POU5F1

Pre-clinical SELEX library

Organism
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R1,R4
Sequences indexed
10,000

Top enriched sequences

More via API →
Sequence Length log2 FC P(active) Class Monotonicity
AATTAGCATAAATCCTCCTGCTAAAGGACTATTTATGCTAATT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:7b5f6924e0ec
43 17.60 0.57 strong_positive 1.00
ATGCATAAATTGTCATTAGCATAATTTATGCAT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:500957b8129b
33 17.48 0.57 strong_positive 1.00
TTATGTTAATTTGTGTTTATGTCAATTAACATAAATTAACATAA
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:681b4562b376
44 17.25 0.60 strong_positive 1.00
CGCCAGGTATGATTTGCATATGCTAATTAGCCGCAC
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:44ea788053e5
36 16.40 0.52 strong_positive 1.00
CTTGTCTTGGGGATTTGCATTAGTTATGCAAATTTATGCA
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:7cde393304fa
40 16.35 0.58 strong_positive 1.00
CTGCTCGCCAGGTATGATTTGCATATGCTAATTAGCCGCACATCTCTTGC
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:a4a9294f526d
50 15.68 0.55 strong_positive 1.00
GCATAAATTTGCATAAGTAATGAGGAGCCAAATTTATGC
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:79b77faa3803
39 15.53 0.59 strong_positive 1.00
ATCCCCGTGCAGCGCCCGGGTATTTGCATAATTTATGC
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:88a56c704b49
38 15.41 0.55 strong_positive 1.00
CTACTCTCTTTGCATAATTTGCATTATGCAAATGCACATGGTTTCT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:fdd093948a0b
46 15.19 0.58 strong_positive 1.00
ATTAACATTTGGCTCCTCATTACTTATGCAAATTTATGC
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:c0eb27f63610
39 15.05 0.59 strong_positive 1.00
AATTTACATATTCTCTTAATATGTAAATT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:8c7a391306fb
29 15.04 0.60 strong_positive 1.00
TTAATTTGCATAATTAATTATGCAAATTA
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:45d0942cad48
29 15.02 0.61 strong_positive 1.00
ATGCATAATATGCATATGTGTGTGTCTATGCATAATATGCATATGTGTGT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:a3cdc505720d
50 14.59 0.52 strong_positive 1.00
ATTTGTCTTTCTGTGCCTGGCTTGCTTCATTAGCATAATGTTGTCCAGGT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:0cd777be04a0
50 14.53 0.55 strong_positive 1.00
ATTACACTAATTAACATCTCATTTGCATAAATTGTTGAAGTCAAAA
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:0221084531e9
46 14.45 0.59 strong_positive 1.00
CATTAACATAAATATGCATAATTTATGTTAAGG
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:2e2c67dc320b
33 14.45 0.58 strong_positive 1.00
TATGCAAATTAGTAAATGTGATTCACCACATAAACAGAACTAATTTGCATA
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:593293dbe9ce
51 14.32 0.59 strong_positive 1.00
GGTTAATTTGCATAAACATTTGCATAAACTGGTTAATTTGCATAAAC
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:3dc96aa1c9b1
47 14.30 0.60 strong_positive 1.00
GATTTGCATAAATTATGCAAAATCCAGCTCTGTAT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:844c318c94db
35 14.26 0.57 strong_positive 1.00
AACTAATATTTGGCTCCTCATTACTTATGCAAATTTATGCA
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:88277d856678
41 14.25 0.59 strong_positive 1.00
ACTGATGAACAACCAATATAGTCTCTTCATTAACATATATGCAAATCTCA
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:e282d22c7d42
50 14.24 0.58 strong_positive 1.00
CATGGCTTCCTCTAAATTATGCAAATTTATGCTAAGG
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:1c8c8835d238
37 14.16 0.58 strong_positive 1.00
CATTAACATAAATATGCATAATTTATGTTAATG
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:b6d110bbff7e
33 14.11 0.59 strong_positive 1.00
AACATTATGCAAATGTGTTGACATTATGCAAATGTACTGGCAT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:d053d77aa0a7
43 14.10 0.56 strong_positive 1.00
GCCATCGCCACTGCCACTGCCATCGCCACGG
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:58045c985c35
31 14.02 0.34 strong_positive 1.00
CTGCAGCATAATTTACATATCAATTTACATATTCAGTTTTGCTCACAT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:9862b7ad013b
48 14.00 0.58 strong_positive 1.00
GTTTTGCATAAATTATGCAAATGAAAAACTACAGCAACAAT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:7e935e0feeca
41 13.96 0.58 strong_positive 1.00
GGTTAATTTGCATAAACATTTGCATAAACTGGTTAATTTGCATAAACATTT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:1dc4118721b0
51 13.95 0.61 strong_positive 1.00
GCTCCGTCCCGTGTCCCTGCTCCGTCCCGTGTCCCTGCTCCGT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:85a3ea5b38fd
43 13.87 0.48 strong_positive 1.00
GCCATCGCCACTGCCACTGCCATCGCCACTG
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:29d9eded0f42
31 13.82 0.35 strong_positive 1.00
ATGGAACAAGCTTCATTTGCATATGCAAGATTGGATATTTCCGTTG
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:5d1a7a5e5b11
46 13.82 0.57 strong_positive 1.00
TTGTTTATGCAAATGAAGCAGTGACATTGTGTGCATTTAAAG
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:7798ca708476
42 13.71 0.57 strong_positive 1.00
ATATTTATGTAAATGAGGGGCATTTACATAAATAT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:bd9b94493d05
35 13.70 0.58 strong_positive 1.00
ATTTGCATAAACATTTGCATAAACTGGTTAATTTGCATAAAC
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:c826a7cfb988
42 13.67 0.59 strong_positive 1.00
CATTTACATAATCATTTTCCATTTCCTAAGCACAAATGATTATGTAAATG
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:d8968d98c1b0
50 13.63 0.60 strong_positive 1.00
CATGGCTTCCTCTAAATTATGCAAATTTATGCTAATGTGGT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:69ca94575265
41 13.63 0.57 strong_positive 1.00
CATGGCTTCCTCTAAATTATGCAAATTTATGCTAATG
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:2117eea12777
37 13.62 0.58 strong_positive 1.00
TTGTTTATCATCATCAATTTGCATATGTCTGCATGTCATTAAAATGCTAATT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:e0be8a06d985
52 13.61 0.59 strong_positive 1.00
ATAATTAGCATATTCATCATTTCAAATATGCTAATTAT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:5bb0651004f6
38 13.61 0.59 strong_positive 1.00
CTCTGTCAATTAGCATATGCAAATAGGTACTTGGGTGTATCAAC
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:1c0a3391445b
44 13.57 0.53 strong_positive 1.00
AATTAGCATATTCATCACCTCAAACATGTTGGGAATATGCTAATT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:dd457e3ca1d3
45 13.51 0.57 strong_positive 1.00
GTTTTTCATTTGCATAATTTATGCAAAACTGTTCAAAACT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:d740993c2e9f
40 13.45 0.61 strong_positive 1.00
GCATGCATACGACATTTACATAAAATATGCAAAACCTACGCACACACAT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:82ec618ecac1
49 13.44 0.55 strong_positive 1.00
ACAGAGCTGGATTTTGCATAATTTATGCAAATCATGGT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:f6f318e8e1f7
38 13.42 0.57 strong_positive 1.00
GTCCTACCACATTTTGCATAATTTATGCATTTCTGCATTGTT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:6562a4181f8c
42 13.42 0.58 strong_positive 1.00
TTGCATATTTTATGTAAATGTCGTATGCAT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:30b0ad3ea012
30 13.42 0.54 strong_positive 1.00
TTATGCAAATTTATGCAAATGACTGACCAACCATTGGT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:c74924e1a53e
38 13.37 0.55 strong_positive 1.00
ATTAGCATAAATTTGCATAATTTATGCTAAT
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:39b89e297de0
31 13.35 0.58 strong_positive 1.00
GCCATCGCCACTGCCACCTCCATCGCCACTGCCACCTCCACTGCCATCGCCACTGCCA
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:8fc7d887fa42
58 13.35 0.44 strong_positive 1.00
CCTCTAAATTATGCAAATTTATGCTAATGTGGTATC
PANAPTA:Q01860:POU5F1:PRJEB76622:R4:dcfb99566c48
36 13.34 0.57 strong_positive 1.00

SELEX rounds

R1 R4 ·final

Structural & language-model features

JSON ↗

Pre-computed feature catalog (paths only — files served separately).

Residues
360
FASTA
ESM-2 mean
ESM-2 per-residue