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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACAGGGTTCAGATCAGTTCAGCGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACAGGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAACAAAGAAATAAACAAACAAACAAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTGGATGTTTATTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGTGC11.68957e-06
AAACAGGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTCTTTTTTGTTTTTATTTTGATGCGGAATCCAGT11.68957e-06
AAACAGGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTATTGTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATGTGTCTTGTTTATTTTTGGTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACAGGTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTACTTATTTTTGTTTGTTTATAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGTCTCAGATCAGTTCAGCGGATGTGTCTGTTTGTTTATTGTTTTTATTTCTAACGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACAGGTGCCAGATCAGTTCAGCGGATGTGTCTTTTGTTTATATTTTTTGTTTTCTATTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACAGGTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTAGTCTTCTATTTTTTTGTAAATATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTCTTGTTTGTTTGTTTATTTTTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATGTTTTTTTTGGGTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGGTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATATTTATTGTTATTGTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTACGCAGATCAGTTCAGAGGAGCGTGTCTTTTTTATTGATTTTTAATTATTTATAGTTGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTACGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTCTTTTGTTGTTTATGATGCGGAATTCATGC11.68957e-06
AAACAGTACGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTAGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTATCTATTCTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTAATTGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTCCACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTACTTTGGGTTGTTATTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGATTTTGTTATTGTTTATTGTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTATTTATGTTTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTCCGCAGATCAGTTCAGCATCGTGTCTTGTTTATGTTTTTTTGTTTTTATTTGGATGCGGGATTCAGTGC11.68957e-06
AAACAGTCCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTAGTTTACATTATTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTCCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTAAACATTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.