RUNX2_VAX1
CAP-SELEX sample VAX1_RUNX2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CTTGCGGTGAAGGTGGTACCGCATGTGGTCAGGAACGCTA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:a4370b6fb76a
|
40 | — | — | — |
|
ACCTTGGCCAGACATCCACCCACCCACGCCCTCATCGACC
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:0196274f7278
|
40 | — | — | — |
|
TCGCTGTGCCGTAATTACCCATTAAGGTAATTAGTGTCAC
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:6b7e8e148f2d
|
40 | — | — | — |
|
ACCTTAGTACCCTGCTAATTAGGTTCACCCTAATTATGCA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:436e6111074f
|
40 | — | — | — |
|
CACCACGCACCACCTACCCACCTTCCCGATACGCAACGAG
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:d73eec67207d
|
40 | — | — | — |
|
TCCAGCTCTATATGCGGAGCGAAACATGTACGGCTGAAAG
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:da1754b518b9
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCCGCGCTTATGCATAGTGACCATACTCAAGCCATCA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:fb9d1854f3f4
|
40 | — | — | — |
|
TTGTAAAATGTGTAACTAAAAGGGATTCACATTGGAAACT
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:36647d8729c3
|
40 | — | — | — |
|
CTCCGTTAATTTTAGACGTGTCTCCCGCACCTGCGCGCTG
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:8eb194593f54
|
40 | — | — | — |
|
CTATTAACGAGATAACCACAACTGTCCCTGTCTAACCGCA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:0ab1a1d67216
|
40 | — | — | — |
|
AAGGTCATTAACTGAGAGTACTCCGCACATGCAACGGGCG
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:7c4df78eeee7
|
40 | — | — | — |
|
GAACGACCAGCTAATGAGCGTATAAGCTCATTAGGCCCTC
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:4e67e9ff0bf4
|
40 | — | — | — |
|
TAAGCTTTGTTATAGGGAGGCCCCGATCATGGAATCCCAT
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:650446bb0f33
|
40 | — | — | — |
|
ATTACCGTCATTAAGTACCATGCTTTAATGACGCACGTCG
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:d58b117ce264
|
40 | — | — | — |
|
TGATTGCGGTTAAGAGATGCACTTCCATAACCGCAGGCAC
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:b9ef05564c50
|
40 | — | — | — |
|
AGGATTTTTACGACCACATGGCGGTTATATAGAGTACGAT
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:69500452e876
|
40 | — | — | — |
|
TTTCCTCCACAACACTAATGACAAGTACGTAATTAGTGGA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:3db5346c39fd
|
40 | — | — | — |
|
AACCCCCACCCCCCTCCTCGCCACGCCTCCCCACAACCAT
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:d671f958a57e
|
40 | — | — | — |
|
AACTCAGACAATGCTCAAGTCATATCGATTAATTTACTGA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:a6780a96b3c4
|
40 | — | — | — |
|
CTATGATGACCAACACCGCGGGGTCATTAGCCGCTGGAAC
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:0f5cd9bf049d
|
40 | — | — | — |
|
TGTCATAATAATTAGCATACCTAATTACGCTACACATATT
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:9b815142a74f
|
40 | — | — | — |
|
ACGCATGTAATTAAGGCCTAGCTTAATTAATGGGGCTGTG
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:3fd47486d3ed
|
40 | — | — | — |
|
AAGCACTCATTAATGCCATAGGTTAATTAGTGCAACGCGC
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:e5988a808d61
|
40 | — | — | — |
|
GTACTGTCTCTAATTTATGTTCATTATTGCTTTCATGTGC
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:8370fd4983d1
|
40 | — | — | — |
|
ATCTGTGTCATGAGCGCTCACTTCCGATAAAGCCTGTGGA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:8a16a91f98e6
|
40 | — | — | — |
|
CCAAACCAGTTTCACCGCTAGCACCTCGCTGCACTATCTC
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:918988ae1b3e
|
40 | — | — | — |
|
TGAAATGACCGCAACTGATCCGCGGTAGTGATGAAACCGC
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:1440f4a49592
|
40 | — | — | — |
|
TGATGCCGTAATTACTACTGGGCCAGCCAAGGGTGAACGA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:9208a86ca450
|
40 | — | — | — |
|
CCGCAGACATCGTTCGACCTAATGTAATTGTGTTAATGAG
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:b17bcc164120
|
40 | — | — | — |
|
AGACAACCTTGCTACCGCAACACCGCATAGCAATAACCAA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:3788075cd4db
|
40 | — | — | — |
|
TGCCAGCCCTCACCCAGCTACGCCGCAGTCACCGCGCCCA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:42cd72fd243a
|
40 | — | — | — |
|
TGCCGAATACCCAACGTGAATTCCGTTAATGGGGATGTCG
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:3fcfb216bdd4
|
40 | — | — | — |
|
TGCCACTAATTACCCTAATTACCGTGCAGCGCTCTAAGCG
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:212837c0b019
|
40 | — | — | — |
|
CAGCTACCGAAACCGCAAAGTCCCGCACATCAACCACTAA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:92d3567873cd
|
40 | — | — | — |
|
ATCCTATGCCCTACATTTACGCCCTCGCAGGCCACGACTG
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:141d3c68a50b
|
40 | — | — | — |
|
CACCGGTTAATTGCGTAAAAGCTACCGGCTACGCGCTGCC
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:2ad8fed0323e
|
40 | — | — | — |
|
GTCTCAATACGATTAGATACGCTAATTGGGTTGATACACG
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:202463486b90
|
40 | — | — | — |
|
CAAAACCACCAAATTACCATACCCAACCAACTGTTCCCCA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:7f0b65af536b
|
40 | — | — | — |
|
AGATAACGCGATAAATTAGACATTATGCGAAGCGATAATT
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:fe2cf5cbcaac
|
40 | — | — | — |
|
TACAACTACGTACTAATGTTATTACGGTGGCAGCTAATTA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:b79decc6c034
|
40 | — | — | — |
|
CGGCTAATTATCGCCATACGGCTATAATTACCGTCCATTC
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:34f49936f57b
|
40 | — | — | — |
|
GTAGCGCGCCATCTTCACATGTCCCCGGGACATAGTTTAT
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:f4de58485fe8
|
40 | — | — | — |
|
TTATGACCTACAAGTAATTACGCCGCGTAATTACCGTGCA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:494b6ac56b0f
|
40 | — | — | — |
|
GGCCTGACTTAATGACCATGCAATTGAAAACACTCACTTA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:d1e715992c82
|
40 | — | — | — |
|
AGCCCCAGCCTAATTAGCGCTAACTAATTAGAGTAGTGCA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:a618dbd471c9
|
40 | — | — | — |
|
TTTACACCCACCACCGAACACGACGGTTGACAGCCTGCTT
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:b730c42cf957
|
40 | — | — | — |
|
AGTTAAACTAATATACTTACAAGCATAATAGTCATCCAGA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:75daac099081
|
40 | — | — | — |
|
AACCGCAATTACCAACGCCAAAGGTTAACACAACCGCGAA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:b4c525ae1209
|
40 | — | — | — |
|
GCACTATATGGCTCTGCATCCCATAATTATTATCCGGCAA
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:e846a0cb613c
|
40 | — | — | — |
|
TGCATGCAAATAACTCATTAAACAAGGACCTATTAGGCTG
PANAPTA:Q13950:RUNX2_VAX1:PRJEB66722:R3:7b5925f3fbc7
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final