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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACAGTCTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAACATACAAACAGAACAAACAAACAGGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTGTTTATTTATTGTGTTATGATGCGGAATTCAGT23.37914e-06
AAACAGTGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCGGCGGCGGGGGGGGCGGCCCGCGCGGCGGGGCGCCCGGCAGG11.68957e-06
AAACAGTGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGATTATTGTTTATTTAGTATGTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTATTTTTTTGTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATATTTCATTGTTTATTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTGTGGTTTGTTTATAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTTAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTGTTTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTTATCAGATCAGTTCAGCGGTCGTGTGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTGTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACAGTTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCCTCACCACGCCCACCACCCACCATAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATTGTTTTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTTGGCAGATCATTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTGTTTTTTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGTGCA11.68957e-06
AAACAGTTGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTATTTATGTTTGTTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTTGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTGGGGGGTGGGAGTGGGATAAAGGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTTTATTTTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATTTATACTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACAGTTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTGTTTATTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATAACCCAGATCAGATCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATGTTTTTTTTTTTTTTATTTTGATGCGGAATTC11.68957e-06
AAACATAACGCAGATCAGTTCAGCGGATACTGTCTAATGATTAAGTGTTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATAAGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTTTTTTTGTTGTTGATGCGGAATTCAGTGC11.68957e-06
AAACATACAACAGATCAGTTCAGCGGACGTGTCTTGTTTGTTTGTTTTAATTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACATAGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATAGCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATTCATTTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATAGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTACTGTTTGTTTTGTCAATATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACATATATCAGATCAGTTCATCGTAACGTGTCTGTGTTTATTGTTCTTGATTGTTTAAATATGCGGAATTCATT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.