POU4F1_SOX11
CAP-SELEX sample POU4F1_SOX11 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GACAACAATACGTATTGTTTCGTCATTCATGATTTACACG
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:b7deff7417a7
|
40 | — | — | — |
|
GATGACATTATGCAACTGCATAATAGAACCTATGCAATGC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:e3fe99cfc9ef
|
40 | — | — | — |
|
AACACCGTATTATGCATCATCGACCCTCATTATGCATAAC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:e048798e48d2
|
40 | — | — | — |
|
TGGTGTGCTGTCATATTCATTATGCAGAGGCATAATGATG
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:4d909559eff8
|
40 | — | — | — |
|
GTTGGGCACTACCCACGATTATGCCTACGCATAATTCGAA
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:341287ce782b
|
40 | — | — | — |
|
TATCAAATTATGCGTACGCATAATTACTGTTTGTTATGTG
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:fee5b2eb2024
|
40 | — | — | — |
|
TAGCACGTTCTGCACTGATTATGCTAACGCATAATATTGC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:d60dc53d99dc
|
40 | — | — | — |
|
TCACTTAATTATGCAAGGAGAGGCATAATGTACATCATAC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:803fdff20592
|
40 | — | — | — |
|
AATGCATTAACAACAAAGTCCCTTTGTTGAACGTTACCGT
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:0f2aa93441f9
|
40 | — | — | — |
|
AATGGGACTACGCACTGACAATTATTCATTGTCTACTTGC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:57a0433f7f2c
|
40 | — | — | — |
|
ATTGCGATGCATAATGGAGCATTATGTCATATGTCCGCGG
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:2747b794c3e5
|
40 | — | — | — |
|
AAAGCGTGCATTATCGACGACCCACTCTCCCCTTTGTTCG
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:53e1b33067b8
|
40 | — | — | — |
|
AATTGTAGACCCATTACATTGTTCGCAGTATTGACTGCCA
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:111d7e454b64
|
40 | — | — | — |
|
TGTGAGCCGTCCATTAGCATCCTTACGCACCCCCCGTCGC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:e12b860ae1b1
|
40 | — | — | — |
|
AATGCATAATGCAACATTGTTCGAACGAGGTGGCACCCTC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:3fc42f1e719d
|
40 | — | — | — |
|
CCGCATGCTGATTATGCAGTGTGCATAATAGATATCTGCT
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:31734ab61a4a
|
40 | — | — | — |
|
AAGGAGTGCTGTTGTTTGCTTTATTCATGATCCAACGTAC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:d45c709a519a
|
40 | — | — | — |
|
CAGGACAATGGCTTCGCATTGTCCCTAAACAATGCATGAT
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:c69ec0d5eb33
|
40 | — | — | — |
|
AATACACGTTCATTCATTGTTCATTGCGATACACACTCTC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:654ee93b124b
|
40 | — | — | — |
|
TCACGTAATTATGCATATTGTTGTCCTCATTGTCCCACAC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:53403a39dcee
|
40 | — | — | — |
|
AATGCAATTATTCAACAGGACTGTCGCACACAAAGGACAC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:bb0b303a9ca8
|
40 | — | — | — |
|
GCACGAATTATGTGGCTATACATAATGCAAATACCTGCAT
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:512ec4c0d63e
|
40 | — | — | — |
|
TACATGCGAAAGTAACAATACCTATTGTTACCTGCGTGCT
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:27e8d1f7f03d
|
40 | — | — | — |
|
AACGATGACAATGAAACATTGTTACTTAATGAATGAGCAC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:321a8feebb16
|
40 | — | — | — |
|
TTGGACAATGGACATTGTTTATTCATCGATAGAACGCATG
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:bdda271c5b9e
|
40 | — | — | — |
|
GCCATTGTTATCATTACCACAATGCATTATAAAGCGCATT
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:16680bf45900
|
40 | — | — | — |
|
AATGACTATTGTCATCACGGCGCGAATAATGCATGCGCGT
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:874db613f263
|
40 | — | — | — |
|
GGAACAACGCATCCATTGTTCATGAGCAGCTCGGCCACAT
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:20d3a4454eed
|
40 | — | — | — |
|
ACGCGATTAACAATGTAGATTGTTCCCGCGTCCCCACCCT
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:615a3968d204
|
40 | — | — | — |
|
ATATCGCCCGATCCCCTTCGCCTTACCCAGTATCATTGCG
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:5fdc3a1e3afb
|
40 | — | — | — |
|
ACCAACACATTACGCATTGTCATACATAACAATCACGAAA
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:9c859b782c0e
|
40 | — | — | — |
|
CATTACTCACTCATGCTCATTAATGCCAATTAATTAGCGC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:ec5660250945
|
40 | — | — | — |
|
GAACATACACAATGGATGACATTGTGTCCAGCCACCTAAC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:6b821367366a
|
40 | — | — | — |
|
ACAAACTATGCATCAACAATGCATAGCGCTACTGATGTCC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:e6601e993ecc
|
40 | — | — | — |
|
CAATGAGACGCACAATATTAATTGTGCAACAATGGGCAAT
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:8b88f6b4e032
|
40 | — | — | — |
|
GGCCACATTATGCTCATTGTATAATTTAGGCCCTCCCATC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:06eb930103c4
|
40 | — | — | — |
|
AAAGTAAACCAACACAATAATTCATGGAACAATGGAGCAC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:76c05ae9d726
|
40 | — | — | — |
|
AATAGATTATGCAAAGCCTACAGCAGCATAATGTATCGGG
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:5965e3070eb0
|
40 | — | — | — |
|
AATGCATAATTCCTCACATTATGCGAGCATGACACGGGCA
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:6d640401b5e6
|
40 | — | — | — |
|
TCATTCAACAATTGTGCATTGTTTAATGAATACGCCAGCT
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:2325fe205c53
|
40 | — | — | — |
|
GTTAATTATGCCTATGTTCCTGCATAATCTACATACTGCC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:a0d9666f4e11
|
40 | — | — | — |
|
TGGCGACATTATGCGCCTTATGCATAATTTGGCGGCTGGT
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:7c54a7a8a399
|
40 | — | — | — |
|
AAAGCGCCGTTCATCGTCAATGTCCAATAATTGATGCACC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:dda5800a1619
|
40 | — | — | — |
|
TCATGTCGATGTCCATTATGCATGGTCTTTGTTCCTACGA
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:63a59544b735
|
40 | — | — | — |
|
CAATCACTACCAACAATATAAATTGTTGAACGCGATGTAC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:7512777a4160
|
40 | — | — | — |
|
CGTGAACAATGCATGAGCTACTTGCCATTGTGACCGCAGC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:c53486fc6a11
|
40 | — | — | — |
|
AATGATAGCGTCATCTCAATAATGTACATTGTCACACCTT
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:40215321f46b
|
40 | — | — | — |
|
AATAACCCATGCATAACTTACGCAATGACGACGACAATGC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:d335d471d591
|
40 | — | — | — |
|
ACAGCATGCATCCTACGCGATGGTCCACAATTGCATTGTG
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:9460c405e76d
|
40 | — | — | — |
|
AATAAGGAACACAATAATGCCTCACTCATTATTAACGAAC
PANAPTA:Q01851:POU4F1_SOX11:PRJEB66722:R3:1a4867aef708
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final