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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502311

DNAFOXR05

Reads
489,480
Distinct strings in file
485,680
File size
5.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502311
Sample:
SAMEA113565953
SHA-256
e91df7302ec5b513a5b7acd56f9ff1bbfa492599ed0ae3264d08d2b01b12cb2f

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAAGTGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTTTTTTTTTTGTTTTCTTTTTGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06
AAAAGTGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTATATTATAGTTGATTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTGGGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTGTTTGTTTATTTGTTTATTTATGATGCGGAATTAAGT12.04298e-06
AAAAGTGGGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTGCACTTAAACATTACCCCATCAATGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTGGTCCAGATCAGTTCAGCGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTTTTTTTTTATTATGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06
AAAAGTGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTGTTTGTTTATTGTTGTGTTTACGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGCATTTGTTTGTTTGTTTATTTTATGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATTTGTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTCTGTTTGTTTGTTAGTTTGTTAATGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGTTATTTGTTTTTGTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTGTCACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTTGTTATCTTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTTTATTTTTTTGTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTGTGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTCGGTTTTGTTTGTTTGTTTATTTTAGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTGTGTTTGTTTGTTTATTTTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTGTTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTATTTTTTGTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTTACACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTGTTTGATTGTTTATTTGTGATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTTAGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCTGTTTATGTTTTTGTGTTTATTTTTGATGCTGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTTATACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTGTTTGTTTATTTTTTGATGCGGAATTAGTG12.04298e-06
AAAAGTTATCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTGTTTATTTGTGGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTTCGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTTCTTTTATTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTTGACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATTTTTTTTTTGTTTCTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTTGAGCAGATCAGTACAGAGGATCGTGTCTTGATGGTTTGTTTATTTATTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTTGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATGTTTTTATTGTTTGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTTGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTTGTTTTTTCTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAG12.04298e-06
AAAAGTTGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTAATTCTTTATGTTTGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.