These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.
ERR11502312
DNAFOXR06
- Reads
- 518,557
- Distinct strings in file
- 514,634
- File size
- 5.8 MiB
Source attribution · SHA-256
- Source project:
- PRJEB62756
- Archive record:
- ERR11502312
- Sample:
- SAMEA113565954
- SHA-256
- d01fc6ebfc55dba81f5feab73302a5aee0da227604c7c8d456974398036ef260
Exact read query
Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.
| Sequence | Count | Read fraction |
|---|---|---|
| AAAATTGCTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTGTTTATCTGTTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTGCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCTTGTTTACTTTTTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTGCTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCAACCAACCCCCCCAACCACGCCCGAGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTGGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTATTTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTGGCCCAGATCAGTTCAGCGTATCGTGTCTTATTGTTTATTTGTTTTTGTTTATTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTGGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTGTGTTTGTTTTTTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTGGCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTGTTTGATTTTTTTTTTGTTTGTAACCGCAATTAGGGC | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTTGTTATGTTTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTGGTCCAGATCAGTTCGCGGATCGTGTCTAAACAAAAACATAAATAAACAACCACGATGCGGAATTCAGTG | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTATATTTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATATTTTTTATTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTGTCTCAGATCAGTTCAGCGGACCGTGTCTTTTGTTTATGTTTATTTGTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTGTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATTTTTGTGTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTGTTTGTTTATATGGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTATTTTTGTTTATATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTGTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTTTGTTTATTATTTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTTAACCATATCAGTAAACAGCATCTTCTCAAATTCATTAATTTAGTAAATTTTATTCAAAACGATTTCACA | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTTAGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATGTTTTTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTTATCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCCCCGCACACCCCCTAACACAACCAAGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTTCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAATTGTTTTTCTTTGTTTATTTATTGATGCCGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTTCGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTGTTTATTTTTTTGTTTAGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTTGCAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTGTTGTTTTTTTATTGATGCGGAATTCAG | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTTGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTGTTTATATTTCTTCTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTTGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTTTTGTTTATTATTGATGCGGAATTAAGTG | 1 | 1.92843e-06 |
| AAAATTTGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAGAAAACAAAAAAACAAACAAACAAAGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.92843e-06 |
Read fractions use all reads in this source file as the denominator.