ZKSCAN4

SELEX selection target

Organism
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R1,R4
Selection-pool candidates
10,000

Top enriched selection-pool candidates

Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.

Candidate data via API →
Candidate sequence Length log2 FC Class Monotonicity
GCATAAGTATATCCCAAATATTGCATGGGATATACTTATACTAAATATT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:bfe64fec4813
49 19.96 strong_positive 1.00
TTAGTATAAGTATGTCCCATGTGACATTTGAGACATACTTATGTT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:f35274202369
45 18.79 strong_positive 1.00
GCATAAGTATATCCCAAATATTGCATGGGATATACTTATAC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:62a1606f9417
41 16.27 strong_positive 1.00
GTATAAGTATATCCCAAATATTGCATGGGATATACTTATAC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:37f0e7582b89
41 15.46 strong_positive 1.00
GATCTTACCTTTGGGCTATACTTATGCTTACTCAGT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:b28a37e40151
36 15.30 strong_positive 1.00
ATAAGTATGTCCCAAATATTGCATGGGATATACTTAT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:2dddb2a3bff0
37 15.08 strong_positive 1.00
TAAGTATATCCCAAATAGTTCTCGGGCTATACTTATGCTACAAGTTTGTT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:bc3221492ffe
50 14.99 strong_positive 1.00
GTATAAGTATATCCCATGCAATGTTTGGGGCAT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:a03bad96f180
33 14.82 strong_positive 1.00
ATAAGTATATCCCAAATAGTTCTCGGGCTATACTTATGCTACAAGTTTGTT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:0c2a702f923c
51 14.60 strong_positive 1.00
GCATAAGTATATCCCACATATTAGCATAAGTATATCCCACATAT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:e6854ce1187c
44 14.32 strong_positive 1.00
TACGTTTTTAGTATAAGTATATCCCAAATACTGCATGGGATAGACTTTTAT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:223dcaed5e48
51 14.32 strong_positive 1.00
ATGTGGGATATACTTATGCTAATATGTGGGATATACTTATGCTAATATG
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:01a4a73eaf70
49 14.12 strong_positive 1.00
GTATAAGTATATCCCATGCAAGATCTGGGACACACTTGTGC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:511f813525f2
41 14.03 strong_positive 1.00
GTATAAGTATATCCCAAATATTGCATGGGATATACTTATACTAAATATT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:ecaeaf9bc5d9
49 13.98 strong_positive 1.00
GTATGCCCCCAAATCGTGCATGGGATATACTTACACT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:eff40aacdf74
37 13.91 strong_positive 1.00
ATAAGTATATCCCAAATAGTGCATGGGATATACTTATACTAAATATT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:5e338fc98ac5
47 13.82 strong_positive 1.00
ACACAGTGGATAGACTTTCAGTGTAAGTATATCCCAAATAC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:5e5c2413ecf1
41 13.74 strong_positive 1.00
ATTTTTAGCATAAGTATATCCCACATATTAGCATAAGTATATCCCACATATCACACAGAT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:991569862b99
60 13.66 strong_positive 1.00
ATAAGTATATCCCAAATATTGCATGGGATATACTTATACTAAATATT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:a4b924a0f8e1
47 13.61 strong_positive 1.00
AGTGTAAGTATATCCCAAATGTTGCATGAGATGTACTTATGCAA
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:db8018be021d
44 13.57 strong_positive 1.00
ATAAGTATATCCCACATATTAGCATAAGTATATCCCACATATCAC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:1b07d869f44e
45 13.48 strong_positive 1.00
ATTGTGGCAAGTAACACAAATGGGCTATACTTATGCTG
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:a1ef56d59839
38 13.44 strong_positive 1.00
GGGCTGGGCTATACTGGGCTTAGCTGGGCTGGGCTGAGCTGAGA
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:d540e0d85cdb
44 13.41 strong_positive 1.00
GCATAAGTATATCCCACATATTAGCATAAGTATATCCCAC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:80de62cf21a4
40 13.33 strong_positive 1.00
TATGCCACAAATATTTTTAACATAAGTATATCCCATGCAACGT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:c053ba310226
43 13.31 strong_positive 1.00
GTGTGATATGTGGGATATACTTATGCTAATATGTGGGATATACTTAT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:037768f9cbf5
47 13.28 strong_positive 1.00
ATGGAATGGTATGGAATGGGATATACTCGAATTGTATGGAATGGAAT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:7d40a5e43e20
47 13.20 strong_positive 1.00
GGGCTGGGCTATACTGGGCTTAGCTGGGCTGGGCTGAGC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:e844771d2606
39 13.18 strong_positive 1.00
ATTGTGGCAAGTAACACAAATGGGCTATACTTATGCGG
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:baeb3064e72a
38 13.18 strong_positive 1.00
ATAAGTATATCCCAAATAGTGCATGGGATATACTTATAC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:5b4f374491d8
39 12.99 strong_positive 1.00
TGCTTAGCTGGGCTGGGCTATACTGGGCTTAGCTGGGCTGGGCTGAGC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:95548b91ce7e
48 12.98 strong_positive 1.00
ATAAGTATATCCCACATATTAGCATAAGTATATCCCAC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:a7eb077489c8
38 12.94 strong_positive 1.00
TAGGCTGTGTGATATGTGGGATATACTTATGCTAATATG
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:d6dc5a12c83f
39 12.91 strong_positive 1.00
GTGTAAGTATATCCCATGAAATAGTTGGGATAAACTTACAC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:d5d6ec4b4806
41 12.89 strong_positive 1.00
AGTATATCCCAAGAATTGCATGGGATATACTTACGCCAAGCCGTGAT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:5fc6afc33603
47 12.87 strong_positive 1.00
AGCTAAGCCCAGTATAGCCCAGCCCAGCTAAGCATAGTTCAGCAC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:74ae95a141ae
45 12.84 strong_positive 1.00
GCATAAGTATATCCCAAATATTGCATGGGATATACTTAT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:793df3ba75ae
39 12.81 strong_positive 1.00
ATTTTTAGCATAAGTATATCCCACATATTAGCATAAGTATATCCCACATATCACACAGC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:196ed956a0aa
59 12.78 strong_positive 1.00
ACTATGCTTAGCTGGGCTGGGCTATACTGGGCTTAGCTGGGCTGGGCTGAGC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:13a86c8fcc42
52 12.73 strong_positive 1.00
ACTATGCTTAGCTGGGCTGGGCTATACTGGGCTTAGC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:6539ca597c54
37 12.67 strong_positive 1.00
AATTTTTAGCATAAGTATATCCCACATATTAGCATAAGTATATCCCACAT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:80599ce1a4e3
50 12.60 strong_positive 1.00
GGGAAACATGGTAAGACAAGTATATCCCATGAGC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:ede1f6599d14
34 12.56 strong_positive 1.00
GCATAAGTATATCCCAAATATTGCATGGGATATACTTATACTAAATAGT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:e1ffcb92ce87
49 12.53 strong_positive 1.00
CAGTATAGCCCAGCCCAGCTAAGCATAGTTCAGCAC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:fdce11d2d9c7
36 12.53 strong_positive 1.00
ATAAGTATATCCCAAATATTGCATGGGATATACTTATAC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:a5bebee362aa
39 12.52 strong_positive 1.00
CGTTCCCTCTGCCACGCTCCCTCCTCAGTGTCACCACGGCCATCGTTCCCTCTGCCACG
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:1b0c1e89417b
59 12.47 strong_positive 1.00
ATTTCAAATAAACAACACAATTTTTAGCATAAGTATATCCCAC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:f387805af9d0
43 12.36 strong_positive 1.00
TCCCAAATAGTTCTCGGGCTATACTTATGCTACAAGTTTGT
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:709d74ce89a2
41 12.34 strong_positive 1.00
TGCTTAGCTGGGCTGGGCTATACTGGGCTTAGC
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:d4d8d144c8b2
33 12.32 strong_positive 1.00
CAACACAATTTTTAGCATAAGTATATCCCACATATTAGCATAAGTATATCCCACATATCA
PANAPTA:Q969J2:ZKSCAN4:PRJEB76622:R4:aa38650ebbe2
60 12.30 strong_positive 1.00

SELEX rounds

R1 R4 ·final

Structural & language-model features

JSON ↗

Pre-computed feature availability; artefacts are distributed through the canonical data bundle.

Residues
545
FASTA
ESM-2 mean
ESM-2 per-residue