SOX11_TBX6
SELEX selection target
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TAAATGTCCGAGACAGGTGACGGTTGTGTGAACGTGTCAT
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:811abb531262
|
40 | — | — | — |
|
GCGTGTGGGTTTAACGCGTACGTGAATACGGGTTTGACCC
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:a4221917cd40
|
40 | — | — | — |
|
GCTGAGGGATCGCCGGGTGCGAGTGCCCGGCACCTGCTAC
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:e245df514037
|
40 | — | — | — |
|
GTGTCGGTGTTACACAGTGCATTACACCTAATCTCGCAAT
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:882b21dadf75
|
40 | — | — | — |
|
TTTGCTCGCTAATGATCTGAAAGCACTTGATTGTACGCGG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:4a3aad565b43
|
40 | — | — | — |
|
CACCCTCATGACGTGACGTCGCGAAACCATCCTGCGCGGA
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:cd6ed66e3025
|
40 | — | — | — |
|
AATTGAGCCGACAAATTATAGCACGGGCAGTGGTTACGTA
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:8f394d6121f8
|
40 | — | — | — |
|
AGAGGGTTACTATCGAGGTGTTAAGATCTTAACGGTGCCA
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:d054d9639546
|
40 | — | — | — |
|
GTGACAGATATCACACCTTGTCTAACGCGGGAATAGTGCG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:63879a680241
|
40 | — | — | — |
|
TGCCTCGCACTTTCCGTACGGTCGCGTTTAACACTTCCAA
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:1908f79cbd67
|
40 | — | — | — |
|
CGTGTTTACAGCGTAGGTGTTGAGATCTGTTCAACACCTC
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:5a3f58a55921
|
40 | — | — | — |
|
CGCATCGCGAGGTGCGAAAAATGACACTCTCCGACGTGAC
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:fb882555ddb8
|
40 | — | — | — |
|
AGGTGCGGAAAGTATCACCTCAGTATCACAACCTCATCCG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:53efa06121d7
|
40 | — | — | — |
|
AGGTGCTGAATTCGTCACCATCCCACCTCGGACCGCGACG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:df714c50839e
|
40 | — | — | — |
|
ACTACCATGGTGTGTGAGCATCGCACTCGCTTTGATCTCT
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:382a6a240151
|
40 | — | — | — |
|
TTGGCACGCACTCTTAGGTGTGAAACGACACACCTCGCCG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:0c42e4e4183c
|
40 | — | — | — |
|
CCGACAGGGCGTGAAAAACGACACCTTAATGTTAGGTGCT
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:be7df1c93481
|
40 | — | — | — |
|
CCAAGCCCGACGTGTCGAAACTGACACCTTACAACGCGCG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:34f74486d185
|
40 | — | — | — |
|
ATATAATTGACCAGAAGCTTAATGGCACGGCAACAACCAC
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:f3abe860b666
|
40 | — | — | — |
|
GTGTAAGACGAATATGGTGTCAGATCTAACACCTTCCTTG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:d7f4950bd4ad
|
40 | — | — | — |
|
GCATAACACTTTGAGGTGTGAATTATGGCACCTGTTGACG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:8b8917166824
|
40 | — | — | — |
|
CCTCAAGACAGGGCGTCGCGTCACAAACAACCATGACGCG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:526be62828bf
|
40 | — | — | — |
|
ATGGTGCCAAAAACAACACCTTCATGCGACACGTGCACGT
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:1d9de18b1cd1
|
40 | — | — | — |
|
ACTAGTTATATTCGCGAAAGCTGCATCGTTATCGCGAAGG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:1b1177e81112
|
40 | — | — | — |
|
GTTAGGTGTCGAAAGTACCACCTCTATCGACGCCGTTAGC
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:96bdb0c63469
|
40 | — | — | — |
|
TGTTAAAGGGAAACAATTGCAGTGTTTCACAGCTGCTACA
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:0e4ca23acfd5
|
40 | — | — | — |
|
ACGATGTGTGAGATTTCACACCGTACACCAAGACACGGTG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:e776e79f8c49
|
40 | — | — | — |
|
GTGTGATATGTCACACTTCAACAGGTGCCGCAGATACAGC
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:9125959a10ac
|
40 | — | — | — |
|
TGTTAATGTTACGGCGATATGCAATTAATTCGTTTGTATT
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:ffe1d90073c7
|
40 | — | — | — |
|
TGGGTAGCGTGTGATGAGGTGTCATTTCTAACACTAGGTG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:d1eb13db4984
|
40 | — | — | — |
|
ATCAACCAACGTGTTACATCTAGCACCTGGTCAAGGTGTA
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:a7dec866888a
|
40 | — | — | — |
|
TTTTGACCTTGTTTGTCTGGGGGTGTTTGGTATGAGCATG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:760ec47306ea
|
40 | — | — | — |
|
GGGTGAGTGTCAAATCTAACACCCTAACGTGTGACATGTG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:fcb1b9bdf21a
|
40 | — | — | — |
|
CTAAGGTGTGACATCTGACACTGTACAACGATGACTCAGG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:1fc80a10a462
|
40 | — | — | — |
|
CAGTAGACGTGTCAAATTTAGCACGTCCAAGGCGATGGTC
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:0e3012af7e4f
|
40 | — | — | — |
|
AGGTGCTATATGTCACACCTATGTTCCTCTCAGCACCAGG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:761d695d7f6c
|
40 | — | — | — |
|
GTCAAGGTGTGCAAAGTCACACCACCAAATAGGCCAGACC
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:e13b2a76fc56
|
40 | — | — | — |
|
ACTGCATCTAATGTGTGAAATACCACACCCCTACTTAGCG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:bbeb02abc706
|
40 | — | — | — |
|
CACCAATCGCCGCCAACGCTATCGACGACGATAGTGACTA
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:416c3d463bb2
|
40 | — | — | — |
|
TGCGTACTGGGTGTGAGAAGAGGTAACACCTTAAGGTGCG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:d28d25f5e421
|
40 | — | — | — |
|
TTGGGTTTCGCACCCGACGTTACAACTGCCCAGTATTCAG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:2bb5460be446
|
40 | — | — | — |
|
GTGTGACCTTTCACACCATTAGTCGTGGTCGCACCGTCTG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:b858a1809616
|
40 | — | — | — |
|
GACGTGCGAAATGCCACACATGCGTTTCGTCACCCGCGTG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:cc976c029c2e
|
40 | — | — | — |
|
TCTCAGTACGTGCGAAAAATGACACGAGTAGTCTGACACC
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:56d8cf6247d3
|
40 | — | — | — |
|
AGTCCCGCGGCTCGACGTGCGAAACGCAACACCTCGACAC
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:a910b7664e76
|
40 | — | — | — |
|
CCACTAGCATTGCTGTCGAGCCTTGAAGGTGAGTGTGCCA
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:76ee791e7c0f
|
40 | — | — | — |
|
TGATACTAAGCTTGTATGTGTCGACAGTCGATAGAGCTGT
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:97c53ee37116
|
40 | — | — | — |
|
GTCATAGGTGTGACATCTGACACCCTCGCATCCATAGTGG
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:92a9600efad2
|
40 | — | — | — |
|
TTCACACCTTCGCACCATGGAGGTGTGAACTTCAGTTGGT
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:862f561bb56c
|
40 | — | — | — |
|
CACCCAGGTGTTACTAATCACGCCTACGCTTACCACCGCC
PANAPTA:P35716:SOX11_TBX6:PRJEB66722:R3:e126bcef5118
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final