SRF_T
CAP-SELEX sample SRF_T · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TTCATAATTAAGTATCAAGCCTATTTGAATCTCCCCGTGC
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:3fb71813d344
|
40 | — | — | — |
|
CAGCTAGGTGTTAAGTGCTTCCGTGCTACTTCTCACACCT
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:f97ebf87626e
|
40 | — | — | — |
|
TAGGTGTCAGGTATCACACCTCATTCTTCCCGTGTATGGG
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:d959d9f033a5
|
40 | — | — | — |
|
TACGCTCCAAATATGGGCAGAAAGGTGCCACATATCACAC
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:94d752d9315b
|
40 | — | — | — |
|
CCTTAACCTTCATTGACATGAGGAATGGGTATCAGTCAAT
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:9e6b186dcf07
|
40 | — | — | — |
|
ATGTAAAAAACGAGTAGGTGATAGAAGTCGCACTTTGACA
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:b17c87809fe3
|
40 | — | — | — |
|
TAACTGTTGCATAGTATTTTTGTCCACCTTTAAGGCATCT
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:16f29afa9f5d
|
40 | — | — | — |
|
GTGCGAAATGTCTCACCGCAAGGTACCTAACTTGACGTTC
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:73f21075e638
|
40 | — | — | — |
|
GTGTGAGATTTGTCACTATGTCGTTAGATCACATTTAACA
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:ba33c0b310e9
|
40 | — | — | — |
|
AAAGGTGCAACTTTCGACATGTTGTTGTTATGCGCGACAC
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:54ca024dca4c
|
40 | — | — | — |
|
ATAAACTCGTGAAAGTAACACCTTCCATTTAAGGTGCATC
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:fda6ee2451c8
|
40 | — | — | — |
|
AGAGGAAAAAATACATATCTAATCAATCACACAAGTTTTA
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:fd1d99977816
|
40 | — | — | — |
|
TGATTTGATGTTACTAACGGTATACGAAAGACACATAGTC
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:cf847e02a2cc
|
40 | — | — | — |
|
ATATGCGAAAAGTAGCACCAGCGTGTTAACTAGTGAGGGC
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:bd04c88304ab
|
40 | — | — | — |
|
ACCGCTCTGGTACATACCATACTCATGCCCCACGTGCCAC
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:12194feb18e9
|
40 | — | — | — |
|
CAGATGCCCACAACACGTCACGACTACCTTATAAGGCCAT
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:93c6ad7c4c85
|
40 | — | — | — |
|
TGGAAATAAATTCGATCGAACGTCGATAATGAGCAAGTAT
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:a5c67e0b6b8d
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCCCGTTTAGTCTTTCTGCCCAGTCAATACCCTGGCA
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:65f55d7569a5
|
40 | — | — | — |
|
ACCCTGCAAACGGTGTGATTTTCACACCTTCCATATATGT
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:b9aa5be36555
|
40 | — | — | — |
|
TGATAAATTCACACATGCCTTATAGGGATGTGCAAGAAAG
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:65f91879e249
|
40 | — | — | — |
|
CAATCTGCGAACGCCTCCCACCTACATGCGAAAAATCGCA
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:ce974c40dc74
|
40 | — | — | — |
|
CAAACGTAACCCAACCTTGGTTACGTCTAATTAACAGCTT
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:13419a54ed1c
|
40 | — | — | — |
|
CTTACAACACAATATCACCGCTACCATATATAGCAGGTAG
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:e0d214dfb409
|
40 | — | — | — |
|
ACTAAATCGCACATATCCGGAAGTGACATAAATCACACCT
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:0473da0ccfdf
|
40 | — | — | — |
|
AATTATGGTTGTGACACACTCATGTGATAAATGACACATT
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:f9ff60792a09
|
40 | — | — | — |
|
TGCAATAATTGACGATATGACGTCATATTTCACACCACTG
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:4f41ca113237
|
40 | — | — | — |
|
CCATATTTGGAGCGAAATGGCGTACGCGACATCGTAGTTG
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:2c1aefc8b520
|
40 | — | — | — |
|
AAATCACACACCGTATAAGGCGTGTCACTTTATCACACCG
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:d9bf2edfdfb8
|
40 | — | — | — |
|
GTGTCAACTTGTACCTAAGGTGAAAGTGTTAGTTTTAACA
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:8e8150fed78c
|
40 | — | — | — |
|
TCCTGCGAGTGTTATTAGCACATACACGCGAATTATCCCA
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:a81f5b6fa694
|
40 | — | — | — |
|
CCTGTCCACCACATGCGTTGCTTCGTGACCATATACGGTA
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:b5f162faf7cb
|
40 | — | — | — |
|
TAGCACGCCAACAATCACACCTTCCATAAAAGGACATTGC
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:3afcf62e1099
|
40 | — | — | — |
|
TACGTATGTTAAGTTTCTGACTGACAGATGCATCTCAGGC
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:98cf11e5d885
|
40 | — | — | — |
|
CTTCAAACTGATTACCGTTTAGTAACTTAGTGCAAGAAGC
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:af7849ae38e4
|
40 | — | — | — |
|
AGAATTGTCCATAAATGGTGCCAATTGCGCCACCTTCTGC
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:0cc21a238b79
|
40 | — | — | — |
|
CCTTTCCGTTTTGCCAAGCTTTATAAGCATTTACCCTGCC
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:52214f87f53f
|
40 | — | — | — |
|
AAGTGCGCCTAATATGGTCATATCTGGCACTCAGTGGTAG
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:78943b2db05d
|
40 | — | — | — |
|
AGGTAACAAGTCCGTTTAAGTATGTGTGAAAAACAGCACT
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:47cd0fc49bdc
|
40 | — | — | — |
|
TGAATGTAGCGGGTGCCAAATATGGTAGCAGAATCTTGCA
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:7372d6450635
|
40 | — | — | — |
|
CCGGAGCCCTCATTGCTAGGGCAGTATTACCTTGTAGGGT
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:bd9107228729
|
40 | — | — | — |
|
TATAGTAGTACGTGCCAATTCTCACACCTCCTTATACGAA
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:24f8a5153e69
|
40 | — | — | — |
|
ATCCGTAGATGGATAAATGGGCAATTACCGAAACGTTCCG
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:acb180406e8a
|
40 | — | — | — |
|
GTGTGACTTGACACCTACACCTGACACTATGTATGTACGC
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:080b5c54f6af
|
40 | — | — | — |
|
AAAGTCCGTCCCTCACATCGCCTTAAATGGCTAGCGTTGA
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:70949ff91221
|
40 | — | — | — |
|
CCGAACGTACGGGGAACCCCCACTTCAACGTACCGGCCCC
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:a54e10465068
|
40 | — | — | — |
|
TTCGCACATACTGTACCTGTCAAAACTCGCACCTAACAGA
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:0bd6cb5e015f
|
40 | — | — | — |
|
TTAACACCCTCATAGCATCGCAGCCGTACTCCTTATATGG
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:87187800dae1
|
40 | — | — | — |
|
CTGGCTGGCTATCAAGTTGCGCCGAATATGCTTTGGGGTA
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:9c35f67d42bf
|
40 | — | — | — |
|
ATTCGCGTCTGTACGCTCCATACATGGTGCGAACTGAGCC
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:8f83f7d1bf24
|
40 | — | — | — |
|
ACGCACTTGAGATCAGGGCCATATAAGGACGCAGAGCGTG
PANAPTA:P11831:SRF_T:PRJEB66722:R3:fa144926fb5a
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final