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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502311

DNAFOXR05

Reads
489,480
Distinct strings in file
485,680
File size
5.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502311
Sample:
SAMEA113565953
SHA-256
e91df7302ec5b513a5b7acd56f9ff1bbfa492599ed0ae3264d08d2b01b12cb2f

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAATTGGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGACTCTTAATATTAGTAAATGTTTTTCTTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTGGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTGTTTTGTGTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGGTTTACTTTTGTTTTGTTTATCTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTAGATTGTTTATTGTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATCCCACCGCCCAAACTCCCACCACGGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCTGTTTGTTTATTTGTTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAG12.04298e-06
AAAATTGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTTTTTTTTTATCTGTTGATGCGGAATTCAG12.04298e-06
AAAATTGTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTTTTCCTATTGTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTTAAGCATATCAGTAAACAGCATCCATTCAACTTTAATACATTAAAGATTTCCTCACAAAACGAATTCACA12.04298e-06
AAAATTTACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATAAATATTTTTGTTTGTTTTGATGCGGAATACAGT12.04298e-06
AAAATTTAGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTCATTTGTTTGATTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTTAGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTTTATTTTTCTTTTCGTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTTAGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTGTTTGTTTATTTAATTTGTTTTGGTGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTTCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTGTTTATTTGTTTTGGTTTATGATGCGGAATTC12.04298e-06
AAAATTTGAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGGGGTGGGGGAGTGGCGGGAGGGAGCGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTTGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTATGTTGTTTATTTTTATTTATTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTTGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTTTGTTTTATTTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTTGCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06
AAAATTTGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTGATTTTATTTTTGTTTATGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTTTAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTATTTTTATTTGTTTGTTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTTTCCCAGATCAGTTCGCGGATCGTGTCTACTTTGATTAACATGTTTATGTATTGGAAGCGGAATTAAGTG12.04298e-06
AAAATTTTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATTTGTTTATGTTTTGGTGATGCGGAATTCAGT12.04298e-06
AAAATTTTCGCGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTACCAAAAAATAACCAATGTAAACAAAGAAGCGCAATTAAGAG12.04298e-06
AAAATTTTGACAGATCAGTTCAGCGATCGAGTCATGTGTTTTTGTTTTCGTTTTTTTGTAGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06
AAAATTTTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTATTTTTTTGTTTGGATGCGGAATTCAGTG12.04298e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.