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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502312

DNAFOXR06

Reads
518,557
Distinct strings in file
514,634
File size
5.8 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502312
Sample:
SAMEA113565954
SHA-256
d01fc6ebfc55dba81f5feab73302a5aee0da227604c7c8d456974398036ef260

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAATTCAAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTATTTTTGTAGTTGTTTATGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTCAAGCATATCAGTAAAATCCTAAATACTCAGTAATGAAAATTAATCATTTCTTATAAAATCGAAATTCAA11.92843e-06
AAAATTCACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTAAGTG11.92843e-06
AAAATTCATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGAGTTTATATTATTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTCCCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTCTTTTTGTTTTTGTTTATTTACTGATGCGGAATTCAGTGC11.92843e-06
AAAATTCCGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTGTTTGTTTGTTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTCCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTTGTTTATTTTTTTTATTTTGATGCGGAATTCAG11.92843e-06
AAAATTCCTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGTTTTTTTATTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTCGACAGATCAGTTCGGATCGTGTCTTTGTTATTGTTTATTTACTGTTTGTTGATGCGGAATTCGGTGCAA11.92843e-06
AAAATTCGACCAGATCAGTCGCGGATCGTGTCTTGTTGTTTGTTGTTTTGTTTGTTAATGATGCGGAATTCAGTGC11.92843e-06
AAAATTCGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGCGTCTACAAAAACAAACAAACAAACAAACACGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTCGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTACTTTTTCTGCCTCTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTCGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTTGTTTGTTTATTCTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTCGTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATATTATTTTGTTTTTGTTTTGATACGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTCTAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAG11.92843e-06
AAAATTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTATTATTGTTTTTGTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTGC11.92843e-06
AAAATTCTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTTTTAACTTTGTTTTGATGCGGAATTCAG23.85686e-06
AAAATTCTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTTCTTTTTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGTGC11.92843e-06
AAAATTCTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTAATTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGAAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGGGTATTTTTGTTTGATTGTTGTTTTAAGATTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGACACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTGTTTTTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGACTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTGTTTATTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGCATCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTTAGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAG11.92843e-06
AAAATTGCGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATGTTATTTTATTTATTGTTTTTATTGGTGCGGAATTCAGT11.92843e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.