SRF_TBX20
CAP-SELEX sample SRF_TBX20 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AGTACTTAGCACCGATACCACCGACAACTATCAGAATGTC
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:6f062cdb4afb
|
40 | — | — | — |
|
GTGGATTAACAGCTTGACCAGCATGTATTATTGGTTCCTA
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:1d83a60a6f07
|
40 | — | — | — |
|
CCCGCCACTACGACACTTTGTCCTGGATAAGTCACATTTC
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:a5a94f9669e2
|
40 | — | — | — |
|
GTGTTCACTGCACTTGTGCCTACTCCCCATGCGCAATCAT
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:2b36724502b4
|
40 | — | — | — |
|
ATCATCAGCCTCACACCAATCAGCTCTTCTGAGGCACGAG
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:e753b1436a3d
|
40 | — | — | — |
|
ACACCCCTTCGCGTGAAGTCGCCGTTGCGACAAGCTTACG
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:deb0f2cbc365
|
40 | — | — | — |
|
TCTCCTCGCTACCTCACACCCACGATTGTACGCTACGTCG
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:80dc7e7b13a4
|
40 | — | — | — |
|
ACGCGTAGTCCCCGAGGTGACATAGACACGCGAGATCGCA
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:0e97fa366eb1
|
40 | — | — | — |
|
CTAAGCAGCCATTTTAGCATATACCTTTTCCGTCGATTTG
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:ecc80584c3c1
|
40 | — | — | — |
|
TTGAACCACACTGAGCGTAAAAGCGATATACACACCATAT
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:e5e103d7de49
|
40 | — | — | — |
|
TAATATGCAAAGTGTGGTGGATGGACGTGGGGTAGCAATT
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:3b01c64a80c6
|
40 | — | — | — |
|
GTGTAGACGCGTGATCTCACGCCGTCCCTACAAGGAGCGA
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:fdc8cd691f07
|
40 | — | — | — |
|
GATACCACCTACCCGAATTCATACTCCCACACCCTGACGT
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:2220545a0fb2
|
40 | — | — | — |
|
TTCACACAACGCAAGACGTATACACATTATCAACTTAACG
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:58c0f982c238
|
40 | — | — | — |
|
CTGGAATCAGCACTTCCTTCATCCTCCCAACACCCTCACA
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:88aebfba9570
|
40 | — | — | — |
|
CTATCCCCAGCGATACCTTATTGCCCGCACCTTCCCACCA
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:1ace6244fa97
|
40 | — | — | — |
|
TATGACGTTTTCACGTAATATAGTGCTGCTTGATATCGAC
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:e8762db9c644
|
40 | — | — | — |
|
GCTACCCACCCACTACCAGCCTGGTAAGCTGCCAAAGCGT
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:11e8f847a61b
|
40 | — | — | — |
|
TGACGCCTGATCTCCACACCTAGATCCGCCACCATTAGCA
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:611c95242b1f
|
40 | — | — | — |
|
CCACCACTGCAGTCGACGAGAGCTTAGTCACGTGTGATCG
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:23a8f3897d75
|
40 | — | — | — |
|
GTCGCGGATGGCAAGCTTACGCTAACCATATATGGTGTGT
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:c1faec8afdf1
|
40 | — | — | — |
|
CTCGCCATTCTGACGCTCCTTGTAAGGATGTGACTTAACG
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:51f8728911cb
|
40 | — | — | — |
|
TCAACGAGCAGCCACTCTTAATGACACACTATCCTCCTAT
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:edcd97151844
|
40 | — | — | — |
|
TTCGACACGTTATCAACCCAGCATTACACACATGCGTATG
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:7aae8bdeccf9
|
40 | — | — | — |
|
TTAACACCTTCGCCACAAGCGTGTACTAACGCCCTTTCAG
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:940a6f7e8c7d
|
40 | — | — | — |
|
AAAGACCGACCAATTAACACGCTGTTAGTGACCAGACGAG
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:a7737dce55c7
|
40 | — | — | — |
|
AAAACATTCCCCACGTCTACGTGACACTTATATCCGATAC
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:24358e8c95d4
|
40 | — | — | — |
|
AGCCTTATTACAGTTGATACATCAAGGAACTTCTTTCATG
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:8bcfe7840387
|
40 | — | — | — |
|
TCAGCGCTCTCGCCATCACACTCCATTTATGGCCAGCACA
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:4b57d78cfaeb
|
40 | — | — | — |
|
GGACTTGGGAAAAAAGTGACTGGTTATCACAGTTACTGAC
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:59c30e7d535e
|
40 | — | — | — |
|
CGCGCTAGCATCAAGTGATATTATGATACTCACACATGTC
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:8e9c9a73070d
|
40 | — | — | — |
|
TCACACGATCTAGCCCGCAACCCTGTTGACAGCACTAGCT
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:13903ff9c0c6
|
40 | — | — | — |
|
GCACCGCAGCTCGTCCTTCTTCCCTCCTGTTTCTCCCTTT
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:ecef048f3ed4
|
40 | — | — | — |
|
TGTCCGGACCCGACATCAGAAACTCTCCGTCACACACACG
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:b203d23accd6
|
40 | — | — | — |
|
CCATAGGTAAAGTGCAATTTCTTGCCGCATCCACGCCAAG
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:9787b73713f5
|
40 | — | — | — |
|
GCATGATACCGAAGTCATTTACGTGTTGAAATCTAACTGT
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:6dfab2c32022
|
40 | — | — | — |
|
TCCAACGTGTACCTAAACTTGTCACGTTGACGACCACGCA
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:eb6dd2e2bb06
|
40 | — | — | — |
|
CTGGCACTGGACACACCGATCGAACCGCGAACCGACCGTA
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:793a9f89ca2d
|
40 | — | — | — |
|
TAAGCCAGACCTGATATTGTTTTGTTTGGCGTTATTCACC
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:430e65bf8c98
|
40 | — | — | — |
|
TTAACACCATCACATTAAAAGAGGAAATTACCGATTTGAC
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:f69185e2e47d
|
40 | — | — | — |
|
AGTTGTGGCAGACCATTAATATTGCATACAGAGTGTGATA
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:46c9e7e39f71
|
40 | — | — | — |
|
GCGAAAACTCCAAAAGGTCCCCCAGCACAGTTAGGCCCTC
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:61aa1aa4b882
|
40 | — | — | — |
|
CGTCACCTCGACAAAACCTAATTTCACTATATCGCACTAC
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:c6fd662ccbec
|
40 | — | — | — |
|
CTGGTACCGTGACGTTAACGACATTACCATGGGGGATGAC
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:2503fe6154c5
|
40 | — | — | — |
|
ATGACACCAACTTCCGATCCTTACAAGGTCCGTCTACACG
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:fcab35b3c522
|
40 | — | — | — |
|
ATCGCACATGTTAACGCCAACATGACACGTCCCTAAATGG
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:229e2f0be58c
|
40 | — | — | — |
|
CGCCGCACAATGCATAGGATTGTCTAAGACAACCTGCTGA
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:fc45506e77e6
|
40 | — | — | — |
|
ACGCAATTATCTATACTGACTGGCAACTGTGCTAAATTGT
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:2e1428acf755
|
40 | — | — | — |
|
CCTGGGAACTTGTCGAAAGTCATCCACCCACGCACCTCCA
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:75ee32ea59fb
|
40 | — | — | — |
|
TCTCAACACCATGTCATCACCTTAGCACGCGATAGAAGCA
PANAPTA:P11831:SRF_TBX20:PRJEB66722:R3:189609d3c132
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final