PAX5_PITX2
CAP-SELEX sample PITX2_PAX5 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GAATAAATAAAATGCCGGATAACAACACCAACGGCTCCAG
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:2d9106f0667c
|
40 | — | — | — |
|
TTAAAACAACGTCGCTAACCATACAATACACAGATATGAA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:ee91bb6b792d
|
40 | — | — | — |
|
CCCCATCCAGCGTCACGGATTAGTTTCGCTTGAGTGCATG
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:e2fb621e76fb
|
40 | — | — | — |
|
GTTGTGTGCTTAGCCGTCACGCTTGATCAGCCAACGGGAA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:3497c40cc223
|
40 | — | — | — |
|
AATCCGTCATGCACCATCGCCCCACGTACTACCCACACAA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:4c601b3df82f
|
40 | — | — | — |
|
GTGCCTCGAACAGTTGTCACGCTTGATTGCGTTGCCGTGA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:51b80db5601a
|
40 | — | — | — |
|
ACGAAGCGGAACCGTGACGGCGGTGCCAAACAGACCGCAT
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:e0c45123d0fe
|
40 | — | — | — |
|
GCTCAATCAACCGCGACGCGAAACCACTAATCCATACTGA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:fd368f125ad1
|
40 | — | — | — |
|
CGCTTGAATGATTGCGCAAGTGTTGACGGGGCGTAGATCG
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:714b47d6c148
|
40 | — | — | — |
|
CGGGAATTGATTGCATGCGGTCATGCTCCGTTAAGCACAA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:3df413e89a36
|
40 | — | — | — |
|
AGGTGTCGCCACGCTCCAGTGAACAGGGGAAGATCAGTTC
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:f8030086b77e
|
40 | — | — | — |
|
TGGTCACTCAGAGTCGCCAGTGTGCATTGAAGCGTGGCGA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:058490ba6720
|
40 | — | — | — |
|
AATCCTCGGTCGTCACGCGCTACTGACCCAACAACTGTGT
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:592467b1232c
|
40 | — | — | — |
|
ATTGCCACCGCGCGAGTAACGCATTGTTGACCATGCGTGA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:3d10cefc8060
|
40 | — | — | — |
|
TCCCCGCAATCAACGAGGTGGAACGACGCGTGACTGCACT
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:2cdfbb00be2d
|
40 | — | — | — |
|
GATACAGTTCGCCACGCATGATAAGTCACTGCGCTTCAGA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:27086f41d89c
|
40 | — | — | — |
|
GTGATGCGTGAAGTGATACCATGCGCATGACTGCGTACGT
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:07152e4e4d0c
|
40 | — | — | — |
|
ACGCAGTTTCGAGCGTTCACGCTCCAGTGAAGCACATCAG
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:836344937893
|
40 | — | — | — |
|
GCACAGTTGCACGCCACGCCTCACCACACCTGACTGAATC
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:65bd03bcb4c2
|
40 | — | — | — |
|
TCGTCACGTTTGGCTGAGTCCCGATACGCATGCTCGGTTG
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:361a532a2452
|
40 | — | — | — |
|
CATCCATAACACGCCATGCATCACTGCGTGTGCGTATAGC
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:821819853479
|
40 | — | — | — |
|
TGTGCGCGAGAATCCATCATGTGCGTCGATGTGCATCGAC
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:cfe31232d35e
|
40 | — | — | — |
|
TAATGGAGCATGGCATTCTCGTCTTGCTTGGGCGATCATG
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:908d03b37262
|
40 | — | — | — |
|
TGCCTTACCTAACCAAGCGTAACGGATTACTGGGGCGCAG
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:88698c078996
|
40 | — | — | — |
|
CATACGTGACCTTTGGCTACACATGACTAACCAAGCCCCA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:b2ba1d962e51
|
40 | — | — | — |
|
GTGACGTTAACACGGTCATGCGTACTCGCTCATGCGTGTC
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:c80121cd5b2d
|
40 | — | — | — |
|
CATGTCGAGGGCAGCCAATCACGCGTGACTAATCGCGTCC
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:2cc298982ce8
|
40 | — | — | — |
|
CATTGAAGCGTGAACGCGACCATTCATGTGTACTACGATG
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:3fa4a2d5426f
|
40 | — | — | — |
|
CCACTGTTTCGCACTGTAACACATGGCCACTCAACCATTA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:1a84af183f8e
|
40 | — | — | — |
|
CAGTAACACTAAGTCGTTAACGCATTGATGCGTGACCTTC
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:bcccb55c4df4
|
40 | — | — | — |
|
TGTTCCGCGCTAATGCGTCCCCGATGCGCATTAGCTACCA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:a029ef8436a0
|
40 | — | — | — |
|
CACGTCACGCGTCATTGCATAACTGCTTAACCATGCTTAA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:7e74ed758ae5
|
40 | — | — | — |
|
TCTGTTTCCGTGTCGAATTAACGCTCGACGTTAATCCCGA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:72ee25b07d48
|
40 | — | — | — |
|
CGCTTCACCGCACACCAAATCCCTTCATCCCGCACCACCA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:012315851236
|
40 | — | — | — |
|
CCAGTGAGCAAACCATCCAACCATGACCGGAAGAGTGATG
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:a19d7c5e321d
|
40 | — | — | — |
|
CAAACATCACAGCGTATCGCGTAATCATGCGTGACGGCCA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:84c52268140e
|
40 | — | — | — |
|
TCTGCCCTGGATTAAGTGATGTAATCCAGCTGCATGCTTG
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:992c5ed07385
|
40 | — | — | — |
|
CCCATGTACGCATGACTGCTCCGTGGATTAAGCCTTGGAT
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:90eb7c1376fa
|
40 | — | — | — |
|
CCGTTGTGGTTAAAGCAGAAGCATTGGAGCGTAACTAATC
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:b7a0ef251e8e
|
40 | — | — | — |
|
AACGGTAGCAATCAACCGTAACGGAGACGGATCATCGAAT
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:329a155452c2
|
40 | — | — | — |
|
TGCGGGAAGTCGTGCTGATCACATGATTAGTAGACCAGAA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:3bbc3e5e7fe9
|
40 | — | — | — |
|
GCATCGTCACGGCCTGATGAGCACCTAATCTACGTTCGCA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:b14d1894aee4
|
40 | — | — | — |
|
TCTCGCTTCACTGATGCGTAACGTAAGCCCGGATTCGCAA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:030ec4a74da1
|
40 | — | — | — |
|
CCCCACCTGCCTGAGGATTAGTACATCCACTGAACCGCAA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:a524a6245bdd
|
40 | — | — | — |
|
GACAAGTGGACACCTCGCTATGCATGACCAACGTTGGTCA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:e5e430caa00f
|
40 | — | — | — |
|
AAGCCCCGAGATGACTACTGAAGCGTGGCCGAGCATAGCG
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:f3f7b32f52b9
|
40 | — | — | — |
|
GATGCATGTCGAGGCAACCATGCATCACGTTATGAACAGT
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:bd9046e4b030
|
40 | — | — | — |
|
CGCAACTATCGCATGAGTGCGCAGCCAACTGGACCATGAT
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:5c5c46929c3d
|
40 | — | — | — |
|
TCATGCATGAGTAATCACCCTGCTTGGATGATTAACCATG
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:de0f0b4e35d9
|
40 | — | — | — |
|
ATTACGCTCGGCTGCATAAGATAATCCCTAGTGCACGTCA
PANAPTA:Q02548:PAX5_PITX2:PRJEB66722:R3:ef932662f698
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final