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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502311

DNAFOXR05

Reads
489,480
Distinct strings in file
485,680
File size
5.6 MiB
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502311
Sample:
SAMEA113565953
SHA-256
e91df7302ec5b513a5b7acd56f9ff1bbfa492599ed0ae3264d08d2b01b12cb2f

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAAGTTGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTCTTTTTTGGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTTTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTATTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06
AAAAGTTTCTCAGATCAGTTCACGGATCGTGTCTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTAATGTTGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06
AAAAGTTTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTGTTTGTCTATGTTTCCGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAAGTTTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTTTTTTTGTTTATGTTTTGATGCGGAATTAAGTG12.04298e-06
AAAAGTTTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTATTTATTTTAATAGTGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06
AAAAGTTTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTGTTTTTATGTTATTATGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATAAATCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTTTCGAGATGCGGAATTCAG12.04298e-06
AAAATAACCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTATTTTGTTTTATTTATGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATAAGTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTAGTGTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGATGCGGAATCAGTG12.04298e-06
AAAATAATCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTGTTTTTGTTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATAATTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATACAACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCCTTGTTTATGTTTATTTGTTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATACATCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTATGTTTTTTGTTTGTTTGTCGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATACCCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTTTTTGTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATACGACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTGTTTGTTTATTCTTTCTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATACGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTCACTTTTTGTATGATTGTTTATTTTGATTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATACGCTCAGATCAGTTCAGCGGAACGTGTCTTGTTAATGTTTTTTTTTTGTTGTGATCCGGAATTCAGTGCA12.04298e-06
AAAATACGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTATTTGTTTGTTAATTTTTTTCGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATACTACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAACTCTAGCGCACGGAACACCCACCAGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATACTAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGGTGTTGTGTTGTTCGATCATTAGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATACTATCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTGTTGTTTGTTTTGTTTTTATTTGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06
AAAATACTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTATTTTTTTGTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATACTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTTTTGTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATACTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTGTTTTTGTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.