PITX1_TBX4
CAP-SELEX sample PITX1_TBX4; Mixture-SELEX sample PITX1_TBX4 · 2 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GGTGAGGTGCTAATCCGCAGGCGCAACGCGATTAAGCCTC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:8436bde50f85
|
40 | — | — | — |
|
CGCGACACCAACCCTTATCACACCCATACCTAGGTGACGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:3548ded105af
|
40 | — | — | — |
|
TTAGGGCTACGAAGGTGAGGTGATAATCCTGTTTGAACGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:91d0352a4e3a
|
40 | — | — | — |
|
CACCTAAGGCGTAGTGTGAGCAGCCACACCTTCGCTGCCT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:bd76f8ce160d
|
40 | — | — | — |
|
AGTGACTAGCGTACTGAGGGTATGCGCCTAGCAGAGACGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:09195630ae16
|
40 | — | — | — |
|
TGGCTCAGCGTATATAGTTATCGTTAACAGACGTGGCAGC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:4e832185c4ff
|
40 | — | — | — |
|
CACCTCCACTCGAGGCGTCACAGCAGATTATCACCTGTTC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:2f47f9055a81
|
40 | — | — | — |
|
ACACCTGCAGCTTATCGCCTCACACCTCACCTACATTCGC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:347a6d881c1b
|
40 | — | — | — |
|
CTGCCAACGCGCCATAGAATCTTGACACCTTTCAGGAGGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:19a907cbc4ff
|
40 | — | — | — |
|
CCGAGGTGTGTTGGAGATCCCTCACACCTCTACGTGACGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:ca495f1d65d3
|
40 | — | — | — |
|
CACCTCACCTTGTTTTAGCTTGCCGCACCTGCCGCAAGGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:8e5fe1bf427e
|
40 | — | — | — |
|
CACCTTGCTTAATCCACTTATCGCGACACCTCACTCGCGC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:2f868d195ab5
|
40 | — | — | — |
|
ATTAGCACGTCACCCTCCGCACAACACCTGTGCCGTACGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:e531eeb42924
|
40 | — | — | — |
|
CACGTCACTAAAGGGTGCTAATCCCCAACGTCCTACTCAC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:a12b0b73cbe8
|
40 | — | — | — |
|
AGATGTGTAAAGCGGATTTGCACTTAGGCGAAGGTGAGGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:83ebf1e675c9
|
40 | — | — | — |
|
CACCTACTCGGTGTTGATCCCGCGGGATTAACGCGCACGG
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:522bdc2b3e0c
|
40 | — | — | — |
|
ACACATGGTCAGGGATTATAAGCTTAAGAGGAGGTGACGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:cd28d1e8d046
|
40 | — | — | — |
|
GTTGCGTACGACAAGTTCTTAGATAATCCTAAGGTGACGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:8c1c7d55a91d
|
40 | — | — | — |
|
CCACGAATCCCTTGACGCCGCCTGATAACCCCATGGGCCC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:76c05d33e775
|
40 | — | — | — |
|
CGGATTAACGAAGGTGAAGTGTGGGGCGAGTGTTAATCCC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:7f249866c53d
|
40 | — | — | — |
|
CACCTCGCGGATTATCGGCTTAGCGCAGCCTCGAGCAAAC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:18c961352420
|
40 | — | — | — |
|
CGCGCCACGTGTTAAGCTCCTCCAACACCTCATGGTAGGC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:978875f994f7
|
40 | — | — | — |
|
GGGATTATCACCTCCGTTAAGCTGTCGTGGCTAGCTTAAT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:2ad0523f6bc0
|
40 | — | — | — |
|
GACATACCACTTCTCGGTAGGTGAGGTGTTACTTAGCCGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:67fb11da20f5
|
40 | — | — | — |
|
GTTGAGTGATCGGGAGGTGTACTCTTCTTAAGGAGGCAGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:df1e055be350
|
40 | — | — | — |
|
TTAACACATCACTTTGATCTAATCGCCTTGAAGGTGACGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:612984c4d079
|
40 | — | — | — |
|
AACGCCTCACACCTAAAGTGAAGGTGTCAATCCATAAGGG
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:714e10dc5b4d
|
40 | — | — | — |
|
CACCCCACAGTCGGTGGAGGCGACGTGTTAATCCCCTCCA
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:cf441775d6e0
|
40 | — | — | — |
|
CGACGTGTTAATCCTCAAGTGTCTTGGGATTAATGATGGC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:8f4e020d7d92
|
40 | — | — | — |
|
CACACGGCACCAGATGGATTAACGCTCGCTTAATCCCTGC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:f14e94820175
|
40 | — | — | — |
|
CGATCCACACGTCACTTAGCGATTAACGCGACGCCTACTC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:fbf055ee2c3d
|
40 | — | — | — |
|
TGGTAGGTGAAGGTGTTAAAACGGATTAAGTACGCGTTAA
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:f21bfb5127b3
|
40 | — | — | — |
|
GGCTTAATGTTGTTGCGCGCGGACCTAGAAGCGCGGTCGC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:6468447aed15
|
40 | — | — | — |
|
CGCGGTGTTAATCCAGTCCTTATGGTGGAGGAATTAACAC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:c1032129b4e2
|
40 | — | — | — |
|
CGTTTCCCAAGTGGGCGATGCCATGTATCTATTTGGATCC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:cca5f0b96a79
|
40 | — | — | — |
|
CACCTCCGCTGAAGGTGTTGCATGTGCACACTGATGCGAC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:e0aa1780591e
|
40 | — | — | — |
|
CACGACGCTCCAAGGTCTTATCATAATCTCCACGTGACGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:d0222af6937f
|
40 | — | — | — |
|
AAACTCATGTATGACACCCTCACCTTTGACGAGGTGAAGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:0fc2c7290174
|
40 | — | — | — |
|
CTCCATGTGCTGAGCTTAACACTGACACCTTCTTGAAGGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:9d2c2c702be5
|
40 | — | — | — |
|
CGGGGACTTAATGGATTAAGGAGGTGAGGTGTGACTCTCG
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:278a25f06987
|
40 | — | — | — |
|
TCACCCCAACTGCGGCGCCGAATCCATCGGCGCCTCGTGC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:20e9b7a35238
|
40 | — | — | — |
|
CGCCTACACCTCACCTCACCACGCCACCTAACAAAAAGGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:82942036fb69
|
40 | — | — | — |
|
GCGGTTGGTGGATTAACACGTCGCGAATAGGTGTGAAGCA
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:8682b2647ba4
|
40 | — | — | — |
|
CGGATTAACACCCCCCACGATGGTGTTAAGTCACGAGTGT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:ffa5b4612e79
|
40 | — | — | — |
|
AAGGCGTCGCGTTAATCCACAGGTATTAGGGGCACACTAC
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:50c8be01340a
|
40 | — | — | — |
|
CACGTATACAGTTTATCACGTTAGGTGTCGTGTGAAAAGA
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:1bfa56eac462
|
40 | — | — | — |
|
CACCTTCAGGGCAGGTGTGAATGGCATGATGTTACGGCCG
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:a376fa5d65da
|
40 | — | — | — |
|
AACGTGCCCAGATGCCGGATTAAGGAGGTGTTAATCCTGG
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:2b6869bd8c73
|
40 | — | — | — |
|
AGATTATCGTATTAGCACCTCACGATGCGAGACCTGCCAA
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:d4fc66d7fb36
|
40 | — | — | — |
|
GGTGGCGTATCTGACACTTAGGTGTTATACTTAATCCATT
PANAPTA:P78337:PITX1_TBX4:PRJEB66722:R3:dcb3608a698f
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final