TBX21_VAX1
CAP-SELEX sample VAX1_TBX21 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ATTAGCTATCATTTAACACCTTCGCTATACTGTTCACACA
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:66a38a2f330b
|
40 | — | — | — |
|
CACCCGCTCTAGTTAGCACCTTACCGTAATGGATCACACC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:0afc3f907c11
|
40 | — | — | — |
|
TGCCCTCTGGAGTAACACCTCGCTTAAGTAGTTGTCACCT
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:eb1d5af95cfb
|
40 | — | — | — |
|
CGTTGAGACGCCACTTCGCACCTCGTAATTAGTTTCGCAC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:f5c1b9089688
|
40 | — | — | — |
|
TTATTTTCACACCCCAACTAATGACATGACACATCTTGTG
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:76d4a1eb9fb7
|
40 | — | — | — |
|
GAGGTGTTACCACGGTTCACACCTCAAAACACGTTAGCAA
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:ac4e5eda5af9
|
40 | — | — | — |
|
CTGGAGGCAGGCGGCAAAGGTGTGAACATGGCTTCACACA
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:d2f4799966a2
|
40 | — | — | — |
|
CATCACACCTAATAGTGTCATTAGTTAACACCTAATTGTC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:7e668f145465
|
40 | — | — | — |
|
CTTTCACACCCGGCCCATTACGTGTCACACCTCAACACCC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:6c4043feaeef
|
40 | — | — | — |
|
TGGTGTGAAATGCACTTGACACCTATACCGTTTACCCCCG
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:4e087fa3b0e1
|
40 | — | — | — |
|
TGTTCACACATTACGTTTAATAGATCACACATTTACTGCA
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:360cb5f12447
|
40 | — | — | — |
|
GGCGCGCAATTAAAGGTGTGAATGATGCCGTGAGGTGGCA
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:1178f9f74754
|
40 | — | — | — |
|
AATAGAGGTGTGAAACGCTTCACACCTCAGTGTACGCTAA
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:8fc82bc7f7b4
|
40 | — | — | — |
|
TTAGGGTAAAGGTGCGAAGGGGACGCGTAGAGGCGCGAAG
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:ab2ca9cac74f
|
40 | — | — | — |
|
TTAAGTGGGCAAGGTGTTATCCGCGATCACACCTTGTGCG
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:d36cfa98026e
|
40 | — | — | — |
|
CATCACACCTCACCCCATTAAGTCCGACACCTCTGCCACC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:235b990e203f
|
40 | — | — | — |
|
AGGTGTGAATTAACGTAATAGGTGTGTATACCCTTGGCCA
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:0deda0bff958
|
40 | — | — | — |
|
ACACCTTTAGCGTCAATTAACACCTTGCCACGCCAACCAC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:552bc18a2cf4
|
40 | — | — | — |
|
CATTGTACGATAGTTCACACCTCGTACTAATACGCGACAC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:cdebb689e43a
|
40 | — | — | — |
|
ATTAGTGGGAAGGTGCGACAATTCACACGTTTACCCCACC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:92a01e7f6562
|
40 | — | — | — |
|
ATCGCAAATGAGCCACAGAGGTGCGAACGTGATTCACACG
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:1b3a35491472
|
40 | — | — | — |
|
CACGCTGTTCACACCTTAATTAACACCCAACGCTAATGGC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:3f2e432491b5
|
40 | — | — | — |
|
TTCACACCTTAACCTCGTAATATCAGAAGACATTAACACC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:b4ab94e2cb13
|
40 | — | — | — |
|
TGATAAGGTGGAAGGTGTGATGTTGAAGTCACACCTATGC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:0ec145e436bc
|
40 | — | — | — |
|
ACCAGCCACGGAGGTGCGAATGACTTTCACACCTCACGCA
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:67a9bb2ea830
|
40 | — | — | — |
|
GGTGTGAACGCATTATCGAAGGTGTCGCGAGAGCCAGCTA
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:f770a39e5ab4
|
40 | — | — | — |
|
CTAGGTGTGATAACGATTGACACCTCTAGTGTCGTCTGCA
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:db46b1d7358a
|
40 | — | — | — |
|
CAGGTGTGAATGTACATTCACACCCTTTGCACAGGCGTTG
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:d19a9ba02bcc
|
40 | — | — | — |
|
GAACTGTTAACACATTTGTCATATCATTAACACCTTGCGC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:cea1f2c929e9
|
40 | — | — | — |
|
GCTGGCAAAAGGTGAGAAGAACATTGACACCTTTTACACC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:267c1ce6e8cd
|
40 | — | — | — |
|
GGTTCGCACCTTAATGCAATTGTTAATGGATGTAACACCT
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:c766222239d9
|
40 | — | — | — |
|
CCACCTAGTTGCCCTAAAAGGTGTGAGATCGCATCACACC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:405a444d9971
|
40 | — | — | — |
|
CCCAACCCAGCGTGACAAGGTGTGAATTACCCTCGACACC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:70f97a278899
|
40 | — | — | — |
|
CAATCATTACACGTTCACACCCCGACACAACACTTCACAC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:0b15fdf393f5
|
40 | — | — | — |
|
TCCAACGGCGCGACACCTACCACTAAATACATGACACCTT
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:7503c62b8a54
|
40 | — | — | — |
|
GTGGCCACTCTCACTTGGAGGTGTCACACCAATTCACACC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:686000ea9ee7
|
40 | — | — | — |
|
TTCCATTACGCTTCACACCTATACCGACTCATCATCACCT
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:4f0cb6129cc3
|
40 | — | — | — |
|
AGCTCGCATTTCGCACCTTGCTCATTAGGCAATCACACGT
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:e1d919b8a580
|
40 | — | — | — |
|
GCCTGTCGCTTACACCAAGGTGTGAACGGTTCGCCACACC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:ec3bab77ed5a
|
40 | — | — | — |
|
CCATACCTAACACCATAAGGTGTGATTACCACCTCACACC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:739efa190f5b
|
40 | — | — | — |
|
ATTCACACCTCACACTCGTGATGGCACTTAATCGACACCT
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:173e1abff362
|
40 | — | — | — |
|
GGTGTGAAGTCACGCTAACACCTTTGATGAGGCAGCGTGC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:febaf4dcfacf
|
40 | — | — | — |
|
ACAGTGACGCAATTCACACCTCGCGAAATCAGGTAACACC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:c35f68929c84
|
40 | — | — | — |
|
TATTAATGGAAGGTGTGACTGACAGTATGAAGGGTGTGAC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:4f1092688790
|
40 | — | — | — |
|
CGTCACACCTCCGCGTAATCACATGACACCTTTCTACCGC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:892417b7427d
|
40 | — | — | — |
|
TTCCGCCATGCAATTAACACCTTGGGAAGCGACATGACAC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:2b68a801751f
|
40 | — | — | — |
|
CTAATTACGTACCGAGAACGTGTGAACTCGTGATGACACC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:fdc8ccb53ac4
|
40 | — | — | — |
|
TAATTACACAATCACACCTCAACGTACTGATGGTCACACC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:68f9e4446fba
|
40 | — | — | — |
|
ATGTGCGAACATCATTTGCTAGGTGTGAACATGATCATCA
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:19b18e397115
|
40 | — | — | — |
|
CTGTAACAACATTCACACATATCGCACTTAAGCTGACACC
PANAPTA:Q9UL17:TBX21_VAX1:PRJEB66722:R3:8f7bcd636186
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final