PDX1_TBX20

CAP-SELEX sample PDX1_TBX20 · 1 runs in PRJEB66722

Organism
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Sequences indexed
10,000

Top enriched sequences

More via API →
Sequence Length log2 FC P(active) Class Monotonicity
TGTCGCGCTCATTAACACAACATTACGCCTAATGACGTGA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:853fd5150fdd
40
CTCGTTAATCCGCTAATTACACCTAATGGTGTACTCTTAG
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:fd556f0ba880
40
ATGACGGATTAACGACCTAACAGCTCGTTAGCCCTCATTA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:1ef0f9bd8ed7
40
TAGTGCGAACACGCATGCTAATGTGCAATTAACCCCTTAA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:64904a4e853f
40
TTGCACAATGACGCATTAACACTAATGACCTGTCACATGG
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:1bd72c9a8000
40
AGCAGTAACGTATCGCCCTAATTAGCACATTAACACTTAA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:b93dd1df3fdd
40
TGACACCTTAATGAGCGTCAATTAACAACCTGACATGACG
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:7ffe817949e7
40
AGTTGTTAATTAACACCATTAACTGTCCGCTAACGCGTTA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:ec811d4639d8
40
GTGGCATGTTTGATAATTAGCGCCTAAATGTTGTTAATGA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:bf9c031ac3e7
40
TCCGCTAATGACCTCCATTACCGCGTTAATGTGCTAATTA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:5c6b8e1fa84d
40
CACATTAACAGCATTATCGTCGAGTTACTGTGTTAATTAG
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:1a281d8ccc4b
40
ACACTAATTGACACATTAACGCTCTGGCCTATCAAGTTAA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:972e11f88b04
40
GTGTGAATACGCCAAACGGAAGTGTTAATCGACTCATTAA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:f728ef7e124c
40
GATAATGGCAAGTGTTAATGTGGTTATACTCGCTAATTAA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:1e127ddf2305
40
CTGATAATGTGCAAACATTAACACCTCCTAAACGTTATCA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:dfd5ed195f7a
40
TAAGTATCGTGACAATCACACTTAACGACTGTTAATCACA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:8666a6a71155
40
TGACAGCCTATTACCAACAATTAACCCTTTCGCACATTAA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:e13eadbb281b
40
TCATAGGGACACACATTAACACACGCTAATCACACCCTAA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:3c826049e141
40
GGGTGTAATAATTAGCACCACATTAGCGCTAACGAACGAA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:6c7362f738bf
40
TATACCGTAATGACACTTTACCATTAATGACACCCTAAAT
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:c69f728c7e2e
40
ACGCGCCATAATTATTGAGCGCTAATTCGCGTAATTACAC
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:a69a3d713f30
40
GCGAGGTGATTATCATTAACGCACGTCACCTCGTTAACAC
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:a3816c4e42eb
40
CGTGAGGTGTTAACGGCACAATTTACACCCCATTAGCACA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:c93562349848
40
GGCACTGCTAACTAACGATCATTAGCAAACACATTAGCAC
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:3293fbe6f1e2
40
TTAGCCCCCTGACACATTAACACTACTTTACCATAATTAA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:21d5bbff7e5c
40
TGTGCCACAACATTACGCCGATAATGCGTTAATTACACCA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:6c6882295d47
40
TAATAACGCACATTAAGGCAATCGGTAATTAACGACTTCA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:dcefb478dea2
40
GGTGCCATTAACAACACTTAATGACACCCTTAAGTCCACA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:a27106df0bb4
40
CGCATGTACCGCAATTACGCGCCTAAGTGCCCGTTAATGA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:b363dd0bf958
40
ACCATTTCATTGCGAATCACACCTTAATTACTGTTATTAG
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:0b274f163751
40
TTGGTGCCATAATTTACTAGCGTTAATGACGCATTAACGG
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:07027d985758
40
AGTGTAATTATCTCGCCCGCACACGTGCTAATTGCGATAT
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:c2356e8aca9c
40
GTTCATTCCGTCATTAATACGTTAATGACTGACACATTAG
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:2b432a31bc2a
40
TCTCACCTACCCTCAATTAGGCGATAATTAATGTGCGATT
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:9775fa2b5f8d
40
TATGGTGCTAATGTAATTGCGACCATTAGCACATACTTAT
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:e3e462dd22bb
40
GTAATTAGCGTGATATCAACGATATGATCATGTGTTATTA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:dfd1a389e134
40
GACTCGCGATAATTACACCAATTAGTCCACAACTTAACGC
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:cdecd6a2fb1e
40
TAATCTCTCAACTTCACACCTCATTATCGCGAGTAATCAC
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:da98af9d4be5
40
TCGATACAAGTGTTAATGGCCTTAATTGTTGCGTTAATCA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:98f6bd1a05f4
40
TGCGATTAGCCATAAACACACATTTATGAAGTGTCATTAG
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:2732739bcb55
40
TAATGTGCTATCAAACACATCATTAACACTGATATACCTG
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:defab32862d5
40
ACACATTAGCACTTTCATTAGACACATTATCGACCTCAGA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:b00c624ee034
40
TTGATAATTAGACGTGTCAAGTCGTTAATTGCATAGTTAG
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:a620695d3d42
40
TAACGTTAATGACAATTGATGTGCGATTAACACGGTCCCA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:347cedec29f9
40
TTACGCGCCCCGCCTTCTGTTAATTGACGCTAATTAGCAC
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:45df394d781c
40
CATAACGCTTAGGCAGGTGTCATCACGTCCTTAATTACAC
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:64eb7703fcfe
40
CTTCACGTAATTACACCCCTAATGTGTTAATATACCACAT
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:64bfe4f9ebdd
40
GCGCTCTACATGTAATTAACACGCGTAACCTTGTTAATGA
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:108e3229b82a
40
TAACTCGTTACTCCACGTAATCAACATCGCTAATTGACAC
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:3b60b2cd911c
40
TAACGCATTAGCGCGTTATTAAGACGCACTTAATCAACTT
PANAPTA:P52945:PDX1_TBX20:PRJEB66722:R3:fd855b926a54
40

SELEX rounds

R3 ·final