PITX1_TBX21
CAP-SELEX sample PITX1_TBX21 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TATTCACACCTCTCCAAACCTGCTTAGGTGAAACAATTTA
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:64896f6cf13a
|
40 | — | — | — |
|
CACATAGGGATTAGGGCTTGACACCTTCATCCTGCAACGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:1b8e0f05c2d8
|
40 | — | — | — |
|
TTACCAAGTGTCATGCGGATTAACACCTAATCCGCGAGGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:46d55942506c
|
40 | — | — | — |
|
AGGTGTGAACGCGGATTAGCACCACACAAAGCGGATCGCA
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:2abb7f499679
|
40 | — | — | — |
|
TCACACGAAGCAGCAGGTGCGAACTCGCTAATCCCACGGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:33606a4e1974
|
40 | — | — | — |
|
AAAGGTGTTACGGGTAATCCTTAGGTGTTACGCTGGATGC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:629679ad72b9
|
40 | — | — | — |
|
GGTGCGAAAATGCCTCACCACCTCCAGGACGTGCTTGCGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:e8b87e1de52b
|
40 | — | — | — |
|
GGTGTTAATCCGGTTCGCACCTTGGGCTGATAACCGTGCC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:3cd2e543ac19
|
40 | — | — | — |
|
CCTGTCACATGAGGTGTCGGTGCAGTTTCACACCTTGATG
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:09fb3211fbb4
|
40 | — | — | — |
|
GGATTAACACCTCACTAATCCCTTTGCCACCTTTACGACA
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:53a1ab1692da
|
40 | — | — | — |
|
TGCAATTCAGGCGATATGTGTGAATGCGTTTTCACACCCT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:795a2655b4f8
|
40 | — | — | — |
|
CTCGTGACAGAGAGGTGATAAGTCCGTTCACACCTTGCTT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:162e35ab76c9
|
40 | — | — | — |
|
TTTGAGGTGTGAAGTGCAATTGTCACCTTTATGTGCTAAC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:015e058c57cd
|
40 | — | — | — |
|
AGGTGATAATCCCTTTCTCACCTTCCACTGCGCGTGTTAT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:5ccdcf421e6f
|
40 | — | — | — |
|
ATAGTCGTGCCAAAAGGTGTAAAACGCGTAATCCTAAGGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:491016394e94
|
40 | — | — | — |
|
GGTGTTAATCCTAGCACTGGTTAGGTGTGATAATGCACGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:649b85983bb9
|
40 | — | — | — |
|
AGCGACGTGTTACATGGATTAACACCTCATGCCCTGATCC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:892674b6ed51
|
40 | — | — | — |
|
AGGCGTGGCCAACAAGGTGATAATCCCGGTCACACCTACC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:401dcf1e4202
|
40 | — | — | — |
|
ACTTACAGAGGTGCAAACTCGGATTAACACCTCGCTACGC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:411871cd572f
|
40 | — | — | — |
|
AGCGAAGGTGTGAACGGGATTATCACCCATGCTCGATTGC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:fac28383f5db
|
40 | — | — | — |
|
AGTGAGGTGTGAAAATGGTATAACACCTCCACGGGAACGC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:f35a17c49926
|
40 | — | — | — |
|
TTACACCTTCGCGCATGGATTAACACCTCAACGTGCCCTG
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:ee5c4bd97281
|
40 | — | — | — |
|
CACCTATGGATTAGTCGAGATTAACACCTTCCTTGACGAT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:df40871b5a85
|
40 | — | — | — |
|
GGCGCGCCGAGGTGTGAAGCTGACATGACACCTTTGGTTC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:8861574d0338
|
40 | — | — | — |
|
GGAAGGTGTGAACTCGTGTCACACCTCAGTCTAGCGCGCG
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:18b7f6ae41d9
|
40 | — | — | — |
|
CGTGGGGAGGTGATAATCCTTGATTATAGGTGTGATACTG
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:43380ad47e10
|
40 | — | — | — |
|
GGTGTGAAGTGATTTCACACTTACTCGACCTCAACGTCAC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:613f380fdc8d
|
40 | — | — | — |
|
AGTGCGAAAAAGGGATTAGTGGTGTGAACGAGTTAGTTCC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:9ef734fada99
|
40 | — | — | — |
|
GTCAGGGTGTTAATCCTATTCACACCTACTTGCCATCAAA
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:5e4c978fefdb
|
40 | — | — | — |
|
GAACATTACGGTAAGAGGAGGTGTGAAGTACATTTGACAC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:8b053caf10d6
|
40 | — | — | — |
|
TAGTACGTTAGGTGTCGCGATGGATTAACACCTCGTTAGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:9b4ba2c33fb4
|
40 | — | — | — |
|
GGTGTCGAAAGGTGTCGCATAAGATTAGCACCTTGGCAGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:32983eb59ccc
|
40 | — | — | — |
|
AGGTGTGAACATTGCGTAACACCTTCCTATACGACTTCGC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:9fb59dfc2d90
|
40 | — | — | — |
|
TGAGATGGTGTTAATCCTTCTTAACACCTTGCTATCCTGA
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:528a17105de8
|
40 | — | — | — |
|
TATCCATAGGTGTTACCTCGTTTCACACCTACCACATTTC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:ee7c47914924
|
40 | — | — | — |
|
GGTGTTGACGTTCTTTCACACGTGCGCGGGGGCGCGTAAG
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:bb62677d6645
|
40 | — | — | — |
|
ATAGAGGTGTGACCTGGATTAACACATCCATAGACTGTCC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:7edd97f9ee03
|
40 | — | — | — |
|
CTGCGCACTATTAGGTGTGACCGGATCCTCACACCTCAGG
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:33d65fb731aa
|
40 | — | — | — |
|
GTTACGAGGTGTGAAACTGATGTCACACCTGTACCCTGGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:80b203f2f6b2
|
40 | — | — | — |
|
TGAGGTGTGAGAAGGATTAGTAAGGTGTTACAGGCGAAAA
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:cecafda94182
|
40 | — | — | — |
|
CACCTATCCTCCTAATCCCTGCCTCTTTCACACCCTCACC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:eed64cdef435
|
40 | — | — | — |
|
GGTGTGAACGGTGCTGGCGAGGTGTTACCGTGCTTAACAC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:099d741ac067
|
40 | — | — | — |
|
CGCGCTTGTGCTTTCAGGTGTGAACGCAAATCACACCTAC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:ec90a97cd7c7
|
40 | — | — | — |
|
GGGAATCCGACATGTGTGACCTGGATTAACACCTCGCTGC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:a4c01469d30f
|
40 | — | — | — |
|
GGTGTTGAGGCTAAATCACACCTTCGTATAATCCGCCGTT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:ca0043e7a92f
|
40 | — | — | — |
|
GGTGTGAGGCCTATTTCACACCTACTACAGATAATCACAT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:062d996a4132
|
40 | — | — | — |
|
GTGTGAAGGATTAGCACCTTAGTAGGTGCGAACGCAAAGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:1b91c8083485
|
40 | — | — | — |
|
GACAATCATCATTTTCACACGTTGACCTAATCCTTCACAC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:be462f822735
|
40 | — | — | — |
|
ATTGCTTTTCACACGTTGAGGGGATTAGCGAGCCGGAGGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:f5688622c7ae
|
40 | — | — | — |
|
GGGCGTGAAATACGTTTCACACCTACGTTGCGAGGGTACC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX21:PRJEB66722:R3:84e547a42ef6
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final