PITX2_TCF4
CAP-SELEX sample PITX2_TCF4 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ACTCCAATGAGCAGGTGGTATTGCGATACCCATTCTACCC
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:9c36c55cf1ba
|
40 | — | — | — |
|
GCCAGACGCGCGGAGGACTTAGCCACCTCGATGCAAAATA
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:dcf864ac5f02
|
40 | — | — | — |
|
CAAACGCCCGACCCTGCCACGGAGTCGATAAGCGGGATTA
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:e00fb73d4f4f
|
40 | — | — | — |
|
GGTCGCGGCGAGCCGCTGGTATACGAAAGTCTGCTAAAGT
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:3eeb982bf4f9
|
40 | — | — | — |
|
AGCGTACAGGTGCATCGCATTAATCCCCTGGAGGATTAAT
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:18f0ee1f37ee
|
40 | — | — | — |
|
AGGTCGTGCCGTGCTAATCTAGCCAGATTAGTCGCAAGTG
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:906df025ee06
|
40 | — | — | — |
|
AATCCACTCCACCTGCGCGATCCGATAAACACCTGGCCAG
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:1174f01ed207
|
40 | — | — | — |
|
CACGACGAGCTAATCCCAAACAGGTGCTCGGCCTTGGCCT
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:6f5349ca8daa
|
40 | — | — | — |
|
TCGCGGCCCTAAGACGGTAATCCGTTGCACCTGGACGTGA
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:f264e0252135
|
40 | — | — | — |
|
CGCACCTGGCCCAACGCGCGCATCTCGACGCCCAGGTGTA
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:04b4bbcc39d8
|
40 | — | — | — |
|
TGCATGTAACTCCCCACGACCATACCAGGTGCGGGATTAC
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:a98a9c82c286
|
40 | — | — | — |
|
GGAACCGGCGAACAGCATCAATTGTAACGCAGGACTTTGA
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:608d0bbc6bfc
|
40 | — | — | — |
|
TTGCAGGATTAATGGCAGATGATCATTAATCCTATTCACT
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:84a9c689425b
|
40 | — | — | — |
|
GATAAAGAAGGGGTATTAACACTTTAATCCGCACACCTGT
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:bfe1394d5c91
|
40 | — | — | — |
|
CGGAGTAACATGGATCAGGCCAATAATCCCTAGCACCTGG
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:8274b7bfae31
|
40 | — | — | — |
|
GCACCTGTGGAGGATTAATCACAGTCATTACACCCATCCA
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:b6ef0c7bb28b
|
40 | — | — | — |
|
GTGTAACTTTGCTCGCACCTGTCTGTTACAGGTGCCGTAG
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:70cee1530eee
|
40 | — | — | — |
|
AATCCCACACACCTGTTCCGATGTTAAGCAACCTTCGTCT
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:5dbe34a47ba0
|
40 | — | — | — |
|
GTGTACCGCATAATCCCAACGCAACAGCTCCGGATTATCA
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:bbe1afff454b
|
40 | — | — | — |
|
GCACCTGTCGGACCATTCCACAGGTGAAGGCGGACACCGA
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:8f36df1c7c23
|
40 | — | — | — |
|
GCTGCACAGGATTAGGTGGATCAGTGACACACTAATCCTC
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:675bacbdca8b
|
40 | — | — | — |
|
GCGCTTAATCCAGTCTTGGGAATTAACGCACTGAATCCAA
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:e860cb362ef4
|
40 | — | — | — |
|
TAATCCTTTACACCTGGCACGCGCGTTGTGGCGACACCGA
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:efa144f356fa
|
40 | — | — | — |
|
GCGGCATTAACGTACGTTAATCCAGGTGCTTGGAGTGCTG
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:5579601efcf5
|
40 | — | — | — |
|
AGTGAAAAGAGTTGCCTACCTACAGATCCGACCGGAGTAT
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:6f3998ee20ac
|
40 | — | — | — |
|
CACACCTGTGATGAGGTACTACGGTGCACCTGCGGTTCGC
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:d6862c8bcdd9
|
40 | — | — | — |
|
GTGAACACCTGGCTACATGCGATAAGTACTAGTTGATCCA
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:6e54da425b4d
|
40 | — | — | — |
|
CCAGCTTACCCCTCAATTAAACAGGTGCGACACTGCGCTG
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:e6034f762ba5
|
40 | — | — | — |
|
AACAACCTAATTTGCGTACAGCTCGAAGATTAGGCCTTAT
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:341da564b6d4
|
40 | — | — | — |
|
GCGGGAAGAGCCACCTGACACCCTAATCCCAAACACCTGG
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:930f7f604f0d
|
40 | — | — | — |
|
TCTCGAGATTAACAAGTTATTAATCCTCTTGCCACACCTG
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:6b09aaf7a4bd
|
40 | — | — | — |
|
TTTGGCACGCAACGCGCCACCTGTAACGGATTAGCGCGTC
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:8f380c4835c2
|
40 | — | — | — |
|
CCTCTCTACGGAACGTTTGCAGGTGTACAGGATTAATGAG
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:44ea002e8f0a
|
40 | — | — | — |
|
ACTGTCAGCACCTGGTAATCCGTCCCACCAGGTGTCGTAT
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:932869372ba6
|
40 | — | — | — |
|
GCAGGTGCGACTTAAGCCAATAAGACTTAACGAATGGGTG
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:10ed24ca65e4
|
40 | — | — | — |
|
GGTCACTAGGATTAACTAACGGATTAATCCACTATCAAAT
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:788e00c7220e
|
40 | — | — | — |
|
GATACAAGTGGTTCATGCGAAGCACCTGACACGGATTATC
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:602487e70b57
|
40 | — | — | — |
|
CCCCACAGCACTTCTTAATCACGCTAATCCTCGCCAGGTG
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:269cbdf342bf
|
40 | — | — | — |
|
GGACCAGGTGACGTGAAGATTTAATCCAGACCAGGTGCAA
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:a6d6d7340888
|
40 | — | — | — |
|
GTGTTACGAGCCGCACCTGTCCATGGGTTTACTGGATTAG
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:a71d855d1d20
|
40 | — | — | — |
|
TCACGAACACCTGGCATTGCGCGATTATGTGGTAATCCTC
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:90f3baefb2f4
|
40 | — | — | — |
|
TGACGATTCGGCTAATCCGCACACCTGCTCCTGATCTGCT
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:fcc5272a140b
|
40 | — | — | — |
|
ACGCTTATGACGTAACCGAACTCTAATAACCAACACGCGC
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:4094450c2aab
|
40 | — | — | — |
|
AAGCACACCTGGTGAGCCCTATGCCACCGATGCACCTGCT
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:ecf019f92294
|
40 | — | — | — |
|
AGTATCGCGGATTACATAGAGTTAATCCCATTGCACCTGG
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:2f9f5f402db0
|
40 | — | — | — |
|
GGGCTGGATTAGTAATACGCATCTTCACCTAATCCATACA
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:d4049b651b8a
|
40 | — | — | — |
|
GCACCTGTCTTGGATTTAAGCCTCTGATACAGGAGGTGGT
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:9304f1d8694e
|
40 | — | — | — |
|
TCTCACCTACAATGGGGTAACGATAATCCAAAACACCTGT
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:1595e7f3bf03
|
40 | — | — | — |
|
AATCCACACGGCGCTAATGACCACGCACCTGCAGAACCGT
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:37dfa4fcc5cc
|
40 | — | — | — |
|
AACCAGTCAAGCGATGGAATCCGTGAGCAACGAGACCCAT
PANAPTA:Q99697:PITX2_TCF4:PRJEB66722:R3:ec65486016bc
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final