PITX2_RFX3
CAP-SELEX sample PITX2_RFX3 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ATCCGCCCACTCCATCACATGTTGTCATGGCAACGGCAGA
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:1178c9fc26dc
|
40 | — | — | — |
|
GCCTGTCCCCTCTAGTCGTCCCCCCTCCCCGTCCCCAACT
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:ecfd2c82c81b
|
40 | — | — | — |
|
CATCCTTATCCAGACACTGTCCCACGCCTAGTACCACTCC
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:218263b7e127
|
40 | — | — | — |
|
GCCGTAACCCCAGCTACCCTAATCCGCCATCGTTACCATG
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:2a710884e7dc
|
40 | — | — | — |
|
TCAGCGCAACGTAATCCCCGACTTCACACGGGTTGCCATG
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:07b5c5dba2d6
|
40 | — | — | — |
|
GGCGAATCGGGATTAAGCGTTGCCATGACGCCGACAGCGA
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:25e0d0579520
|
40 | — | — | — |
|
CAAATACGATATGACACCTACCAAGCTCTCTCAACACTAG
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:abe8b16e7e58
|
40 | — | — | — |
|
GGACGGTATATCCGTTTAGGATTAACACGTTACCATGGCT
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:88118798a003
|
40 | — | — | — |
|
CGCCGCTCGAATCACTTGACAGGATTCCCCGGACCTTTCC
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:4ee8a82579e9
|
40 | — | — | — |
|
GGCGTCATGGCAACGCGCCCGCAGCACCCCGGGATTAAGT
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:8966f6fcbb12
|
40 | — | — | — |
|
CGCGCACCGCCGTTACCACGACAACAGGCGATAATCCCCC
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:a4e602ca0bca
|
40 | — | — | — |
|
GAGCCACGAGGATTAGCTACGTGTCACGCGTGTTACCATG
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:ef087a373fa1
|
40 | — | — | — |
|
TGCATGACTAATCCCTCTCACTTCTCGTCGGTATGGCAAC
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:85c0ad196519
|
40 | — | — | — |
|
AGCGCCTAATCCCCCACGTTGCCAAGCAACGTCTGCCCTC
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:fa9dd3ecbdc1
|
40 | — | — | — |
|
TCAGGACCGTTGCCATAACAACAAGATGCCCGTCACCGTC
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:f26cce15a715
|
40 | — | — | — |
|
AGCATCGTCATAGCAACGGCCGAAACAACCTAATCCCTGT
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:fa23f7143ef8
|
40 | — | — | — |
|
ACACAGCAACCGTTGCTATGGATTACGCTACGTAAAGCAC
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:52b072796b51
|
40 | — | — | — |
|
CATCCACGATGGAAAGGATTAACAGTCACTATGGCAACAT
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:27c7bc7d3775
|
40 | — | — | — |
|
CAGCTCACGACCATTGCGTTGCTATGGCCACAGCGGATTA
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:c6db43d15444
|
40 | — | — | — |
|
ACATGCCGGATTACGCAATGAGTCGCGCCACGTTGCCATA
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:1dccb8431cf1
|
40 | — | — | — |
|
TCTCGGTCTTAGTGCACGCATTAAGCTCACGGTTACCATG
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:4382dd09c722
|
40 | — | — | — |
|
AAGTGTCGTCAAGGGAACCGTTGTCATCGTTACCAGCCGG
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:a6c388a88a73
|
40 | — | — | — |
|
GAACTAAACAGCTGTTGCCATGACAACCCCTACCCCTGAG
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:d849381eb831
|
40 | — | — | — |
|
CAACAAGGCCGAGGATTAGCGAAACCATAGCAACCGATGG
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:ea36d90057e5
|
40 | — | — | — |
|
AAGGTGTCCACCTCGTTAATCCCGTCATTACCATGCCAAC
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:6175743ee1af
|
40 | — | — | — |
|
TGCGAGATTAACAGTGGCTAATCCCTGCACGGTAACCATG
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:1273a00fe7ef
|
40 | — | — | — |
|
CAGCGTTACCATGGCCGCTAATCCGACGCTTTCACGCCCA
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:9692f0e0430d
|
40 | — | — | — |
|
AGGCTAATCCTCCACATCACCATGACAACTCGCGGCACCT
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:d7ebe45100ef
|
40 | — | — | — |
|
AAGGCTAGCCACATCATCGCTATGGCAACGCCCCGGATTA
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:5921a96923c2
|
40 | — | — | — |
|
TCAACCCTTAATCCCTAGATACACCAGTTACCTTGACAAC
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:245bec024b0d
|
40 | — | — | — |
|
CGGACGGTCGCGTTATCGCAGGGGGATTAGCGTTACCATG
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:6530b90fd8aa
|
40 | — | — | — |
|
ACATGCTCATATCAGGATGCATAGCTTAACTGTTGCCATG
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:cd1079629294
|
40 | — | — | — |
|
CGCACGCGCTAATCCATGCCTCCCCGTTGCCACGCAACAC
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:3490c3f74002
|
40 | — | — | — |
|
GCGGATTACCGTACTTCGCCGTAGCGCCATGGTTGTCATG
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:fe31ea22ba20
|
40 | — | — | — |
|
ACCACGCACGTAACCATGGTAACCAAATACCTTCGCCCCT
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:8213c0cea2b9
|
40 | — | — | — |
|
ACGCTGTGCGATAATCTCACCGCAGCGTCACCTAGGCAAC
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:b598e88765e9
|
40 | — | — | — |
|
TATGCGTATATGGTAGCTAAGCAACGGGAGCGTTACCAAG
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:b04bfd454ebd
|
40 | — | — | — |
|
CCCACCTCGCATTAGCCATGGGATTTGTAGCCATAGCAAC
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:2c1d0abef9ad
|
40 | — | — | — |
|
ATCCGGTTACCATGGCACCGCGGTTGCCCTAGCAACACTT
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:c8e16d301aea
|
40 | — | — | — |
|
CCCGCGCGCCGTTGCCATGGCGGCGTCGCCCTGGATTAAC
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:4d1de320e11f
|
40 | — | — | — |
|
CACTGCAGGAAAACGTCGTATCGTTGCCATGGGAATTAAT
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:8cba1d91a366
|
40 | — | — | — |
|
TCTCGCATCCGTTCCCATGGCAACGCGGGTTGCCTAATCC
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:edfca064c070
|
40 | — | — | — |
|
GATTAACGCGGACGATTCCATGACAACGCATGTTACTTGT
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:4a598865ba3d
|
40 | — | — | — |
|
GACACCGTAACCATGGCAACCGCACGGGTTCGACCTAAAG
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:2e3f356f4cb3
|
40 | — | — | — |
|
CAATGGCTGCATCGCCAGGTGGCTTAACGTTGCCATGGTA
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:bd762c254d10
|
40 | — | — | — |
|
TTGTTAATCCGTTATGCGTTGCCATGGCAATGTGCCCTCA
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:c998389cb335
|
40 | — | — | — |
|
CGATCATGGTCATAACGCCTTAATCCTAGACGTTGCTATG
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:f0ab553fb936
|
40 | — | — | — |
|
TGGTGTTGAGGGATAACGTAACCATAGCAACTGACGCCTT
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:763fbdfedffb
|
40 | — | — | — |
|
TGCGCCCTTACCTACTAAGCCTTTAACCGTAACCATGGCA
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:23bd5b6abbc8
|
40 | — | — | — |
|
TCACCATAGTAACGCACACTAATCCGCACTACCGCACTTT
PANAPTA:Q99697:PITX2_RFX3:PRJEB66722:R3:485aece14719
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final