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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502311

DNAFOXR05

Reads
489,480
Distinct strings in file
485,680
File size
5.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502311
Sample:
SAMEA113565953
SHA-256
e91df7302ec5b513a5b7acd56f9ff1bbfa492599ed0ae3264d08d2b01b12cb2f

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAATTAACGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTTGTTTATTTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTACACCAGGTCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTACTTCAGATCAGTTCAGCGGACGTGTCTTATAAAACAAACAATAAACAAACAAAGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06
AAAATTATCGCATATAACTTCAGAGTAACCTCACTAAAAACTTACTTTATTAATTAATCATAATAAAAAATTCATA12.04298e-06
AAAATTCAAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTATTTTGTTTTTTGTTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTCACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTGTTTATTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTGC12.04298e-06
AAAATTCACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTACCAAAAACAAAAAAAACAACAAACGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06
AAAATTCCTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCCTTAAAATAACCAAACAAACATAAGGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTCGCACAAATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTAGTTTGTTTTTTGTTGTATTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTCGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTGTTTTTGTTTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTCGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTGTTTATTTTTTCCATGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTCGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTGTTATTTTTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTCGTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTACTTGTTTATTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTCTACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06
AAAATTCTCGCAGACCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06
AAAATTCTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAATATTTGTTTATTTGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTCTTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTGTTTTTTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTGACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTAGGTTATTTATGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTGATTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTATTTATTTTTTGTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTGCATCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTGTTTATTATTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTGCCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAATAAAAACAAAACAAACAAACAAAAGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTGCTCCAGATCAGTTCAGCGATCGTGTCTTTGTTATTGTTTAGATTATAAATATTGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06
AAAATTGCTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCTTTGTTTGTTTGTTGTTTCTATTTGGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTGCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTGTTTGTTTATTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTGGAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGCTTTTTTTGTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.