TBX20_VAX1
CAP-SELEX sample VAX1_TBX20; Mixture-SELEX sample VAX1_TBX20 · 2 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CGCCGTGATACCGTGAGTAATTAGTGCCATCAACTCCATT
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:30e2cb603b10
|
40 | — | — | — |
|
CTGCAAGGCCATTTAACACCTCGTAATGACACATTCACGA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:dec86e374625
|
40 | — | — | — |
|
CCCTGACACCATCTCTCACACCATCCCAAGATGACGGAAC
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:efc5c2daaa2d
|
40 | — | — | — |
|
GTGTGAGGAACGCGATCCGTGTTGTTACACCCCTACCCAC
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:968e145907c1
|
40 | — | — | — |
|
CAAGTTGACAGCATCCATCCCAAGTTCACCACTACGATAC
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:4873e969013f
|
40 | — | — | — |
|
CGCGCCCATTAGCGATAATCACACGTACGCAACATAACAC
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:95fd0c9b0ca7
|
40 | — | — | — |
|
CTGTTACTCAACAAGTGCGATATCACGTGTATTAGCGTTA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:a51be628d1d8
|
40 | — | — | — |
|
TCACAACGTACCACATCACTGACGATACTTAAGGGTGCTA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:9650d909adcd
|
40 | — | — | — |
|
TACAACGCATTCACAGCTTAACGCCACTTACCATTAGCGA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:bee4d52231a4
|
40 | — | — | — |
|
TGGGTCTCATTCGCACCTTACCTCAGCACATTAACGCTTA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:8f51fdbef073
|
40 | — | — | — |
|
GCGTTAGCATGGTCACACCCTCCAGAGTGCCAATTAGCTA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:b1670147ebb0
|
40 | — | — | — |
|
TCTAACACCTTACAGCTTATAACATGTCATTAACACGTTA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:8baf3b9b5b91
|
40 | — | — | — |
|
TACCCAAACACCAACAGGCTAAGTACATTGACACATTAAC
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:a24369243d82
|
40 | — | — | — |
|
TTACCGTTAACACTAATCATTAACGTGTCAACACGTTAAC
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:2ced8e1111f0
|
40 | — | — | — |
|
GCCCTGCCAACGTGACACCATCACCTTAATTAGGGTGTGA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:42daa5054da8
|
40 | — | — | — |
|
ACTGCTAATTAGTCAATGTGTATCGACACTATGGCTTACA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:fe056d7a4bf8
|
40 | — | — | — |
|
GCCTACACCTCGTCACGTGCGGACATGCAATTAGCGCGTA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:4a00f687dbce
|
40 | — | — | — |
|
GTGTGACCACACGTCGTATTCACGCCTAATGACACAATTA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:287a796a7300
|
40 | — | — | — |
|
TAACGCATTCTCTAATTAGCACGTGCCACCTTTGCGCCTA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:155846440471
|
40 | — | — | — |
|
CCTCACACATTAACGCTAATGAATATGCTCTGGATGTGTG
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:9c97c83509b4
|
40 | — | — | — |
|
TTGTTGCGGTCCCGATCGTTAATTGCCGTCACATTAGCAG
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:904cc57838ae
|
40 | — | — | — |
|
ACGTGTGATGTTGTCCTCATTAGCGTGCCTAACACTCCCC
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:e6622087078b
|
40 | — | — | — |
|
TCGCGCTATCACGCATTAAGTAGCGATGATTGCCACCTTA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:a6e2babce3b0
|
40 | — | — | — |
|
TTAACGACTAATTATCACGACTTAACACTGCCGTTAACAG
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:e898e0f04621
|
40 | — | — | — |
|
TACTATCGTTAACGTGATTGCGCGCTAATGTGCCAAAGTG
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:8b4549d0bb95
|
40 | — | — | — |
|
CACCTCGAGTGCTATTACCACGTAATTAATACGTGCGCTA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:ccaf81b9bcd8
|
40 | — | — | — |
|
TTCTTGTCATCGCGTTAGTGCTTAGCAGATTAACACATTA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:36ab365c6e72
|
40 | — | — | — |
|
TGTCCAATGAACAGACAGCGTTAACGTGTTAATGTGACGA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:95b3176eb7a1
|
40 | — | — | — |
|
TGTGACACAGTCCACACCACACATTCACTAATTAACAGTA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:d897bf30b3d5
|
40 | — | — | — |
|
CATCCCACCTAATGAGGGTGCTATTAACAGGAAAAGCGGC
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:9ea69ac1a000
|
40 | — | — | — |
|
TGACACCTCTCATTAAGACCTTTTAGCACCCTCCCAGATA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:928f30abf15b
|
40 | — | — | — |
|
TCCCAAATCAGTGCTAATTAGCGCGTTCACGCCCATCGTA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:56012f133276
|
40 | — | — | — |
|
CACTTGCATAATTAGCACCAACCTTAACGCCGTGACACTA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:1c8b43ab7af0
|
40 | — | — | — |
|
TGACAACTAATTACGTGTTATCACGCCTAGGCCTTGTCGC
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:00d98fca4b1d
|
40 | — | — | — |
|
TTGACACCATTACTGATTAGCACTTCCAGTACACTGTCAA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:adbf66ef1506
|
40 | — | — | — |
|
ATGTACTTCACACCCTGGCACGTTAGGCCGCTAATTAGGC
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:2ec7eae4b649
|
40 | — | — | — |
|
TGACATTGCACTTCGCCCTCATTAACACTTTGCCACCATT
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:04655bc3d4da
|
40 | — | — | — |
|
GCAATGCAATTATCATTAGCACTATCACACCCTCCCACTA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:0833ba8a54cb
|
40 | — | — | — |
|
AACGACTCATTACCGTGAAACTGATAATTAGTCATCAACA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:4c587cc9d7fc
|
40 | — | — | — |
|
TGTGTCGACGTGATAAAGTGACACAATTAACGCACGTTAA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:715009a62f24
|
40 | — | — | — |
|
GTGCTAAGTACTCACGCAATCATTGACACCATTACACTCA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:77a80dce50e0
|
40 | — | — | — |
|
TACCCCTAATTAACGCCTCCACACATCACGCACACGCCAA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:7d309ecf9e7f
|
40 | — | — | — |
|
CGACCTGTTAATCACACCTAATTATGCCGTAATACTGATA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:29e8fc10eb6c
|
40 | — | — | — |
|
GGTGCCACATTAGCAACTTGTCACTATATCTAATGCGCTA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:2057f92b802b
|
40 | — | — | — |
|
CGCATTAACACGTTAATAACACACTCCCGACACCAACTTC
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:3e6011b28ed6
|
40 | — | — | — |
|
CGGGTAACACATTAACACCCTCACACAAGCACGCTTCATC
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:50f2b6d2eed1
|
40 | — | — | — |
|
TAGCATGCGCTTCTCGCGCCTGCATGAGGCACTTTCACAC
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:a890775f5eb5
|
40 | — | — | — |
|
ATCGCACATTAACACCCCTTACACGTCACGCTTACCACCA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:b04dac0b8ee6
|
40 | — | — | — |
|
CTACGTGCTAATGCGTCACTGCGACACCTAATGGGCCGTA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:928444246956
|
40 | — | — | — |
|
CACGTTAATGACGCCTCGTCATGATGTCACCCATTTACGA
PANAPTA:Q9UMR3:TBX20_VAX1:PRJEB66722:R3:d552d19ec684
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final