ZNF888

Pre-clinical SELEX library

Organism
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R1,R4
Sequences indexed
10,000

Top enriched sequences

More via API →
Sequence Length log2 FC P(active) Class Monotonicity
ACGGTCACACAGATGCTCACATGGATGGTCACACT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:15a9897ebcf2
35 16.95 0.89 strong_positive 1.00
GTCACACAGATGCTCACATGGATGGTCACACT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:e0c9aaf14dde
32 16.72 0.42 strong_positive 1.00
CTCACACGGACGGTCACACGGATGCTCACATGGATGGTCACACTCT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:d19c50004509
46 16.21 0.87 strong_positive 1.00
CCCTGCACCCCCAGGTGAGCAACTGAC
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:733a5594be35
27 16.12 0.87 strong_positive 1.00
GCAGCACACACTCCCACGGGACAGCACACAGCCC
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:71718f32aa00
34 15.55 0.90 strong_positive 1.00
ACCCACGGAACGGCACACACTCCCACGGAACAGCAGACTCT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:fbe68b9880cf
41 15.38 0.89 strong_positive 1.00
TCACACTCTCACACGGATGGTCACA
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:9653bca9e5d8
25 15.19 0.87 strong_positive 1.00
GTTGAGAGGAGCAGCACACACTCCCACGGGACAGCACACAGCCC
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:b1c59523f426
44 14.90 0.39 strong_positive 1.00
GTCACACGGATGCTCACATGGATGGTCACACTCACACGGATGGTCACA
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:0f36ee1ab8ca
48 14.76 0.39 strong_positive 1.00
CCGCGCCCACACATCCTCCACCGGCCGCGCCCTCACGTCCT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:d4d5b8cc4332
41 14.48 0.89 strong_positive 1.00
ATGGATGGTCACACTCACACGGACGGTCACACGCTCACACGGACGCT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:782fabdf24a7
47 14.36 0.42 strong_positive 1.00
ACACACTCCCACGGAACAGCACACACACCCACGGAACGGCACACACT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:d99ad9855cd8
47 14.33 0.90 strong_positive 1.00
CCATCACCTACAACCCCATCCCCATCTCCATCA
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:c461ae5c23da
33 14.27 0.88 strong_positive 1.00
CCGCGCCCACACATCCTCCACCGGCCGCGCCCACACG
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:720e98d53a33
37 14.16 0.89 strong_positive 1.00
CACACTCCCACGGGACAGCACACAGCCCCCCACGGAACGGCACACACA
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:f67c440abbbb
48 14.11 0.89 strong_positive 1.00
CTCCCACGAACAGCACACACACTCCCACGAACAGCACACACACT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:68870502652e
44 14.09 0.87 strong_positive 1.00
ACGGACGGTCACACAGATGCTCACATGGATGGTCACACT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:de170008553c
39 14.03 0.89 strong_positive 1.00
CCGCGCCCACACATCCTCCACCGGCCGCGCCCACACGA
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:4dd6238fc7cb
38 13.88 0.89 strong_positive 1.00
GTCACACGGATGCTCACATGGATGGTCACACT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:7b978f687931
32 13.80 0.41 strong_positive 1.00
TCTCACGGACGGTCACACGCTCACACGGACGCT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:aa68f2eabe98
33 13.71 0.41 strong_positive 1.00
ATATAATCTCACATTTGCCCCTCCCC
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:c1bb431d6bb3
26 13.70 0.39 strong_positive 1.00
ACTCACACGGACGGTCACACGCTCACACGGACGCT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:4eaf13f9b712
35 13.57 0.49 strong_positive 1.00
GGGGCTGGGTGGATGGGGCTGGCTGGGTGGATGGGGCTG
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:cd1bb7583ad2
39 13.53 0.86 strong_positive 1.00
CACACAGATGCTCACATGGATGGTCACACT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:50adca54375a
30 13.45 0.89 strong_positive 1.00
GCACAGGGACACACGCACACACGTGCACACACGCAAACACGCA
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:638979273bc7
43 13.40 0.91 strong_positive 1.00
CTTTTCCCCACTCCCCTCCCCCCGTCTGTCTCTGCGTGG
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:308f4ecffcf0
39 13.36 0.37 strong_positive 1.00
ACACCTACCACCACCTCCCCTGCCCCTCCCTGACCATCCTTCCACCCATC
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:3d701ed2cbc5
50 13.36 0.87 strong_positive 1.00
CTCCGCCTCCCGTCACAGCATTACCGTGTGAGCTCCGC
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:eafe42a04e7b
38 13.20 0.38 strong_positive 1.00
TGCACATACACACATACCTCGCATCTGTGTCATACACCCTTGT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:fca81f608926
43 12.92 0.83 strong_positive 1.00
CTTCCTTCAGATAAACTCACCTGTCACCACGTGGACCCTT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:c19ee8db96cb
40 12.83 0.36 strong_positive 1.00
CTCTCCACAGCAGCCAGGGTGCCAGGCAACCACTTAGTTACACCATG
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:3691bf7a0539
47 12.80 0.39 strong_positive 1.00
GTATCCTTTGCCCTCAGGCTTCTGCGCTTGGTGGTG
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:ac6e9c63e934
36 12.76 0.36 strong_positive 1.00
CACACACCCACGGAACGGCACACACTCCCACGGAACAGCAGACTCT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:9eef36082a52
46 12.66 0.89 strong_positive 1.00
TCCTCCTTCTTCTCCCACTGCCTCCGCCCATTCCCTCGCC
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:7668102d7768
40 12.62 0.76 strong_positive 1.00
ACACACACCCACGGAACGGCACACACA
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:5e1ff8f1f74b
27 12.62 0.90 strong_positive 1.00
CTCACACGGACGGTCACACGGATGCTCACACGCT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:b95738ecc3b2
34 12.59 0.87 strong_positive 1.00
ACGGAACGGCACACACTCCCACGGAACAGCAGACTCT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:f0553903811a
37 12.59 0.89 strong_positive 1.00
TCACACGGACGGTCACACAGATGCTCACATGGATGGTCACA
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:892921f67779
41 12.59 0.88 strong_positive 1.00
GCGCTGTCTATCGTCGGTGGTGGGGCGGGAGGCAGG
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:498bd623ced2
36 12.55 0.85 strong_positive 1.00
ACACCCCATGAACAAGCACACACACACACACGCATAACACGCGC
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:19c7f502f54e
44 12.55 0.91 strong_positive 1.00
ACACGGACGGTCACACGCTCACGGATGCT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:fa0c102288d7
29 12.51 0.89 strong_positive 1.00
ACCTCCAGCCAGCACCATGTTCCAGCTCAGCTTACCCAAGGCCCCT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:156334728dda
46 12.47 0.87 strong_positive 1.00
CACACTCCCACGGGACAGCACACAGCCC
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:c6c1b5e4ef64
28 12.47 0.89 strong_positive 1.00
GATCTCCAGACATCTCCCCAGCCCCAACTCCTTCACGGTCACC
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:fe049890a132
43 12.47 0.37 strong_positive 1.00
GTCACACGGATGCTCACACGGACGGTCACACGGATGCTCACACGCT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:0d72a8369a64
46 12.43 0.40 strong_positive 1.00
CACACGGATGCTCAAATGGATGGTCACACTCTCACACGGATGGTCACA
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:f6a4491ef83c
48 12.43 0.88 strong_positive 1.00
ATACACACACACACACATACGGCTC
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:fbeb9c05eeb5
25 12.43 0.88 strong_positive 1.00
ACACACCCACGGAACGGCACACACTCCCACGGAACAGCAGACTCT
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:c09f83afb4cc
45 12.34 0.89 strong_positive 1.00
CCACCCACCTCAATCCTCAGCCTCTCCC
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:972ecfb94fcb
28 12.29 0.88 strong_positive 1.00
GCTCACATGGATGGTCACACTCACACGGATGGTCACA
PANAPTA:P0CJ79:ZNF888:PRJEB76622:R4:977b48f377d8
37 12.29 0.41 strong_positive 1.00

SELEX rounds

R1 R4 ·final

Structural & language-model features

JSON ↗

Pre-computed feature catalog (paths only — files served separately).

Residues
718
FASTA
ESM-2 mean
ESM-2 per-residue