SOX11_VSX2
CAP-SELEX sample VSX2_SOX11 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ACGACTCAAGGCATTAAGCACTCTCTTTGATGCAACTCGT
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:b73a8a67b712
|
40 | — | — | — |
|
TAACGCTAATTGATTAGGAATATCCATTCATACCAATTAG
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:db6aa69781e2
|
40 | — | — | — |
|
ATTAAAGCCTTAATTAGGATCACAATGCGGCATTGTGCCA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:32948cb261f0
|
40 | — | — | — |
|
ATAACATCAAGCTGTAAACGCATCAAAACCTACTCCCGCG
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:1db7b29fc325
|
40 | — | — | — |
|
AGGACAATGAGCACAAAGCCAATTATCCTCCGTTTATGCA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:f3f12e04a6d0
|
40 | — | — | — |
|
TGCACCTGAAGACAATGGATCGTTGTTTGCCAATTACCGT
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:ed9c05699c87
|
40 | — | — | — |
|
TTTGACAAAGGACCTTTGTCCCACGTTTCCGTAGCGCATG
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:3946c924f37d
|
40 | — | — | — |
|
TATTGTGCTATTACGGGCTGCTCAATTAACACATGATACA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:7f98005f3529
|
40 | — | — | — |
|
CTACAATTAACGCACAATTACGCATTGTGTCGCTCGTTTG
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:fc68c9dc23c1
|
40 | — | — | — |
|
CATTGTTCGAACCTTACCGTGTGTCGTAATTGGCTTTGTT
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:2b71827cbf73
|
40 | — | — | — |
|
GTTCCATTAACGCTACAATGAGATAATTGTAGCTTGTTAA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:fb281ab4ae8a
|
40 | — | — | — |
|
TGACAATAGCTTTTGTCCCGTGCGCTAATGTAGCAATTAG
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:4d89d093cf85
|
40 | — | — | — |
|
AGTGATAATTAGCTTGCTTTGTGCGCTTTGTTCTCCTCCA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:43f5b26ca236
|
40 | — | — | — |
|
GCACACAATACCATTGTGCAACCAATTAGTTCACGTAATC
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:b0bfd280d535
|
40 | — | — | — |
|
TGTTAATTGGCTTTGTTTTTCACGAGACAATAGTCATTCA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:36088e16cfe0
|
40 | — | — | — |
|
GACTGTAACACGATAACTAGGACACAATGACCGAGCACAA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:b1b80390580a
|
40 | — | — | — |
|
TAACAACGACACTAATTGGTGGACAATAGAGTGAAAACAA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:138e36245e10
|
40 | — | — | — |
|
TACACAATGACCAATTATGCTTTTGTTCTTCCACGCATCG
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:0eaf953be28a
|
40 | — | — | — |
|
TCGCGCACGCCGTTAATTAGCCTTGTAACAAAGAGGACAA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:90c0ad927ebc
|
40 | — | — | — |
|
CAAGTACTGTCTTGAGTTAATTACACAACAATAGCAACAA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:23210074f510
|
40 | — | — | — |
|
AATGCACTAATTCTGATAATTAGGCCCATTGTAGCCATTG
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:41d407e922d5
|
40 | — | — | — |
|
ATGACCAGTAATCAAGGAACAATGCCCATTAACCCTTTGT
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:0e8befb3186b
|
40 | — | — | — |
|
TTGCAACAATGACGATAACTGTGCATTGTGTGACTTTAAT
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:7e22b95d3a11
|
40 | — | — | — |
|
CTAACTCGATCAATTACCTTCCTTTTGTTGTACCGCATTG
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:cf6cb336fa2c
|
40 | — | — | — |
|
TTTGACGGTCGAACAATAAACACTTAATTGCTATTGTCGC
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:22ac88c0e3ec
|
40 | — | — | — |
|
GGGTCGTACAAAAGGAGTGAACAATGCCAATTACTGGCAG
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:bce5ff95d587
|
40 | — | — | — |
|
TTGCGCGATCGTTAGCTAGTGCCGCTCCCCATTGCACTAT
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:dd3718b706b2
|
40 | — | — | — |
|
CGTGCTGCAGCGACTGAACTAATGAGAAAACAAAGCACAA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:63835936f0d9
|
40 | — | — | — |
|
TTTAGTAATTGCAAACAATGCTCATTGTTACGGCCTTGTT
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:b054117296f8
|
40 | — | — | — |
|
TGTGCCGTAACCCTCTTTGTTATGATAATTACCTCCTTTG
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:11170d25eb22
|
40 | — | — | — |
|
TCAATTAAATCCATTGTATGGCATCCATTAGTACGCACAA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:f9af6981aa04
|
40 | — | — | — |
|
CTTTGTCGCTTTGTTGACGAAATGAGATAATCGTCCTTTG
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:80016029c2d0
|
40 | — | — | — |
|
CTAACCTTGTGCCTAATTGGCTATTGTCTATACATGACAA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:a8f7a234efbf
|
40 | — | — | — |
|
TTAATAGGCTTTGCTGCTATTGTGCATTGTATCCTCGTTA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:649b3729d833
|
40 | — | — | — |
|
TCACAATTGCACTACAATAGGACAAAGACAGCACAATAAT
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:a8fb43a9a0bb
|
40 | — | — | — |
|
CGTTAATGATGGTCTTTGTTGCACCATTGTTGCTTGATTA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:34c8d174b7ef
|
40 | — | — | — |
|
TGTGATTAACGAATTAGGTTGTGCTATTGTTGTATTGTGT
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:30c8ac9d79f0
|
40 | — | — | — |
|
GTTCGCCCCGGCCCTGTCCATTCATCGATTTAATTGCTGT
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:2aa017526c79
|
40 | — | — | — |
|
TCGCGCAAATTGGATAACAATACTAGTTGCGAATCCATTG
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:a8cb5be8cdc5
|
40 | — | — | — |
|
GATACGCAGATGACCTTTGTCCACTCATTATGCCCCATTG
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:5587a0437d53
|
40 | — | — | — |
|
CTTGTAACTAATTAATCAGCCTTTGTACCCTTTGTTGTCT
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:c2e6bbddf3ff
|
40 | — | — | — |
|
TTTGAATTAGTGCATTGTTATGATGATAACAATAGCTAAT
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:7b088408b576
|
40 | — | — | — |
|
AATCACGCGTAAATCTGTGGTGTATTGCGTTTTATTCGCT
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:a05ccdeee6d5
|
40 | — | — | — |
|
CGGTCTTAATTGCCCATTGTCCAGCGTACACAATGCCCTA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:780173e9663a
|
40 | — | — | — |
|
CTGCCCTGACAATTGTTCCAGCACAAAGGCCAATTACGCA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:5ed8a6efbd28
|
40 | — | — | — |
|
TGAATTACTCCATTATCAGTGCATTGTTGTTCCTCTTTGT
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:beddba1688fb
|
40 | — | — | — |
|
TATTATGCTTAGCGTTAACAATAGCAATTAGCGAATACAA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:6cbd842c8d9f
|
40 | — | — | — |
|
ATGATTGTCCGCTAATTAATGCCTTTGTCTTGCATAATGT
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:b5409b09d4f1
|
40 | — | — | — |
|
GGCACAAAGGCGATAATTAGCCTCATTGTTCCGGATAACG
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:bb48de8534ed
|
40 | — | — | — |
|
CTGACCTAATGACTTAACCACTATTGTCCCTTTGTTACTA
PANAPTA:P35716:SOX11_VSX2:PRJEB66722:R3:27beb4fe17c9
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final