGCACGG
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:b2060ca28121
|
40 | — | — | — |
|
CGAACGTTACTCAGTCAACTGTAACGATGCGTGACCGATT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:5d3d57d0ef38
|
40 | — | — | — |
|
GTCGCCCATGCGTGACTAATCCTGTCGTACCAGACATAGT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:785b46a4767e
|
40 | — | — | — |
|
GGTGAAAGGCAGCCATGCATGACGGATCAGGTTCCATCCT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:fbf2f38e3b71
|
40 | — | — | — |
|
GGACAACCCACGCGTGACCGTTACGCTCCACAGGACACAA
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:c113a089d80e
|
40 | — | — | — |
|
CAGATCACGACTCGTTATGCACGACTGCTCAAGCATAACG
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:45355a0d8349
|
40 | — | — | — |
|
GGCTAATCAGTCACGCATGATCGCTCGTGCGTATATAGCC
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:c5ad19589724
|
40 | — | — | — |
|
GCCACTTACCGATCCTGTGCATCGGACCGTGACGAGTCGT
PANAPTA:Q02962:PAX2_PITX3:PRJEB66722:R3:d770715cc234
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final