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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502312

DNAFOXR06

Reads
518,557
Distinct strings in file
514,634
File size
5.8 MiB
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502312
Sample:
SAMEA113565954
SHA-256
d01fc6ebfc55dba81f5feab73302a5aee0da227604c7c8d456974398036ef260

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAATTGCTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTGTTTATCTGTTATTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCTTGTTTACTTTTTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGCTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCAACCAACCCCCCCAACCACGCCCGAGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTTATTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGGCCCAGATCAGTTCAGCGTATCGTGTCTTATTGTTTATTTGTTTTTGTTTATTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTGTGTTTGTTTTTTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGGCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTGTTTGATTTTTTTTTTGTTTGTAACCGCAATTAGGGC11.92843e-06
AAAATTGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTTGTTATGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGGTCCAGATCAGTTCGCGGATCGTGTCTAAACAAAAACATAAATAAACAACCACGATGCGGAATTCAGTG11.92843e-06
AAAATTGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTATATTTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATATTTTTTATTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGTCTCAGATCAGTTCAGCGGACCGTGTCTTTTGTTTATGTTTATTTGTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATTTTTGTGTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTGTTTGTTTATATGGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTATTTTTGTTTATATTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTGTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTTTGTTTATTATTTATTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTTAACCATATCAGTAAACAGCATCTTCTCAAATTCATTAATTTAGTAAATTTTATTCAAAACGATTTCACA11.92843e-06
AAAATTTAGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATGTTTTTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTTATCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCCCCGCACACCCCCTAACACAACCAAGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTTCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAATTGTTTTTCTTTGTTTATTTATTGATGCCGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTTCGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTGTTTATTTTTTTGTTTAGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTTGCAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTGTTGTTTTTTTATTGATGCGGAATTCAG11.92843e-06
AAAATTTGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTGTTTATATTTCTTCTGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06
AAAATTTGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTTTTGTTTATTATTGATGCGGAATTAAGTG11.92843e-06
AAAATTTGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAGAAAACAAAAAAACAAACAAACAAAGATGCGGAATTCAGT11.92843e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.