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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACAACACGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTGTTTTTGTTTATGTTTCTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACACGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTATTTATGTTTATATTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACAACACTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTCTTTGTTTATGTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACAGCCAGATCAGTTCAGAGGATCGTGTCTTTTGATTATGTTTATGTTAGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACAGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTTTTTTTTTGGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAACAACAGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTCTATTGTTTGTTTTTGTTTTCTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACAGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTAATCTTATTTTGAGTAAATATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACAGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTAATTTTTTTTTTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAACAACAGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTATTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACAACAGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTTGTTTATTTTTTTGTTTAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACAGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTATTTTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACATCCAGATCAGTTCAGAGGATCGTGTCTAGTTTAAGCTTACTTTTATTGTTTTGGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACATCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAAATAAACAAACAAAAAAACAATACAGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAACAACATCCAGATCAGTTCGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATTTGTTTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACAACATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTCTTTCTTTGTTTATTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACATTCAGATCAGTTCAGCGATCGTGTCTTTAGTATTTGTTAATTGTTTATTATTGATGCGGAATTAAGTG11.68957e-06
AAACAACCACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTACTTTTGTTTGTTTATATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACCAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTTGTTTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACCCACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTAATTCTTTACTGTTTACTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACCCCCAGATCAGTTCAGCGGAACGTGTCTTGTTTATTGTTTATTAGTTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTGTTTGTTTGTTTATTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGGTTTTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACCCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTACGTTATGTTTGTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAACCCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTCTTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.