SRF_TGIF2LX
CAP-SELEX sample SRF_TGIF2LX · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ACTGATAACCCACGGTCATAGACACCAGGTCCCGCATTTG
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:cbeeb13447b1
|
40 | — | — | — |
|
AGCACCGCCCCCGCATCCGGACTGCTCACCAATGACATCC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:8796a5f856af
|
40 | — | — | — |
|
ACCTCGGGCACACCTCCTCCGAAAACGCACGTGATACCGC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:77588b248d1e
|
40 | — | — | — |
|
GACTCAATTTCATGCCTACCTGCCTTCTTGGGACCGTGTC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:714535fe06c5
|
40 | — | — | — |
|
CGCTCCAATGAGCTTTTAATCCCCGCCTGCTCCTTAGCCT
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:7e1a834e17e6
|
40 | — | — | — |
|
CTCACGTGCAGCATGACCCCACACGCGATAAGGGCTCCCC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:9db1822ef4c1
|
40 | — | — | — |
|
CTCAAGGCACTCCCCGTCAACCTACTATACGTAACAAGTC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:f8d351a7444d
|
40 | — | — | — |
|
AGTGATCGGATCATCCGATAACAGCCTCATTGATCACACC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:87e5cb844c97
|
40 | — | — | — |
|
CAATCGCTTATTGTGACGCCGGCGCGATTTACAGCCACGC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:7bb9ae049cae
|
40 | — | — | — |
|
CACTAGAATCGTCACAACCACGCACCAGATCCCTACCATG
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:669ce9c0335b
|
40 | — | — | — |
|
CATATTCATCGTGTCCAAGGCATGCTGCGATTGGTGTGCG
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:951f8a06c82d
|
40 | — | — | — |
|
ATGCTCCCTCCTCACCGATATGCACAACCTTTTCCGCCTA
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:70584d0fecda
|
40 | — | — | — |
|
TGGCACCCCAGAAACACGGAAAGTGGTCGACACATCTCCT
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:382d7e6a71b7
|
40 | — | — | — |
|
CAGCCCTACGACTCATAGACGTGTAGACTCTTTAACCCCC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:d4c4593b04be
|
40 | — | — | — |
|
TCCATTACCTTCACCCGGCCTCCGACATGTGGACTCTCTC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:ece717ac5d31
|
40 | — | — | — |
|
TTCCGAGGCGGCCCCAGCAACGTGTCGCAACGCGACTTGG
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:43d874f59306
|
40 | — | — | — |
|
GCCCGTTTCAACTACTCCTACTCCAGCGCACCTGCCCACC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:bb2a5b5f8483
|
40 | — | — | — |
|
CACGTAACCCTAATTAAGCCATAGCCATATCTCGTTCACG
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:3898376f6b01
|
40 | — | — | — |
|
CAAGAGCTTGGCAACGACACACCTCACACTCCGTTGCAGC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:134739e09b57
|
40 | — | — | — |
|
CATTGCAACCCCCGGTTGGATCAACCCTTTTGGGAGGCAC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:84050ebda1eb
|
40 | — | — | — |
|
TAGCTGCTTACACGCATTACCCCCCACCCATAAAACTTCT
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:00b80e302aac
|
40 | — | — | — |
|
TGTCACCAGCTTCGTACCATAACAGGGCATGACATCTGTC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:a8ed157a600c
|
40 | — | — | — |
|
TACCCCGGCGCGATCCTCCGCCAGGGCTCATGCCCCTCCA
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:6baf01654a1f
|
40 | — | — | — |
|
TGGTCAATTGGCCGTAGCAACGTGCCACAGACCAACTTTC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:7609133a4e88
|
40 | — | — | — |
|
CACACCAAACCATCCTTCTTACAAGACATCGCTCACCAGA
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:3d6d0c9e92e0
|
40 | — | — | — |
|
ACACCCATATACGGCAAACGTCACGTCACGTCAACGATGA
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:16025a177919
|
40 | — | — | — |
|
CTATCACCTGCTACTACGGCAAATGAGAACAGCGATCACA
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:9ca2a4d73996
|
40 | — | — | — |
|
ATGACCATCGCCATTCACCCCACAGCCATTTTCCACCAAG
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:c60c3a9b79b4
|
40 | — | — | — |
|
TACTACCTGACAGATGCTCCATAGAAGGACACCTGTCACG
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:6a2fdc44a747
|
40 | — | — | — |
|
CACACGTACCGCCATATAAGGCAACCTGTCAACTGTCATG
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:49626e07e8c1
|
40 | — | — | — |
|
CGCGACCACGCACCCGAGTTACGCAAGCGCGCCCGGGTGC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:c4537576f234
|
40 | — | — | — |
|
AACCAAGTCGATTCTAGGTCCTAACTTCGGCTCAAGCACT
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:721aae8f4655
|
40 | — | — | — |
|
GAATTCTCGCGACACGAACGGCCACCAACTAATAGACCAT
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:1d2fe342c5a3
|
40 | — | — | — |
|
AACCGGAAGCATAATGGTAATCCGACCATTCAAGGCCGCA
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:5ee6008d2cff
|
40 | — | — | — |
|
GTCATTGCTTCTATGCGACCCCCATCTAATTCACGTCGCA
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:2468218b05ba
|
40 | — | — | — |
|
TACATCCTTACTATCGCTCTTATCAGGCCAGTATACTCCA
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:23b47d7fc795
|
40 | — | — | — |
|
TCGCTTTTCTCTCTGGTACCCGCCCCTTTTCAACCCACTG
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:2ab02944f27a
|
40 | — | — | — |
|
GGCCCGACACCCCCGGTAGGCCCCGGTACCTTATGTACAC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:fb9e850fb28f
|
40 | — | — | — |
|
GCTGTCACCTCCCTAAATGGCCTGACAGCATCCCCGCCCG
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:d618ffb6ecf2
|
40 | — | — | — |
|
TTGCCGCCTGTCACGTCGCAAACCTTCTGACAGGCCCATC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:c0052e5003df
|
40 | — | — | — |
|
CCACATGCCAGCTACTCTCCCCCATCCCTCTCTTAACTTA
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:3f3acc6a8326
|
40 | — | — | — |
|
TAAGCCTCAACCCCCCCACATCATTTCTCTAAGGCATCTG
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:de6e522bab29
|
40 | — | — | — |
|
ACTGATAACCCACGGTCATAGACACCAGGTCGCGCATTTG
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:672a5439cfa6
|
40 | — | — | — |
|
TTGTATCAGATCGCATAGTACACCAGGAGCCGAGATGCCG
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:1856cdc2eaed
|
40 | — | — | — |
|
CTTAGACAGGTGTCACGTACCCTATTTGGTGACGCCTGTC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:3fa907377769
|
40 | — | — | — |
|
CCCACCATTTCACCTACGTAAGATTACCACATTCCCGCAC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:76d43d3bc22e
|
40 | — | — | — |
|
ACTAAAACAGTGTAGCTAAAATGGAGGATTAACATCCCTT
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:870df7a3ed0a
|
40 | — | — | — |
|
GATTTTATAGCGTTCCAACTTCAACCTCGACAAAAGCAGA
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:33f656a32fdb
|
40 | — | — | — |
|
CCGTACGCCTGCCACCTTCCACAACCTCTCAAGCTGGCTA
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:77723ef711eb
|
40 | — | — | — |
|
CCTAAAAGGCATGGCACCTGTCACGGTATTATCTGCCACC
PANAPTA:P11831:SRF_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:a30e1d5cb986
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final