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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACAACCCTCAGATCAGTTCAGCGGATGTGTCTTGTTTGTTTATGTTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACAACCGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAACAATAAAAAATAAACAACAACAAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACCGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGTTTATTGGTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACCGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTATTTATTTATGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACCTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTTTGTTTGTTTATTTATTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTGCA11.68957e-06
AAACAACCTGCAGATCAGTCCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACCTGCAGATCAGTTCAGAGGATCGTGTCTTGTTAATTTATTGTTATTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCCTGTATATTGATTATTTATTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTCTTGATTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACCTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTAGTTTTGTTTGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACGAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCAAAAAATAAACAAACAAACAAAACCGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACGAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATGTTTACATTTTTTGTTTATTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACGAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTATTTAGTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACGAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGTTTATTGTTTATATTTTGATGCGGAACTCAGT11.68957e-06
AAACAACGAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTGTTTATTGTTATTTCTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACGATCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTTTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACGCCCAGATCAGTTCAGCGATCGTGTCTTTTGTTTATTTGTTTTCTTATCTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACAACGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATATAAACAATAAACAATTAGGTAATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTACTTTTTAGTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACGCCCAGATCAGTTCAGCNGATCGTGTCTATATAAACAATAAACAATTAGGTAATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTGTTTGTTTATATTATTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACGCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGAGACTATTGATTATTGTTATTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACAACGCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTGTTTATTGTTTTTTTCTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACGCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTTATTTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACGCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTTTGTTTATTTACAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.